昨天，我們的一伊主編解讀了遺傳發(fā)育所焦雨玲老師為通訊作者的關于小麥重測序的文章(中國栽培小麥老家來自歐洲？--首篇小麥基因組大規(guī)模重測序研究)，這個題目（中國栽培小麥老家來自歐洲？）引起大家的熱議。其實，我們主編群里對這個觀點也有討論。其實文章摘要的原話如下
上世紀確實引進了很多國外種質，對我國小麥育種起到了重要的作用。下面兩位老師的留言不約而同的提到了，中國小麥品種豐產(chǎn)性狀來自歐美品種，適應性來自國內(nèi)的地方品種。
因為文章中，歐洲栽培品種和美國栽培品種較少，故文中的結論“主要來自歐洲的地方品種”還需要更多數(shù)據(jù)的支持。另外，文中說中國的地方品種對D亞基因組的貢獻比較大。因為，我們知道地方品種對育成品種的適應性有貢獻，那我們是不是可以推測這種適應性主要由D亞基因組提供？
另外，本世紀以來的育成品種是不是國外種質貢獻的就比較少了?根據(jù)宋老師和建輝的說法，除少數(shù)抗病性狀以外，本世紀基本上沒有國外種質直接利用在新品種上。
下面我們說點其他的。
因為還沒有正式發(fā)表，這120份材料的名單目前還看不到，大致可分為2類，第一類是95份地方品種材料(landraces),第二類是25份育成品種材料(cultivars)，這些材料中有60份材料來自中國微核心種質材料，還有16份種質來自新月沃地。這些材料除了在科學方面揭示小麥人工馴化方面的見解之外，在小麥育種上的幫助也是巨大的。這些材料在很大程度上涵蓋了中國普通小麥種質的主要單倍型。
為什么這么說？小麥是我們的糧食作物，除了一般意義上的研究，更應該回歸到小麥的遺傳改良上。目前的一些研究中，在功能機制上花了很多功夫，但感覺總是差了點什么。前段時間，我們解讀了發(fā)表在Nature Plants上的文章：舶來賞析-過表達ABA受體促進缺水條件下小麥的產(chǎn)量（Nature Plants 2019）。過表達ABA受體基因TaPYL4的材料，在正常生長條件下，需水量減少20%但并不減產(chǎn)，而在干旱條件下產(chǎn)量顯著增加。但有點遺憾的是，本文卻沒有揭示TaPYL4在自然群體里的變異情況，看一看那些抗旱性強的材料里是不是與這個基因的上調(diào)表達有關系。如果有，該基因在育種上的應用潛力就比較大。有了這塊內(nèi)容，文章的意義就更大了。
話又說回來，揭示自然群體內(nèi)的遺傳變異也是需要花一翻功夫的，有時候還可能啥都沒發(fā)現(xiàn)，白瞎功夫。這篇文章以后，那就方便很多了，我們可以直接查閱感興趣基因的單倍型。目前，我們網(wǎng)站上也可以查詢，不過不如重測序的數(shù)據(jù)全。
前面劉志勇團隊發(fā)表的文章'Molecular characterization of a novel TaGL3–5A allele and itsassociation with grain length in wheat (Triticum aestivum L.)',我們也有解讀（ 一個新的小麥粒長位點TaGL3-5A的鑒定），文中發(fā)現(xiàn)，在親本北農(nóng)6號和燕大1817之間，只有TaGL3-5A基因的第11個外顯子上的一處SNP（G/A）導致了氨基酸的變異，根據(jù)該處變異開發(fā)KASP分子標記，在燕大1817/北農(nóng)6號的RILs群體中與粒長QTL緊密連鎖。這個變異，其實在我們網(wǎng)站上也可以看到。
點擊SNP，就可以看到各個材料中在該位點的基因型。
其實，我們在這里揭示了包括小麥在內(nèi)的糧食作物的一種研究思路(套路)。不管是圖位克隆的基因還是通過其他方法拿到的基因，在研究完它的功能機制之后，最好再回歸到小麥遺傳改良方面的內(nèi)容。如哪種單倍型更優(yōu)異可以在育種上應用等，可以參考最近發(fā)表在PNAS上的TaGNI1基因。更進一步的話，那就是發(fā)現(xiàn)優(yōu)異單倍型之后，一定要證明單倍型的效應，如可以將不同的單倍型進行轉基因驗證等。
給大家留一個思考題：雖然現(xiàn)在普通小麥里圖位克隆的基因還比較少，但是比較這些被克隆的基因之后發(fā)現(xiàn)他們之間還是有些共同點的。請大家留言說說都有哪些共同點？
我們也會繼續(xù)跟蹤這篇文章的最新進展，爭取盡快把這些數(shù)據(jù)放到我們小麥族多組學數(shù)據(jù)網(wǎng)站上方便大家快速查詢。
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