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打開(kāi)遺傳學(xué)大門(mén)—華人科學(xué)家解密精神分裂的高?;?/div>

范德堡大學(xué)分子生理學(xué)和生物物理系和范德堡遺傳學(xué)研究所(VGI)的科學(xué)家們利用他們開(kāi)發(fā)的一種獨(dú)特的統(tǒng)計(jì)模型,確認(rèn)出104個(gè)精神分裂癥的高?;颉?/span>

這項(xiàng)于4月15日發(fā)表在《自然-神經(jīng)科學(xué)》雜志上的研究,支持了精神分裂癥是一種發(fā)育性疾病的觀點(diǎn)。這種疾病有可能在癥狀出現(xiàn)之前就被及時(shí)發(fā)現(xiàn),甚至接受治療。

圖片來(lái)源:nature.com

精神分裂癥是一種慢性、嚴(yán)重的精神障礙。常見(jiàn)的病癥有:幻覺(jué),妄想,刻板缺少起伏的情緒表達(dá)和認(rèn)知障礙等。癥狀起病通常開(kāi)始于16到30歲之間??咕癫∷幬锟梢跃徑馄浒Y狀,但目前沒(méi)有治愈這種疾病的方法。

遺傳基因?qū)W在決定精神分裂癥的患病幾率上起著重要作用。雖然只有1%的人口患有精神分裂癥,但如果同卵雙胞胎中一方患有該病,另一方患病風(fēng)險(xiǎn)急劇上升到50%。

最近的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)已經(jīng)確定了100多個(gè)與精神分裂癥相關(guān)的基因位點(diǎn)座或不同染色體上的固定片段固定位置。然而,這些基因位點(diǎn)座可能不是高風(fēng)險(xiǎn)基因所在的位置。因?yàn)檫@些基因位點(diǎn)座可能發(fā)揮著調(diào)節(jié)附近或者遠(yuǎn)距離較遠(yuǎn)的基因的活性的作用。

為了解決這一問(wèn)題,論文的高級(jí)通訊作者Bingshan Li博士與論文第一作者、分子生理學(xué)和生物物理學(xué)研究導(dǎo)師員 Rui Chen博士以及博士后研究員 Quan Wang博士共同開(kāi)發(fā)了一個(gè)獨(dú)特而巧妙的貝葉斯模型,名為“iRIGS(integrative RIsk Gene Selector),以整合高通量多組學(xué)數(shù)據(jù)和基因相互作用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行以基因?yàn)橹行牡慕y(tǒng)計(jì)推斷。

這個(gè)模型框架根據(jù)多維度的基因組數(shù)據(jù)和基因網(wǎng)絡(luò),從之前確定的基因位點(diǎn)座中選出最可能的基因。哪些基因突變率高?哪些是產(chǎn)前表達(dá)的?這些問(wèn)題是該計(jì)算框架統(tǒng)計(jì)模型為了確定和縮小精神神經(jīng)分裂癥高?;蜃稽c(diǎn)范圍會(huì)所提出的問(wèn)題。

通過(guò)計(jì)算,研究人員確定了104個(gè)高風(fēng)險(xiǎn)基因,其中一些基因編碼的蛋白質(zhì)是被用于其他疾病的上市藥物的目標(biāo)靶蛋白。其中一個(gè)基因被懷疑參與自閉癥譜系障礙的發(fā)展。

Chen博士說(shuō):“精神分裂癥和自閉癥有相同的基因。我們的框架統(tǒng)計(jì)模型可以推動(dòng)GWAS向前邁出一步,進(jìn)一步識(shí)別基因。 它也可以用來(lái)幫助追蹤其他復(fù)雜疾病的有關(guān)基因?!?/span>

Li博士說(shuō):“這個(gè)計(jì)算框架為幾個(gè)研究方向打開(kāi)了大門(mén)。一個(gè)方向是確定已經(jīng)批準(zhǔn)用于其他無(wú)關(guān)疾病的藥物是否可以重新用于改善精神分裂癥的治療。另一個(gè)方向是找出這些高?;蛟诖竽X中哪些類(lèi)型的細(xì)胞的發(fā)育過(guò)程中是活躍的。”Li 博士是分子生理學(xué)和生物物理學(xué)副教授,同時(shí)也是VGI的一名研究人員。 

Li博士最后補(bǔ)充說(shuō):“我認(rèn)為我們將更好地了解這些基因在出生前是如何誘發(fā)精神分裂癥的風(fēng)險(xiǎn)。這將給我們?nèi)绾沃贫ǜ深A(yù)策略起到提示作用。這是一個(gè)野心勃勃的目標(biāo)……(但是)通過(guò)了解機(jī)制,藥物開(kāi)發(fā)可以更有針對(duì)性?!?/span>

文章來(lái)源:

https://neurosciencenews.com/high-risk-schizophrenia-genes-12021/

參考文獻(xiàn):

“A Bayesian framework that integrates multi-omics data and gene networks predicts risk genes from schizophrenia GWAS data”

Quan Wang, Rui Chen, Feixiong Cheng, Qiang Wei, Ying Ji, Hai Yang, Xue Zhong, Ran Tao, Zhexing Wen, James S. Sutcliffe, Chunyu Liu, Edwin H. Cook, Nancy J. Cox & Bingshan Li. Nature Neuroscience(2019) doi:10.1038/s41593-019-0382-7

作者信息

 

編譯:coco(brainnews創(chuàng)作團(tuán)隊(duì)成員)

校審/排版:Simon (brainnews編輯部)

題圖neurosciencenews.com

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