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AI速度!從宣布合作到達(dá)成里程碑不到40天,AI制藥正在改寫游戲規(guī)則

從宣布合作到首個(gè)里程碑,僅40天

 
截至2022年2月以來,AI制藥領(lǐng)域的相關(guān)合作,已披露的金額總計(jì)高達(dá)79.83億美元,包括賽諾菲、安進(jìn)、默沙東、阿斯利康、輝瑞等一眾跨國藥企,都選擇與AI新藥研發(fā)公司進(jìn)行合作。
 
我國的情況也不例外,大型藥企開始擁抱AI制藥公司,促成了諸多合作。
 
2月17日,在宣布合作后不到40天,復(fù)星醫(yī)藥與英矽智能聯(lián)合宣布,合作項(xiàng)目的臨床前候選化合物用于新的腫瘤免疫療法。一個(gè)多月前,兩家公司聯(lián)手,以1300萬美元的首付款,刷新了國內(nèi)AI制藥合作的首付款紀(jì)錄。
 
“人工智能主導(dǎo)藥物研發(fā)的時(shí)代正在到來,從預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、尋找藥物靶點(diǎn)到藥物分子設(shè)計(jì),再到臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì),人工智能在全面介入,開始發(fā)揮關(guān)鍵作用?!?/span>上海交通大學(xué)Med-X研究院副院長殷衛(wèi)海在最近的一次訪談時(shí)表示。

從《Discovery》首次報(bào)道,到入選《Science》年度科學(xué)發(fā)現(xiàn)

 
從1981年《Discovery》首次報(bào)道計(jì)算機(jī)藥物研發(fā)(CADD),到2021年《Science》將AI預(yù)測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)評(píng)為年度10大科學(xué)發(fā)現(xiàn),這40年間人工智能藥物研發(fā)逐漸從人們的想象中,走進(jìn)世界各地的實(shí)驗(yàn)室里。
 
我們搜索PubMed中AI制藥相關(guān)論文,可以發(fā)現(xiàn)從1990年到2021年AI制藥理論從“0”到“1”的發(fā)展,期間相關(guān)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)量從不到40萬到突破160萬,技術(shù)理論日益成熟相關(guān)成果逐漸受到更多關(guān)注,也為AI制藥在實(shí)踐中的發(fā)展打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。
 
1990-2020 AI制藥理論發(fā)展歷程,資料來源Deep Pharma Intelligence
 
與此同時(shí),傳統(tǒng)制藥方式深陷反摩爾定律(Eroom定律),也就是說盡管制藥公司幾十年來不斷增加投資,但投資10億美元得到的上市新藥數(shù)目每9年就減少一半。周期長(10-15年)、投入高(>10-20億美元)、成功率低(<5%)成為新藥研發(fā)的三大痛點(diǎn)。
 
2018年,Heal-X通過AI驅(qū)動(dòng)老藥新用,發(fā)現(xiàn)脆性綜合征候選藥物;2019年,Deep Genomics利用AI平臺(tái),發(fā)現(xiàn)威爾遜病寡核苷酸候選藥物;2020年,AlphaFold實(shí)現(xiàn)根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸精準(zhǔn)預(yù)測蛋白質(zhì)3D形狀;2021年,英矽智能利用人工智能發(fā)現(xiàn)全新靶點(diǎn)和全新化學(xué)結(jié)構(gòu)的特發(fā)性肺纖維化候選藥物…
 
這些高光時(shí)刻,不僅為AI制藥的發(fā)展建立了坐標(biāo),也為傳統(tǒng)制藥的變革帶來了新機(jī)。

AI制藥正在改變游戲規(guī)則

 
傳統(tǒng)制藥公司往往面臨時(shí)間投入和風(fēng)險(xiǎn)的權(quán)衡,平均而言一種新藥自研發(fā)到上市間隔12年左右,而開發(fā)期和上市后享有的專利保護(hù)期是此消彼長的關(guān)系,尤其針對(duì)銷量巨大的新藥,有時(shí)僅是晚1天上市就意味著年收入可能要縮減100萬美元。
 
隨著管理審批越發(fā)嚴(yán)格,競爭越發(fā)激烈,新藥的研發(fā)更是阻力重重。AI+新藥研發(fā)的結(jié)合,使得新藥研發(fā)迎來了新機(jī)。我們可以從幾個(gè)維度來了解人工智能對(duì)藥物研發(fā),特別是早期藥物發(fā)現(xiàn)的滲透。它主要包括:

1)靶點(diǎn)和早期藥物發(fā)現(xiàn);
2)小分子化合物的設(shè)計(jì)、生成和優(yōu)化;
3)臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì);
4)現(xiàn)有藥物的再利用等方面。
 
AI可提供賦能的早期藥物發(fā)現(xiàn)步驟
 
其中靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和早期藥物發(fā)現(xiàn)方面,主要包括分析數(shù)據(jù)集、形成假設(shè)并產(chǎn)生新的見解,確定新的候選藥物,分析健康和患病受試者的樣本數(shù)據(jù),從而發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn);小分子化合物的設(shè)計(jì)、生成和優(yōu)化方面,即利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等算法,提取化合物不同層面的特征,然后根據(jù)這些特征再進(jìn)一步進(jìn)行預(yù)測;臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)方面,智能算法可優(yōu)化臨床試驗(yàn)的研究設(shè)計(jì),它還可分析病歷,從而確定能從新療法中獲益的患者,為臨床試驗(yàn)尋找出理想的受試者;現(xiàn)有藥物的再利用方面,人工智能系統(tǒng)能快速識(shí)別許多已知藥物的新適應(yīng)癥,從而可以做到老藥新用。
 
正如中國科學(xué)院院士蔣華良此前表示,從靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)到靶點(diǎn)的確認(rèn),從先導(dǎo)分子的發(fā)現(xiàn)到先導(dǎo)分子的優(yōu)化,再到臨床研究,人工智能可以加速新藥研發(fā)的多個(gè)環(huán)節(jié),在降低研發(fā)成本、加速研發(fā)周期、提高研發(fā)成功率上展現(xiàn)出巨大的潛力。
 

國內(nèi)外藥企開始全面擁抱AI制藥

 
接下來,我們盤點(diǎn)一下2021年以來跨國藥企與人工智能公司達(dá)成的主要合作,幾乎所有的制藥巨頭都在開始擁抱人工智能技術(shù)。
 
2021年1月,AstraZeneca與BenevolentAI宣布達(dá)成合作協(xié)議,利用人工智能推進(jìn)全新靶點(diǎn)慢性腎臟病(CKD)藥物的開發(fā)。
 
3月,Pfizer宣布將Iktos的AI平臺(tái)應(yīng)用于其小分子項(xiàng)目的從頭設(shè)計(jì)。
 
6月,仿制藥巨頭Teva與英矽智能達(dá)成合作,應(yīng)用英矽智能的生成式對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)技術(shù)和AI平臺(tái)PandaOmics助力其藥物研發(fā)。
 
自2021年年末以來,多項(xiàng)合作拉開了跨國藥企加碼AI制藥的2.0階段。2021年12月,羅氏與Recursion達(dá)成數(shù)十億美元AI藥物發(fā)現(xiàn)合作。2022年1月7日,默沙東與Absci達(dá)成6.1億美元合作,利用人工智能技術(shù)合成定制的蛋白酶。同日,賽諾菲與Exscientia達(dá)成52億美元合作,共同開發(fā)15種新型小分子療法,涉及腫瘤學(xué)和免疫學(xué)領(lǐng)域。
 
相較于跨國藥企的一路高歌猛進(jìn)地?fù)肀I制藥,國內(nèi)藥企加入這一行列的步伐稍微謹(jǐn)慎些。
 
2019年,豪森就與Atomwise合作,前期使用后者的AI分子篩選平臺(tái)AtomNet進(jìn)行化合物篩選,以選擇抗腫瘤靶點(diǎn),在2020年4月才擴(kuò)大了合作力度。2021年12月,國內(nèi)制藥巨頭恒瑞醫(yī)藥與Iktos達(dá)成AI新藥研發(fā)平臺(tái)戰(zhàn)略合作協(xié)議,使用Iktos基于AI的從頭藥物設(shè)計(jì)軟件Makya,來加速小分子藥物的發(fā)現(xiàn)和先導(dǎo)化合物的優(yōu)化。
 
2022年1月12日,復(fù)星醫(yī)藥與英矽智能宣布達(dá)成合作,其中1300萬首付款刷新了國內(nèi)AI制藥合作的首付款記錄,同時(shí)復(fù)星醫(yī)藥還向英矽智能提供了未披露金額的股權(quán)投資。
 
在相關(guān)媒體采訪時(shí),英矽智能首席科學(xué)官任峰博士表示:“我希望這次合作能夠?qū)鴥?nèi)AI制藥領(lǐng)域有一定的推動(dòng)作用,希望大家對(duì)國內(nèi)藥企和AI制藥公司之間的合作模式有新的思考,希望它們?cè)贏I賦能新藥研發(fā)步子邁得更大一些,合作方式的改變對(duì)新藥研發(fā)行業(yè)來說也是很大的助力?!?/span>

AI制藥進(jìn)入驗(yàn)證期,合作里程碑交付陸續(xù)到來

 
AI制藥合作數(shù)量呈爆發(fā)式增長的時(shí)候,但鮮有突出的合作成果公開,這一度引發(fā)外界的擔(dān)憂和質(zhì)疑。
 
正如本文一開始介紹的,時(shí)隔一個(gè)多月,英矽智能和復(fù)星醫(yī)藥官宣就達(dá)成了首個(gè)里程碑,無疑給AI制藥合作的驗(yàn)證注入一針強(qiáng)心劑。
 
英矽智能創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官Alex Zhavoronkov博士在新聞稿中表示,“我很高興在宣布合作后不到40天,研發(fā)團(tuán)隊(duì)成功提名了QPCTL項(xiàng)目的臨床前候選藥物,并啟動(dòng)了用于新藥臨床試驗(yàn)申報(bào)的臨床前研究?!睆?fù)星醫(yī)藥執(zhí)行總裁、全球研發(fā)中心總裁兼首席醫(yī)學(xué)官回愛民博士則表示,“人工智能平臺(tái)作為變革性的創(chuàng)新技術(shù),可大大提升新藥創(chuàng)新的效率,為醫(yī)藥創(chuàng)新提供有力支撐?!?/span>
 
根據(jù)上市AI制藥公司Exscientia披露的管線來看,平均需要13.7個(gè)月才能在合作項(xiàng)目啟動(dòng)后達(dá)到PCC階段,此次英矽智能和復(fù)星醫(yī)藥合作的QPCTL項(xiàng)目從啟動(dòng)到提名PCC共計(jì)耗費(fèi)9個(gè)月時(shí)間,而這一速度較之工業(yè)界的4.5年的耗時(shí)已經(jīng)有了顯著的提升。
 
另一組數(shù)字同樣具有參考性,不久前BCG咨詢發(fā)表在《Nature Reviews Drug Discovery》上的回顧性文章中,分析師根據(jù)專利、出版物和公開聲明的時(shí)間,發(fā)現(xiàn)多數(shù)人工智能項(xiàng)目在不到4年的時(shí)間里走完了整個(gè)從藥物發(fā)現(xiàn)到臨床前的旅程。這樣的初始數(shù)據(jù)與行業(yè)內(nèi)5-6年的歷史時(shí)間線相比依然非常理想。

 部分人工智能賦能的藥物發(fā)現(xiàn)項(xiàng)目的時(shí)間線,資料來源《Nature Reviews Drug Discovery》AI in small-molecule drug discovery:a coming wave?
 

AI制藥的巨大潛能正在釋放

 
在當(dāng)下IT+BT合作的大潮中,人工智能技術(shù)無疑為新藥研發(fā)帶來了新的范式。
 
隨著藥企與AI制藥公司合作的深入,更多有效的數(shù)據(jù)產(chǎn)生,驗(yàn)證多樣化的深度算法和技術(shù)在短時(shí)間內(nèi)取得喜人的成果,人工智能有望深度賦能于制藥的各個(gè)環(huán)節(jié),直至覆蓋整個(gè)產(chǎn)業(yè)鏈。
 
我們期待人工智能制藥逐漸走向常態(tài)化,我們也更希望這樣的范式增效盡快從早期藥物發(fā)現(xiàn)擴(kuò)散至藥物的可及性,切實(shí)地造福于全球患者。
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