近40年前,人類原癌基因首次揭開了神秘的面紗:RAS基因作為第一個(gè)被確認(rèn)的人類癌癥元兇,最早在兩種鼠肉瘤病毒中被發(fā)現(xiàn),并于上世紀(jì)80年代初被確認(rèn)與導(dǎo)致人類膀胱癌的基因相同。這一發(fā)現(xiàn)為人類腫瘤機(jī)制研究帶來了革命性影響。該基因進(jìn)化保守且機(jī)制、結(jié)構(gòu)特殊,超過30%癌癥患者體內(nèi)都會(huì)表達(dá)該基因突變。數(shù)十年來,科學(xué)家已就EGFR、BCL等常見原癌基因,開發(fā)了數(shù)代抑制劑類靶向藥物;但上市新藥中, RAS靶向抑制劑的身影卻依然缺位。
就在2019開年之際,生物新銳Mirati Therapeutics傳來好消息,其原創(chuàng)新藥MRTX849正是靶向RAS家族特定突變體KRAS G12C蛋白,目前該項(xiàng)目管線已進(jìn)入1/2期臨床試驗(yàn),治療攜帶相關(guān)基因突變的晚期實(shí)體瘤患者。
▲Mirati藥物研發(fā)副總裁Matthew Marx博士
探秘史上最難成藥的原癌基因堡壘
美國科學(xué)院院士、細(xì)胞療法教父Carl June教授曾在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》撰文,他將突變的RAS基因描述為一種神奇的藥物靶標(biāo),因?yàn)?strong>該突變廣泛表現(xiàn)于多種腫瘤組織,且多發(fā)生于癌癥早期;但長期以來,相關(guān)小分子靶向藥、抗體藥、疫苗的研發(fā)卻挑戰(zhàn)重重,因此他認(rèn)為在過去很長的時(shí)間內(nèi),RAS家族是一種“不可成藥的蛋白(The Undruggable RAS)”。
RAS(Rat Sarcoma)家族蛋白廣泛表達(dá)于各類真核生物,有兩種表現(xiàn)形式:非激活狀態(tài)下GDP(二磷酸鳥苷)結(jié)合形式和激活狀態(tài)下的GTP(三磷酸鳥苷)結(jié)合形式。RAS蛋白正是通過兩種表現(xiàn)形式之間的切換,來調(diào)控包括RAF-MEK-ERK、PI3K/Akt/mTOR在內(nèi)的多個(gè)下游通路,從而影響細(xì)胞的生長和分化,以及腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。RAS基因在胰腺癌、結(jié)直腸癌、非小細(xì)胞肺癌等多種癌細(xì)胞中突變率極高,還會(huì)使患者對(duì)其他靶向藥物產(chǎn)生耐藥性。
對(duì)于RAS蛋白的突變形式和信號(hào)通路研究,近年來分子生物學(xué)已取得重大進(jìn)展,然而開發(fā)相關(guān)的靶向藥物卻依然挑戰(zhàn)重重。在化學(xué)藥開發(fā)方向,由于RAS蛋白結(jié)構(gòu)平滑,其表面結(jié)合小分子的疏水性口袋并不明顯;在生物藥開發(fā)方向,抗體藥穿透細(xì)胞膜靶向RAS蛋白,藥物遞送效率也有很大的提升空間。所以不少研究者曾試圖另辟蹊徑,希望研究藥物抑制RAS蛋白與SOS1或RAF等下游信號(hào)蛋白的結(jié)合等,然而相關(guān)研究合成的先導(dǎo)化合物與RAS蛋白親和性卻不盡人意。
目前人們發(fā)現(xiàn)RAS家族蛋白主要分為三大類:KRAS、HRAS、NRAS,其中的KRAS突變比例超過80%,多數(shù)KRAS基因突變發(fā)生于12號(hào)密碼子。Mirati藥物研發(fā)副總裁Matthew Marx博士表示:“MRTX849的靶標(biāo)正是KRAS G12C突變蛋白,該突變?cè)诜伟?、尤其是非小?xì)胞肺癌中比例較大(14%);此外還在一些結(jié)直腸癌(4%)、胰腺癌(2%)患者體內(nèi)表達(dá)。在美國癌癥人群中,該基因突變發(fā)生率甚至大于ALK、RET、TRK基因突變總和,因此相關(guān)病患人群中存在重大未滿足的醫(yī)學(xué)需求。”
千里挑一:超級(jí)小分子共價(jià)結(jié)合“不可成藥蛋白”
面對(duì)KRAS蛋白成藥性的難點(diǎn),Mirati從基礎(chǔ)科學(xué)的最新進(jìn)展中找到了突破口。Matthew Marx博士回憶起最初找到新發(fā)現(xiàn)的驚喜:“加州大學(xué)舊金山分校Kevan Shokat教授,曾帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)在知名刊物發(fā)表論文,驗(yàn)證特殊化合物可通過共價(jià)鍵綁定KRAS G12C突變蛋白。由此啟發(fā),我們通過進(jìn)一步研究證實(shí)Kevan Shokat團(tuán)隊(duì)的發(fā)現(xiàn),可通過共價(jià)化合物靶向KRAS突變基因12號(hào)密碼子編碼的半胱氨酸,并填滿II號(hào)分子開關(guān)區(qū)域一個(gè)可擴(kuò)張的疏水結(jié)合口袋,被綁定的KRAS G12C突變體會(huì)被不可逆地鎖定在失活狀態(tài),從而阻斷依賴該蛋白的信號(hào)通路和癌細(xì)胞生存能力。”
▲KRAS G12C抑制劑成藥機(jī)制(圖片來源:Mirati官網(wǎng))
從學(xué)術(shù)成果到可驗(yàn)證的實(shí)驗(yàn)?zāi)P?,再到最終實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的成果,是一個(gè)漫長又充滿挑戰(zhàn)的過程。Matthew Marx博士表示要對(duì)靶蛋白實(shí)現(xiàn)高效、特異性的結(jié)合效果,必須要尋找分子量較大的化合物,同時(shí)還要保證優(yōu)秀的成藥性:“我們要在與靶蛋白結(jié)合的親和力、反應(yīng)性、選擇性和藥代動(dòng)力學(xué)屬性等各個(gè)方面達(dá)到平衡,還要保證該化合物的高特異性,不會(huì)綁定其他蛋白從而避免脫靶毒性。而從學(xué)術(shù)研究到臨床轉(zhuǎn)化的道路上,Matthew Marx博士肯定了藥明康德研究服務(wù)部藥物研發(fā)國際服務(wù)部(IDSU)和化學(xué)服務(wù)部(CSU)團(tuán)隊(duì)為MRTX849化學(xué)合成做出的努力與貢獻(xiàn)。
2017年底,Mirati鑒定出兩個(gè)臨床前候選藥物(Preclinical candidate),藥明康德IDSU武漢FTE-Mirati團(tuán)隊(duì)協(xié)助合作伙伴,為關(guān)鍵的動(dòng)物毒理實(shí)驗(yàn)各合成80克化合物,其中一款被成功選中推入臨床?!皬奶崦R床前候選藥物到該項(xiàng)目最終進(jìn)入臨床試驗(yàn)僅歷時(shí)1年左右,”Matthew Marx博士說道:“這也得益于藥明康德測(cè)試事業(yè)部旗下,專門針對(duì)新藥臨床前研究項(xiàng)目成立,整合了臨床前一體化分析測(cè)試服務(wù)的WIND(WuXi IND)平臺(tái)。”
▲非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌患者體內(nèi)KRAS和
▲非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌患者體內(nèi)KRAS和KRAS G12C蛋白突變比例分析(圖片來源:Mirati官網(wǎng))
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