01
microRNA命名規(guī)則
miRNA(microRNA)成熟體命名規(guī)則如下:① 確定命名規(guī)則以前所發(fā)現(xiàn)的miRNA保留原來名字,如hsa-let-7。② miRNA成熟體簡寫成miR,然后根據(jù)其物種名稱,以及被發(fā)現(xiàn)的先后順序加上阿拉伯數(shù)字,例如hsa-miR-98。③ 高度同源的miRNA需在數(shù)字之后添加英文小寫字母以示區(qū)分,例如hsa-miR-32a,hsa-miR-32b。④由不同染色體上的DNA序列轉錄加工而成的具有相同成熟體序列的miRNA,則在后面加上阿拉伯數(shù)字以示區(qū)分,例如hsa-miR-99a-1和hsa-miR-99a-2。
此外,一個pre-miRNA的兩條同源臂有可能產(chǎn)生出兩個成熟的miRNA,其中表達水平較低的miRNA后面加上*號,如rno-miR-9*,而表達水平較高的miRNA后面不加任何符號。后來,miRBase對miRNA成熟體的名稱進行了大量的修改,很多帶*的miRNA都變成了-5p或-3p。當然,新名稱下面對應有其原來的名稱方便用戶查詢
02
microRNA序列查找
進入miRBase網(wǎng)站,搜索框輸入查找,例如hsa-miR-199a-1:
在結果列表中選擇目的miRNA:
進入如下頁面:
miRNA登錄號、信息簡介、頸環(huán)結構、可信度、已證實作用靶點等干貨信息應有盡有。
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