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羅輯醫(yī)療知識(shí)星球3000+醫(yī)健精英關(guān)注的知識(shí)社群
最近某大CEO一篇關(guān)于雅培快檢的文章迅速串紅,由于文章的主旨是其一貫的風(fēng)格‘國(guó)貨當(dāng)自強(qiáng)’,借助情懷吸引眼球,并一時(shí)間被眾多自媒體嗨轉(zhuǎn),但是如果細(xì)觀其文你會(huì)發(fā)現(xiàn),文章就是一個(gè)典型的屁股文,先是拿著產(chǎn)品的protocol罵了一通,其大意是這個(gè)外佬技術(shù)員還敢自吹營(yíng)銷(xiāo)宣傳快檢5分鐘,老汪家隔壁實(shí)驗(yàn)員比你們?!?,可以分分鐘滅了你,然后用兩個(gè)花式計(jì)算論證這款產(chǎn)品靈敏度太低,結(jié)論就是:即不快也不準(zhǔn),相信哪天我族民智大開(kāi),民族自信心起來(lái)了,相信憑借俺的神功,可以一嘴口炮炮轟美利堅(jiān),等著吧,小樣的米國(guó)?。ü巫游鹦?,言歸正傳還是看正文)
上月27日,美國(guó)雅培(Abbott)公司在其官網(wǎng)表示,雅培的診斷測(cè)試已獲得美國(guó)FDA的緊急使用授權(quán)(EUA),該產(chǎn)品是用于檢測(cè)新型冠狀病毒(COVID-19)的最快的即時(shí)分子診斷測(cè)試,可在短短5分鐘內(nèi)產(chǎn)生陽(yáng)性結(jié)果,在13分鐘內(nèi)產(chǎn)生陰性結(jié)果。
這個(gè)月,雅培將提高生產(chǎn)量,每天為美國(guó)醫(yī)療系統(tǒng)提供50,000 ID NOW COVID-19測(cè)試。雅培表示,先前批準(zhǔn)的 Abbot m2000 RealTime SARS-CoV-2 EUA測(cè)試運(yùn)行在另一個(gè)系統(tǒng) m2000 RealTime System 上,用于集中式實(shí)驗(yàn)室環(huán)境。結(jié)合ID NOW?,雅培預(yù)計(jì)在4月份進(jìn)行約500萬(wàn)次測(cè)試。那這款特朗普力推的檢測(cè)試劑的原理是什么呢,就是大名鼎鼎的以RNA分子為模板的恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)!
也許每個(gè)人第一次看到這個(gè)技術(shù)的時(shí)候,簡(jiǎn)直可以用“震驚”、“驚艷”來(lái)形容。擴(kuò)增速度真快啊,十幾分鐘就能出結(jié)果,比現(xiàn)在吭哧吭哧做PCR豈不是方便多了!可是國(guó)內(nèi)幾年過(guò)去了,似乎也沒(méi)看到多少基于恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的臨床產(chǎn)品上市。說(shuō)真的是有點(diǎn)失望的。上面這幅市場(chǎng)應(yīng)用圖(如上)可以非常直觀的反應(yīng)國(guó)內(nèi)外這種技術(shù)的應(yīng)用差距,在傳染病領(lǐng)域,美國(guó)的RNA恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)生產(chǎn)的試劑盒已經(jīng)占到了64%的市場(chǎng)份額,同比國(guó)內(nèi)還是零,國(guó)內(nèi)基本上還是完全依賴(lài)于傳統(tǒng)的篩查技術(shù)。
恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)與PCR技術(shù)原理比較(僅供參考)
何為RNA恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù),顧名思義,就是可以直接以RNA為模板(很重要,駁某大CEO文章會(huì)提及,原文大言不慚提到拷貝數(shù),說(shuō)人家靈敏度不夠),在恒定的溫度下進(jìn)行擴(kuò)增的技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)快速直接對(duì)病原微生物的檢測(cè),相比于傳統(tǒng)的PCR,具有檢測(cè)時(shí)間快,靈敏度高,容易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作門(mén)檻低,價(jià)格成本低,避免交叉污染,檢測(cè)對(duì)象為活體的諸多優(yōu)點(diǎn)!
某大CEO文中,自稱(chēng)用兩種方法得出:各種等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的LOD極限大概在CT值35左右,是RT-PCR的1/5-1/10的靈敏度。如果產(chǎn)品優(yōu)化的不好,可能只有1/100左右。NEAR作為一種等溫技術(shù),理論上也應(yīng)該與此相當(dāng),結(jié)合其流感的檢測(cè)數(shù)據(jù)(CT>31就明顯降低),其LOD預(yù)計(jì)只有RT-PCR的1/20-1/40左右,進(jìn)一步結(jié)合該PCR產(chǎn)品的理論LOD100-200copies/ml,可以計(jì)算出ID NOW的可能靈敏度在2000-8000copies/ml。
姑且認(rèn)為上述花式換算準(zhǔn)確無(wú)誤,但是他們忽略了一個(gè)事實(shí),RNA恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)中是以RNA為初始模板,在病原微生物中RNA的初始模板拷貝數(shù)是DNA模板拷貝數(shù)的數(shù)百倍以上,即RNA 拷貝數(shù)>DNA拷貝數(shù)(10的4次方 >1),即使其LOD的拷貝數(shù)只有PCR的1/40,其結(jié)果準(zhǔn)確率仍然應(yīng)該不低于RT-PCR。
因?yàn)橐訰NA為起始模板,這就是為什么分子恒溫?cái)U(kuò)增方法靈敏度高的原因,一般能檢測(cè)到普通PCR的1/10~1/100的拷貝數(shù)!這本來(lái)是稍微知道這種方法學(xué)人的基本常識(shí),明明恒溫技術(shù)靈敏度和反應(yīng)時(shí)間上,并不輸給PCR。不知道為何他們要故作高深用兩種計(jì)算方法來(lái)駁倒一種常識(shí),真是貽笑大方!
友情提示:
目前,PCR技術(shù)的檢測(cè)下限一般在500~1000拷貝數(shù)/毫升,這意味著每20微升的樣本(大概一滴血的量)中至少要包含10-20個(gè)新冠病毒核酸分子,PCR技術(shù)才能發(fā)現(xiàn)病毒的蹤跡,如果病毒核酸低于檢測(cè)下限就會(huì)產(chǎn)生假陰性。
其實(shí)有一種解釋?zhuān)麄兛赡芫蜎](méi)有弄懂恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的核心原理,實(shí)在的說(shuō)這也情有可原,畢竟這個(gè)技術(shù)在國(guó)內(nèi)的認(rèn)知程度不高,包括很多科班出身的人由于都是接受傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增技術(shù)訓(xùn)練,很容易形成思維慣性,他們甚至很好奇不用變性退火延伸如何進(jìn)行擴(kuò)增,小編在寫(xiě)這篇文章之前也是這種狀態(tài),但是不懂沒(méi)關(guān)系,我們可以重新去認(rèn)知和學(xué)習(xí),不要有屁股思維,為了賣(mài)你家的產(chǎn)品就如此大力低貶低別人家產(chǎn)品,華大智造叫板CDC的利弊分析,臭棋還是妙棋?華大公開(kāi)叫板中國(guó)疾控中心伸張正義,難道它就是傳說(shuō)中的圣母?不信可以看看,這是他們的一貫套路,還是那句話(huà),千萬(wàn)別信他們的動(dòng)機(jī)有多么的白蓮花,以為是愛(ài)國(guó)圖強(qiáng),其實(shí)他們是商人,看清楚這點(diǎn)本質(zhì)就好,他們所有的包裝,公益義演也罷,科普達(dá)人也罷都是最終服務(wù)于他們自家的產(chǎn)品!
等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)流派分析
等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)按照擴(kuò)增目的可以劃分為特異性擴(kuò)增和非特異性擴(kuò)增兩類(lèi)。特異性擴(kuò)增技術(shù)按其技術(shù)流派包括Recombinase polymerase amplification (RPA),Nicking enzyme amplification(NEAR),中文翻譯為“切口酶擴(kuò)增反應(yīng)”,也被成為“指數(shù)擴(kuò)增反應(yīng)”(就是本文主角雅培ID NOW COVID-19的技術(shù)原理),還有Nucleic acid sequence-based amplification(NASBA), TMDA , Rolling circle amplification(RCA)以及Loop-mediated isothermal amplification(LAMP)等等眾多流派?。ㄒ韵聝?nèi)容整理出處為知乎達(dá)人胡漢三)
TwistDx公司的RPA技術(shù)(已被雅培收購(gòu))
重組酶聚合酶擴(kuò)增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),具體原理不再介紹。2006年發(fā)明,到目前為止尚未開(kāi)發(fā)出成熟的臨床應(yīng)用系列產(chǎn)品,主要用于科研,涉及的領(lǐng)域,病原體檢測(cè)、動(dòng)植物檢測(cè)都有。
官網(wǎng)下摘錄的中文介紹
RPA 非??焖?,在 37-42°C 這一通常最適宜的反應(yīng)溫度下,只需少量核酸分子即可在 3-10 分鐘(通常)內(nèi)擴(kuò)增至可檢出水平,但這將取決于靶標(biāo)大小。在大部分情況下,只需要一個(gè)人即可在半小時(shí)內(nèi)采集樣本、制備樣本、運(yùn)行檢測(cè)并取得結(jié)果,并且無(wú)需專(zhuān)業(yè)培訓(xùn)。
RPA專(zhuān)利是屬于 Dr. Niall Armes 聯(lián)合 Dr. Derek Stemple 和 Dr. Nagesh Mahanthappa 創(chuàng)辦的 TwistDx Inc。公司最早成立于麻省的劍橋,之后2002年在英國(guó)劍橋成立 TwistDx Limited。TwistDx于2010年被Alere收購(gòu)。之后在2017年雅培通過(guò)收購(gòu)Alere獲得可RPA技術(shù)的專(zhuān)利。
Ionian Technologies Inc.公司的NEAR技術(shù)(已被雅培收購(gòu))
NEAR是 Ionian Technologies Inc. 的技術(shù),是基于NEAR(Nicking enzyme amplification reaction,切口酶擴(kuò)增反應(yīng)技術(shù))。Ionian是加州的初創(chuàng)公司,成立于2000年,和上面成立于麻省劍橋的TwistDx Inc. 很接近,兩者又都在2010年被Alere收購(gòu)。而后Alere在2017年被雅培收購(gòu),NEAR和RPA技術(shù)都成為雅培的專(zhuān)利。兩者的路線(xiàn)發(fā)展時(shí)間線(xiàn)比較相近,Nicking Enzyme 或者叫 Nicking endonuclease, 中文名叫切口酶或者缺口酶 。與常見(jiàn)的核酸內(nèi)切酶不同的是,切口酶識(shí)別特定序列以后只切開(kāi)一條鏈。從病毒核酸序列上切下特定短序列(8-16個(gè)堿基)的單鏈以后,利用恒溫?cái)U(kuò)增的DNA聚合酶(isothermal amplification chemistry 專(zhuān)利中未具體描述)。又因?yàn)闇囟缺3衷?0℃左右,合成的短序列自動(dòng)解旋成為兩個(gè)單鏈,于是這兩個(gè)單鏈又分別作為恒溫?cái)U(kuò)增酶的模板進(jìn)一步擴(kuò)增。在短時(shí)間內(nèi),只要原料和能量充足,這個(gè)擴(kuò)增反應(yīng)是指數(shù)速率的。而且由于不需要經(jīng)過(guò)升溫和降溫的過(guò)程,相比傳統(tǒng)的PCR過(guò)程,速度上的優(yōu)勢(shì)是肉眼可見(jiàn)的。新合成的短序列單鏈之后與帶有熒光的引物結(jié)合,從而通過(guò)熒光來(lái)定量分析。當(dāng)熒光達(dá)到一定強(qiáng)度,認(rèn)定相應(yīng)的病毒DNA達(dá)到一定含量,認(rèn)定為陽(yáng)性。ID NOW設(shè)定的閾值是5分鐘觀察,5分鐘如果達(dá)到閾值,則報(bào)告為陽(yáng)性;如果5分鐘未達(dá)到,則繼續(xù)觀察,在13分鐘前達(dá)到閾值,也報(bào)告為陽(yáng)性;13分鐘時(shí)仍未到達(dá)閾值的,報(bào)告為陰性。這個(gè)技術(shù)相比其他的核酸檢測(cè)方法,優(yōu)勢(shì)在于速度和靈敏度(初始只需要數(shù)百個(gè)病毒拷貝);缺點(diǎn)在于短序列的設(shè)計(jì)存在高假陽(yáng)性的可能。
最后用我們網(wǎng)紅醫(yī)生張文宏主任的一段話(huà)做結(jié)!
張文宏醫(yī)生:“之所以成為世界上醫(yī)療體系最強(qiáng)大的國(guó)家,就是因?yàn)樗兄澜珥敿獾尼t(yī)療技術(shù)。舉個(gè)簡(jiǎn)單例子,美國(guó)12天已經(jīng)更新了6代病毒的檢測(cè)試劑。最初的檢測(cè)時(shí)間是2天,然后縮短為1天,又縮短為6小時(shí)。之后又減少到3.5小時(shí)和1.5小時(shí),現(xiàn)在的檢測(cè)只需要5分鐘,而且準(zhǔn)確率都超過(guò)95%。“
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