公司為員工發(fā)放的住房補貼、公司為員工租房取得抬頭為公司發(fā)票的租房支出、員工憑公司抬頭發(fā)票報銷的租房支出均屬于職工福利費范圍，應(yīng)計入公司職工福利費，在不超過工資薪金總額14%的部分可以稅前扣除。同時，公司發(fā)生的職工福利費，應(yīng)該單獨設(shè)置賬冊，進行準確核算。
如果公司向員工發(fā)放的住房補貼列入員工工資薪金制度、固定與工資薪金一起發(fā)放，并符合以下原則的：①企業(yè)制訂了較為規(guī)范的員工工資薪金制度；②企業(yè)所制訂的工資薪金制度符合行業(yè)及地區(qū)水平；③企業(yè)在一定時期所發(fā)放的工資薪金是相對固定的，工資薪金的調(diào)整是有序進行的；④企業(yè)對實際發(fā)放的工資薪金，已依法履行了代扣代繳個人所得稅義務(wù)；⑤有關(guān)工資薪金的安排，不以減少或逃避稅款為目的；可將發(fā)放的住房補貼作為企業(yè)發(fā)生的工資薪金支出，按規(guī)定在稅前扣除。對于國有性質(zhì)的企業(yè)，其工資薪金，不得超過政府有關(guān)部門給予的限定數(shù)額；超過部分，不得計入企業(yè)工資薪金總額，也不得在計算企業(yè)應(yīng)納稅所得額時扣除。因此，國有性質(zhì)的企業(yè)應(yīng)注意，將住房補貼作為工資薪金支出是否會造成工資總額超標，如超標的話建議仍作為職工福利費處理。
員工取得抬頭為個人的租房發(fā)票，公司憑該發(fā)票為其報銷租房支出，不能列入職工福利費，該支出屬于與企業(yè)無關(guān)的支出，不能在稅前扣除。
工資、薪金所得，是指個人因任職或者受雇而取得的工資、薪金、獎金、年終加薪、勞動分紅、津貼、補貼以及與任職或者受雇有關(guān)的其他所得。公司向員工支付工資、薪金，應(yīng)代扣代繳員工的個人所得稅。
1、現(xiàn)金發(fā)放住房補貼
員工取得的住房補貼屬于工資、薪金所得。公司屬于員工個人所得稅的扣繳義務(wù)人，在代扣員工工資、薪金個人所得稅時，應(yīng)將該補貼并入員工當月工資，計繳個人所得稅。
需要注意的是，公司為外籍人員發(fā)放住房補貼不適用免稅規(guī)定。
2、公司租房免費提供給員工居住
個人所得的形式，包括現(xiàn)金、實物、有價證券和其他形式的經(jīng)濟利益。該租房費用屬于員工取得的其他形式的經(jīng)濟利益，屬于工資、薪金所得范圍。公司需將租房費用并入員工工資總額，代扣代繳員工的個人所得稅。公司租房給員工，并不一定固定由一個人住的；需按員工居住天數(shù)計算，確認員工租房費用并入員工工資總額，代扣代繳員工個人所得稅；如果確實無法劃分到員工個人名下的，原則上可不并入員工工資計繳個人所得稅。
需要注意的是，員工為外籍人員，其取得免費住房屬于以非現(xiàn)金形式取得的住房補貼。如該住房補貼合理，免繳個人所得稅。該員工（納稅人）或公司（扣繳義務(wù)人）應(yīng)在其初次取得的次月進行工資薪金所得納稅申報時，向稅務(wù)機關(guān)提供有關(guān)有效憑證及證明資料。主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)就申報的住房補貼收入逐項審核。對其中有關(guān)憑證及證明資料，不能證明其合理性的，主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)要求納稅人或代扣代繳義務(wù)人在限定的時間內(nèi)，重新提供證明材料。凡未能提供有效憑證及證明資料的補貼收入，主管稅務(wù)機關(guān)有權(quán)給予納稅調(diào)整。
3、個人租房憑租房發(fā)票到公司報銷
員工報銷租房費用，不論發(fā)票開具的抬頭為個人還是公司，圴屬于員工取得的工資、薪金所得。公司需將租房費用并入其工資總額，代扣代繳個人所得稅。
如果員工為外籍人員，外籍人員憑票報銷取得的住房費用屬于以實報實銷形式取得的住房補貼。該住房補貼合理的，免繳個人所得稅。員工應(yīng)按前述向稅務(wù)機關(guān)提交有效憑證和資料。
備注：對于發(fā)票抬頭為個人的租房費用，公司按規(guī)定報銷后，企業(yè)所得稅規(guī)定是不能稅前扣除的，個人所得稅規(guī)定公司需要將報銷的租房費用并入其工資總額，代扣代繳個人所得稅。
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