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【人物與科研】上海交通大學(xué)楊宇課題組Chinese J. Chem.:構(gòu)建人工堿基庫助力精準(zhǔn)分子醫(yī)學(xué)

導(dǎo)語

核酸是生命遺傳信息存儲(chǔ)介質(zhì),而且由于其高度可編程性和良好的生物相容性,核酸的應(yīng)用已不再局限于其天然的功能。然而,核酸材料在實(shí)際應(yīng)用中卻遇到一些固有限制,包括易被核酸酶降解,快速的腎臟清除,不良的藥代動(dòng)力學(xué),過少的堿基模塊等。為了克服這些限制,研究人員開發(fā)了針對核酸的多種修飾和取代方法,包括堿基的修飾和取代,核糖的修飾和骨架的修飾等。近日,上海交通大學(xué)楊宇課題組系統(tǒng)歸納了非天然的人工堿基庫,并綜述了其在分子醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用進(jìn)展。相關(guān)成果在線發(fā)表于Chinese J. Chem.DOI: 10.1002/cjoc.202200719



前沿科研成果

構(gòu)建人工堿基庫助力精準(zhǔn)分子醫(yī)學(xué)

核酸是生命遺傳信息存儲(chǔ)介質(zhì),在優(yōu)雅和復(fù)雜性之間實(shí)現(xiàn)了完美的平衡。自19世紀(jì)發(fā)現(xiàn)核酸以來,核酸的結(jié)構(gòu)和功能已被充分研究。隨著分子生物學(xué)和合成方法的發(fā)展,核酸相關(guān)研究廣泛存在于生物科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)與材料科學(xué)、信息科學(xué)等領(lǐng)域,極大地促進(jìn)了科學(xué)技術(shù)進(jìn)步和社會(huì)發(fā)展。由于其高度的可編程性,核酸可以作為構(gòu)建納米材料的基元。此外,核酸還用作靶向劑、檢測探針、治療藥物和疫苗。然而,在許多實(shí)際應(yīng)用中,核酸的效率常常受到固有性質(zhì)的限制,包括構(gòu)建塊過于單一(只有四個(gè)構(gòu)建塊A、G、CT/U堿基),易被核酸酶降解,易被腎快速清除,藥代動(dòng)力學(xué)特性差等。因此,為擴(kuò)大遺傳信息存儲(chǔ)容量,增加核酸材料在實(shí)際應(yīng)用中的潛力,開發(fā)人工堿基尤為必要。

基于當(dāng)前人工堿基研究所取得的進(jìn)展,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院楊宇課題組對非天然的堿基對、生物活性堿基衍生物、熒光堿基衍生物和電活性堿基衍生物等人工堿基進(jìn)行了系統(tǒng)的分類,并提出了人工堿基庫的概念。基于該人工堿基庫,作者綜述了人工堿基在分子醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用,包括診斷和治療兩方面,并對該研究方向進(jìn)行了總結(jié)和展望(圖1)。


1. 構(gòu)建人工堿基庫助力精準(zhǔn)分子醫(yī)學(xué)(圖片來源:Chinese J. Chem.

非天然堿基對:自發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)以來,人們一直在思考是否可以創(chuàng)建非天然的堿基對來擴(kuò)展遺傳字母表以增加分子多樣性和功能。這些非天然成對的堿基是互補(bǔ)的,不與天然核堿基發(fā)生錯(cuò)配,并且含有非天然堿基對的雙鏈DNA應(yīng)具有被DNA聚合酶復(fù)制的能力。基于這些原理,Steven Benner20世紀(jì)80年代末首次開創(chuàng)了這一領(lǐng)域,其后的研究者逐步發(fā)展了氫鍵介導(dǎo)模式、疏水介導(dǎo)模式和金屬介導(dǎo)模式的非天然堿基對(圖2)。

2. 非天然的人工堿基對(圖片來源:Chinese J. Chem.

功能性的人工堿基:人工堿基不僅可以改變核苷和核酸的性能,還可以創(chuàng)造天然核苷和核酸不具備的性能,包括一些生物活性、熒光性質(zhì)和電活性等,這些功能性的人工堿基對醫(yī)學(xué)上的診斷和治療有著重要意義(圖3)。

3. 功能性的人工堿基(圖片來源:Chinese J. Chem.

人工堿基在分子醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用:人工堿基可用于解決多通路qRT-PCR中假陽性的問題;可用于提高核酸適體與靶標(biāo)的結(jié)合力,并解決其易被酶切的問題,從而改善核酸適體相關(guān)的診斷與治療應(yīng)用;某些人工堿基具有抗腫瘤和抗病毒活性,已經(jīng)成為臨床使用的一類重要藥物;人工堿基也被應(yīng)用于反義核酸和小干擾RNA設(shè)計(jì),有效推動(dòng)藥物的臨床應(yīng)用;人工堿基也參與納米載體和納米藥物的設(shè)計(jì),有效改善材料的應(yīng)用性能(圖4)。

4. 人工堿基在分子醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用(圖片來源:Chinese J. Chem.

隨著核酸診斷的廣泛應(yīng)用和核酸藥物的上市,人工核酸堿基將發(fā)揮越來越重要的作用。目前,基于核酸的診斷技術(shù)仍需大量開發(fā),核酸藥物在給藥系統(tǒng)設(shè)計(jì)和副作用方面仍面臨巨大挑戰(zhàn)。人工堿基領(lǐng)域當(dāng)前仍有巨大的待探索空間,其所取得的進(jìn)展將為醫(yī)學(xué)的進(jìn)步提供極大的助力。

該工作近期發(fā)表在Chinese journal of Chemistry上(DOI: 10.1002/cjoc.202200719),論文第一作者為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后陳靜奇,通訊作者為楊宇研究員。該論文得到了國家自然科學(xué)基金、 “臨床+”卓越項(xiàng)目和上海高水平地方高校創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目資助。


課題組簡介

楊宇課題組主要研究領(lǐng)域?yàn)橄冗M(jìn)生物材料,DNA分子與納米工程,精準(zhǔn)免疫治療,智能診療等。具體研究方向聚焦于(1)構(gòu)建金屬有機(jī)框架藥物作為智能納米藥物來克服生物系統(tǒng)屏障,從而開發(fā)腫瘤放療、化療、光學(xué)及免疫治療新策略;(2)腫瘤微環(huán)境響應(yīng)與調(diào)控的新型分子/納米藥物的構(gòu)建,用于實(shí)現(xiàn)高效、精準(zhǔn)的腫瘤靶向治療;(3)基于DNA納米技術(shù)的精準(zhǔn)免疫治療;(4)設(shè)計(jì)基于DNA分子網(wǎng)絡(luò)的納米機(jī)器人,實(shí)現(xiàn)智能化的腫瘤免疫治療等。


教授簡介

楊宇,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院分子醫(yī)學(xué)研究院研究員、博士生導(dǎo)師、國家海外高層次青年人才。長期在生物材料、DNA分子與納米工程、精準(zhǔn)免疫治療等交叉學(xué)科領(lǐng)域從事研究,針對腫瘤等重大疾病的診療,發(fā)展了一系列基于DNA分子與生物材料的光學(xué)治療、放射治療、靶向治療與精準(zhǔn)免疫治療新策略。至今在Sci. Adv.、Chem、J. Am. Chem. Soc.Adv. Mater.、ACS Nano等行業(yè)國際頂尖學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表論文50余篇,其中5篇論文入選“ESI高被引論文”。論文總引用3000余次,H因子32。曾獲得澳門科技獎(jiǎng)研究生科技研發(fā)獎(jiǎng)(2018)、Baxter China青年研究者獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)(2019),入選世界中醫(yī)藥學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)中藥藥劑委員會(huì)理事。

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