BSP實驗原理:
BSP克隆測序法,是目前甲基化檢測的金標(biāo)準(zhǔn)。用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變;隨后再CpG島兩端設(shè)計引物進(jìn)行PCR,將目的產(chǎn)物純化后進(jìn)行TA克隆,每個克隆挑取陽性克隆測序,最后將測得的序列與原始序列比對,統(tǒng)計甲基化位點及數(shù)量,并分析甲基化程度。
BSP實驗流程:
優(yōu)點:
1、克服了MSP只能作定性研究,可做定量研究;
2、敏感性高,待測DNA中5-甲基胞嘧啶分布極不均衡也可檢測;
3、引物設(shè)計相對簡單。
缺點:
1、價格高。
送樣要求:
1、組織樣本:-20℃或-80℃低溫冰箱中保存,液氮或者干冰運輸;市內(nèi)或短途運輸可冰袋運輸。若提供的材料為新鮮組織、血液細(xì)胞等生物材料,請?zhí)峁┳銐蛱崛?ug以上基因DNA的材料量。
2、DNA樣本:體積≥20ul,濃度≥100ng/ul,DNA總量≥2ug,20℃保存,低溫冰袋運輸。
3、血液樣本:要求保存于抗凝管中或凍存管中,體積大于2ml,請用干冰運送,保證DNA不降解。
4、樣品為石蠟包埋組織切片的,要求提供10張組織切片光片(面積>10mm×10mm,厚度約5-10um)。
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