最早論述丹田這一部位功能特點(diǎn)的文獻(xiàn)為《難經(jīng)·六十六難》：“臍下腎間動(dòng)氣者，人之性命也。十二經(jīng)之根本也?！睏钚僮ⅲ骸澳毾履I間動(dòng)氣者，丹田也。丹田者，人之根本也?！?
　　丹田一詞如果不加特別說明，一般多指臍部下丹田而言。此地有田有土，內(nèi)煉時(shí)“意守丹田”，收功時(shí)“氣沉丹田”，即可培土發(fā)芽，日久功深，必開花結(jié)果。
　　丹田有三處。上丹田重在神，中丹田重在氣，下丹田重在精。《鐘呂傳道集》曰：“丹田有三，上田神舍，中田氣府，下田精區(qū)。精中生氣，氣在中丹；氣中生神，神在上丹；真水真氣，合而成精，精在下丹。”
　　仙道丹家內(nèi)煉的三個(gè)基本階段，初關(guān)煉精化氣，中關(guān)煉氣化神，上關(guān)煉神返虛，分別在人身小天地之三個(gè)處所進(jìn)行。下丹田為人手煉精化氣之地；中丹田是著手煉氣化神，孕育仙胎之所；上丹田乃了手“泥丸養(yǎng)嬰”，煉神返虛之處。三關(guān)九竅中的上丹田為心源性海之竅——天谷、泥丸；中丹田是黃中正位之竅——夾脊、雙關(guān)；下丹田名關(guān)元?dú)夂Ｖ[——尾閭、太玄。
　　
　　下丹田覓真
　　
　　下丹田是具體部位、形態(tài)，從來爭(zhēng)議較大。由于修習(xí)者各自根器的不同，所契入的功境亦有差異，加之修煉時(shí)指導(dǎo)思想上的區(qū)別，所感受到的各自丹田的具體部位和形態(tài)很不一致，這也是自然不過的，不必強(qiáng)求統(tǒng)一。例如丹田是平面或是球體?輪廓尺寸是一寸二寸或是三寸四寸?這些都視練功者的主觀意愿而定。你認(rèn)為它是三寸大一塊田而意守之，它就是平面；你認(rèn)為它是四寸大直徑的一個(gè)球體而意守之，它就是立體。丹田、經(jīng)絡(luò)、穴位，是虛在的功能結(jié)構(gòu)，有一定自由度，“人天相應(yīng)”，隨著練功的進(jìn)展都會(huì)有所變化——甚至隨著練功地域的變換(從南方到北方)，都可能發(fā)生某些“飄移”。至于下丹田的定位，歷來有在臍下一寸三分，乃至三寸四寸之說，或三橫指四橫指之謂；亦有言臍下實(shí)為臍內(nèi)之意等等說法。趙鼎臺(tái)《脈望》曰：“臍下一寸三分者，謂仰臥而取之，入里一寸三分為是，即腎前也?！庇衷疲骸霸?dú)鈴臍庋ㄖ猩桑瑥碾p腎間縷縷透出?！?
　　肚臍，在嬰兒胚胎時(shí)期，與母體相連吸取母體精髓而生長(zhǎng)發(fā)育，它是人體生長(zhǎng)發(fā)育的中心，又是中醫(yī)學(xué)的中焦?fàn)I氣與下焦衛(wèi)氣的分界點(diǎn)；二氣同源(都來自水谷精微)異流，營(yíng)行脈中而榮五臟六腑，衛(wèi)行脈外以抵御外邪入侵。
　　現(xiàn)代生理學(xué)發(fā)現(xiàn)，人體內(nèi)分泌系統(tǒng)是人體生理的重要調(diào)節(jié)系統(tǒng)，它依靠腺體分泌激素來對(duì)人體功能進(jìn)行調(diào)節(jié)，已發(fā)現(xiàn)的人體內(nèi)分泌激素達(dá)54種之多。各種激素對(duì)人體的生長(zhǎng)、發(fā)育、免疫、生殖等生理過程密切相關(guān)，其中重要一類是生殖激素，而生殖激素的最重要部分為性激素——雄激素、雌激素、孕激素，故有人推測(cè)氣功學(xué)中的“精”，可能就是指激素而言，其中“順則凡”的“凡精”幾乎可以肯定就是性激素；“先天之精”則另當(dāng)別論?，F(xiàn)代生理學(xué)對(duì)這些五光十色的激素之秘密還遠(yuǎn)未弄得十分清楚。
　　分泌生殖激素的器官有腎臟 (腎上腺)、前列腺、精囊腺、睪丸(女子卵巢、子宮)等，它們都在肚臍附近。故不論從先天(胚胎)和后天(出生后)來說，肚臍都是人體機(jī)能的一個(gè)關(guān)鍵部位。
　　從深層次“功能結(jié)構(gòu)”及其氣化效應(yīng)來說，我們仰臥于床，呼出余氣，屏住呼吸，指腹按壓在臍部及其附近移動(dòng)體會(huì)，能夠清晰地找到這個(gè)“波源”——筆者多次體驗(yàn)，在臍左邊緣；另一只手的指頭扣住該手的寸口，便能體察到丹田波動(dòng)與心搏同步的實(shí)感——這就是你的下丹田中心。而含藏先天元?dú)?炁)的炁穴玄關(guān)，也在下丹田。
　　
　　中丹田探妙
　　
　　三處丹田各有其固有功能。上丹田在大腦內(nèi)，為高智慧之宮；下丹田在腹腔處，系生命動(dòng)力之源；中丹田則在人體中部、胸腔、心臟區(qū)域，為人體的思維意識(shí)中樞；同時(shí)也是人體生物鐘、壽命鐘、命運(yùn)鐘的掛靠之處。哺育仙胎的黃庭宮也在中丹田。
　　中丹田區(qū)域最重要的器官首推心臟，為身國君主“心主”的“龍床”?！靶闹魃衩鳌?、“心藏神(識(shí)神)”、“心之官則思”——人體的思維意識(shí)中樞。掛在這兒的生物鐘一旦停擺，心臟即停止跳動(dòng)，我們就壽終正寢。由此可見中丹田的重要性，非是一般。
　　性乃天道，神為人道——天道的代表。在天，性為體，主靜，神為用，主動(dòng)。在人，神為體，主靜，氣為用，主動(dòng)。陰陽不測(cè)、妙用無方、變化無窮的天命元神，為了運(yùn)轉(zhuǎn)人這個(gè)生命巨系統(tǒng)，便化形分身，派生出三萬六千神或十萬八千神來竹理大大小小的具各種功能的番類生理組織。現(xiàn)代生理學(xué)中相當(dāng)于生命之神功能的東西，叫做人體生物鐘、生命鐘，它獨(dú)立地控制著人體生命的進(jìn)程及命運(yùn)的展開，故而它也是命運(yùn)鐘、壽命鐘；而且各類細(xì)胞又有共各自的分生物鐘。有趣的是，現(xiàn)代科學(xué)發(fā)現(xiàn)，與生物鐘相關(guān)的人體遺傳基因有三萬余鐘，這與《黃庭經(jīng)》中的人體內(nèi)行三萬六千神之說可謂巧合。
　　人體生物鐘之神中有三位主管之神頗為重要，即舍于肝的陽神“魂”，主竹人體心理方面功能；住于肺的陰神“魄”，主竹人體生理方面功能。這兩位都是老黃牛，只筲默默工作，從不拋頭露面。喜歡拋頭露面的是據(jù)之于心的心君“識(shí)神”，主管處理外界人、小、物方面的諸多信息。
　　識(shí)神具有極大的可塑性，易被染污，故共性質(zhì)變化不定，近墨則黑，近赤則朱。現(xiàn)代人們常說的“世界觀”、“人生觀”、“稟性——?dú)赓|(zhì)之性”、“思維意識(shí)定勢(shì)”等概念，皆系指識(shí)神的各種功能特點(diǎn)而言。
　　根據(jù)佛家的研究，吾人的“人生觀”、“宇宙觀”、“稟性”等并非天賦，而系人為，是自己歷劫以來生生世世積累起來的信息能量之慣性(業(yè)力)總匯而成，以識(shí)神形式潛藏于心內(nèi)，成為心之中的心——?dú)夥A之性、人生觀觀主。這樣一來，在我們這個(gè)復(fù)雜的生命系統(tǒng)中就存在著不同性質(zhì)的兩個(gè)“心”，即赤條條來、赤條條去、清凈無染、永不生滅的妙明真心 (元神)，和觸境生情、見欲思遷、不辨真謬的攀緣安心(識(shí)神)——這就是“心”的“雙重結(jié)構(gòu)或體用結(jié)構(gòu)”。元神是體，識(shí)神為用。甚深層次的性功修持，就在于以“戒、定、慧”的慧能沖洗干凈蒙蔽在元神妙明真心上，由識(shí)神、妄心染污帶來的垢塵，恢復(fù)元神本有的光明凈性，從而破迷為悟，轉(zhuǎn)識(shí)成智而超凡入圣。古人稱此為“心地法門，心上用功”，化業(yè)力為功力，令識(shí)神歸元神，變種性為佛性，令壽命鐘正擺不停，直至氣竭數(shù)盡，壽終正寢。
　　古人常說：“心主神明”，“心之官則思”——心是后天人體的思維意識(shí)主體，相當(dāng)于佛家的第七末那識(shí)——我識(shí)。而大腦呢?元神之府，先天神慧——特異功能、五眼六通與靈明覺性——高智慧能量中樞?！敖揭赘?，稟性難移”——人生觀、思維意識(shí)定勢(shì)難移。
　　《列子·湯問篇》記載了古代名醫(yī)扁鵲曾經(jīng)做過的世界首例“換心”大手術(shù)。患者一個(gè)名叫魯公扈，臉白肌瘦，然雙目有神；另一位叫做趙齊嬰，面黑體健，卻智迷言僵。聞扁鵲醫(yī)術(shù)超群，特來求治。扁鵲親配麻藥酒，令二人飲之，三日不省人事，經(jīng)開胸削腹，將二人之心交換移植，敷藥縫合。二人醒后服藥月余，功能上則相互取長(zhǎng)補(bǔ)短，恢復(fù)健康，但卻神志大變。魯公扈徑直走向趙齊嬰家，時(shí)趙妻正在紡線，見進(jìn)來一黑臉大漢，表情親昵，嚇得大叫，驚動(dòng)四鄰，將其扭送官府。而趙齊嬰呢?卻徑往魯家，演了一場(chǎng)同樣的悲喜劇。到了官府之后，派人請(qǐng)來神醫(yī)扁鵲，此事才得以圓滿收?qǐng)觥?
　　這雄辯地說明了古人“心之官則思”、“心主神明”——心是人生命系統(tǒng)后天的思維意識(shí)中樞和主體的論斷，是符合人體生命的真實(shí)情況的。
　　現(xiàn)代心理學(xué)家們研究發(fā)現(xiàn)，人的心臟具有某種智慧，并認(rèn)為至少思維過程是心腦共同合作完成的，二者之間的耦合系數(shù)接近黃金分割數(shù) 0．618。與大腦左半球(邏輯認(rèn)知中樞)的關(guān)系最為密切。
　　從現(xiàn)代內(nèi)分泌學(xué)說看，胸腺也屬于中丹田范圍，它是控制人體衰老的內(nèi)分泌器官，所分泌的胸腺素是一種長(zhǎng)壽素。胸腺還生產(chǎn)T淋巴細(xì)胞，以增強(qiáng)人體免疫功能。人出生時(shí)，胸腺重約13克，到性成熟年齡可達(dá)35克，性成熟后即停止增長(zhǎng)，以后逐漸萎縮，到了老年時(shí)它的重量比出生時(shí)還小，此時(shí)性功能衰退，是人體衰老的早期信號(hào)之一，也是衰老的標(biāo)志。仙道內(nèi)丹術(shù)修習(xí)的實(shí)踐證明，堅(jiān)持修煉者可以逐漸恢復(fù)胸腺的內(nèi)分泌功能，從而使人重返青春——返老還童凹而成為可能。特別是女性練功，宜以小丹田作為人手意守之處和收功時(shí)引氣歸元之區(qū)。
　　
　　上丹田探玄
　　
　　上丹田在大腦里面，為靈關(guān)元神之府，是人體潛在的高智慧——五眼六通、靈明覺性——信息與能量的中樞，中醫(yī)學(xué)稱之為奇恒之府；道家指明是天道的代表天命元神居住之處；佛家第八阿奈耶識(shí)識(shí)田也在這里。識(shí)田中“集成”有個(gè)人歷劫生命集積的全部檔案資料、宇宙消息，從而形成個(gè)人特有的人生觀、宇宙觀及思維意識(shí)定勢(shì)?，F(xiàn)代科學(xué)研究得知，物質(zhì)大腦由兩個(gè)半球組成，中間由胼胝體聯(lián)結(jié)。兩個(gè)半球一陰一陽，功能互補(bǔ)，且陰中有陽，陽中有陰，切除一個(gè)半球，另一半球可以代行一部分功能。大腦左半球?yàn)楹筇祜@意識(shí)中樞，人體的“外交部”，具語言、思維意識(shí)邏輯認(rèn)知功能，對(duì)外源性信息進(jìn)行采集，依據(jù)思維意識(shí)定勢(shì)而分析、判斷，并發(fā)號(hào)施令。右半球則為潛意識(shí)中樞，主管人體的空間活動(dòng)與形象思維。
　　“腦為元補(bǔ)之府”。元神以“靈光”的形態(tài)顯示，仙道家稱之為“本性靈光”、“無極神光”，悱家叫做“無量佛光”、“常寂光”、“內(nèi)明”。依其人稟賦(根器)的不同，光色亦各異相，紫、金、藍(lán)、白、紅及彩色光等。
　　仙道丹功高階的“泥丸養(yǎng)嬰”、“煉神返虛”而達(dá)“人天合一”、“天人一體”，更是上丹田元神的本能，不容識(shí)神魚目混珠，因?yàn)槔咸鞝?道)只認(rèn)它的天之驕子天命元神。性光不現(xiàn)，元神不顯，侈談人天合一，乃紙上談兵，一廂情愿之虛語。
　　元神性光之光源來自哪里?來自上丹田靈關(guān)先天慧理太極的“陽魚”，它虛而無形，靈而有相。初如流星，明如皓月。有人將神光之源歸于松果體——非也!有形之器至多能作為陽魚神光的一個(gè)物質(zhì)工具而已。
　　現(xiàn)代生理學(xué)家及研究家們認(rèn)為，維持人體生命系統(tǒng)各級(jí)組織之間穩(wěn)定平衡的調(diào)節(jié)系統(tǒng)共有四套。第一套調(diào)節(jié)平衡系統(tǒng)為軀體神經(jīng)系統(tǒng)；第二套調(diào)節(jié)平衡系統(tǒng)為植物神經(jīng)系統(tǒng)；第三套調(diào)節(jié)平衡系統(tǒng)為經(jīng)絡(luò)系統(tǒng)；第四套調(diào)節(jié)平衡系統(tǒng)為內(nèi)分泌系統(tǒng)。人體內(nèi)分泌系統(tǒng)的總指揮部是下丘腦和垂體，它們統(tǒng)轄著人體各個(gè)部分的內(nèi)分泌腺體。上丹田區(qū)域正是以垂體為中心點(diǎn)，把下丘腦、松果體等囊括在內(nèi)。對(duì)于神經(jīng)內(nèi)分泌學(xué)，現(xiàn)代科學(xué)也還處于一知半解之中。著名的神經(jīng)生理學(xué)家 D·huber曾感嘆地說道：像大腦這樣復(fù)雜而靈敏的系統(tǒng)，必然存在一個(gè)全面控制中心。這個(gè)中心在哪里?誰在那里主宰一切?現(xiàn)代科學(xué)說：不知道!這個(gè)“虛在、隱存”的全面控制中心，以東方慧眼科學(xué)家們的慧眼所見，那就是上丹田的泥丸內(nèi)院，天命之性的代表——天谷元神在那里主宰一切。
　　大腦是人體充滿高耗能細(xì)胞的“硅谷”，其腦細(xì)胞重量雖只有體重的2％，卻消耗了人體20％左右的能量，是人體各子系統(tǒng)中的耗能大戶。尤其是它本身沒有“食堂”供給營(yíng)養(yǎng)(無脂肪……等儲(chǔ)能組織)，全賴心臟系統(tǒng)直接供能。意守上丹田練功，意到氣到，氣到血行，給大腦細(xì)胞充分供能，促助各腦細(xì)胞間的功能活動(dòng)協(xié)調(diào)而有序，同時(shí)可以大力改善和增強(qiáng)人體內(nèi)分泌機(jī)能，令人體各大子組織之間的工作更加協(xié)調(diào)平衡。
　　“腎藏精，精生髓”，“腦為髓?！保弧耙貌焕?，還精補(bǔ)腦”；“三花聚頂，五氣朝元”，人體精華都向諸陽之會(huì)的大腦奇恒之府匯聚。金丹大道，玄關(guān)竅開，產(chǎn)出真種，真炁萌動(dòng)，炁運(yùn)周天，進(jìn)入大腦泥丸內(nèi)院，神炁融溶，乾坤交媾，靈光閃閃，凝煉金丹。可以說，最后都是在大腦上丹田完成的。