為生物固氮成為新型氮肥來源提供可能
Jeremy在實(shí)驗(yàn)室。中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心供圖
■記者 秦志偉 ■黃辛
根瘤被稱為豆科植物的“固氮工廠”,反映豆科植物與固氮根瘤菌的共生關(guān)系。豆血紅蛋白(又稱共生血紅蛋白)存在其中,是根瘤中調(diào)節(jié)氧氣濃度的“開關(guān)”,氧氣是豆科植物和根瘤菌呼吸必需的,但根瘤菌中的固氮酶更喜歡低氧環(huán)境,“氧氣悖論”就產(chǎn)生了。這一悖論始終懸而未決,也就是說,迄今為止有關(guān)根瘤內(nèi)豆血紅蛋白基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制仍不清楚。
10月29日,中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(以下簡稱分子植物卓越中心)Jeremy Dale Murray團(tuán)隊(duì)成功破解固氮“氧氣悖論”,他們首次發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子NLP家族調(diào)控根瘤中豆血紅蛋白基因表達(dá)的分子機(jī)制。研究成果發(fā)表于《科學(xué)》。
“氧氣悖論”懸而未決
在自然界,植物生長除了需要外界氮肥外,也會“自給自足”。如大豆等豆科植物,它們和細(xì)菌互利共生固氮,自我施肥。這就是豆科植物與固氮根瘤菌的共生關(guān)系產(chǎn)生的結(jié)果。
“氧氣悖論”的產(chǎn)生要從“固氮工廠”根瘤說起。在其中,固氮作用的執(zhí)行者是類菌體。類菌體內(nèi)的固氮酶可“搖身一變”,將空氣中的氮?dú)廪D(zhuǎn)變?yōu)橹参锟衫玫陌?。與此同時,豆科植物可提供根瘤菌需要的碳水化合物,從而使豆科植物和根瘤菌實(shí)現(xiàn)互惠互利。
然而,固氮反應(yīng)過程需要消耗大量能量。對豆科植物來說,這一“交換”是昂貴的。
更為關(guān)鍵的是,“固氮酶對氧氣高度敏感,需要在低氧環(huán)境下才能工作,但宿主細(xì)胞和根瘤菌本身的呼吸又需要大量氧氣”。Jeremy告訴《中國科學(xué)報(bào)》,為了同時滿足固氮酶、宿主細(xì)胞與根瘤菌的不同需求,根瘤細(xì)胞通過合成大量的豆血紅蛋白來調(diào)節(jié)氧氣濃度。
“豆血紅蛋白類似人體血液中的血紅蛋白,包含血紅素和蛋白質(zhì)?!盝eremy進(jìn)一步解釋道。結(jié)合了鐵元素的血紅素在氧氣濃度過高時可與氧氣結(jié)合,進(jìn)而降低氧氣含量;而在氧氣不足時,豆血紅蛋白可以將氧氣釋放給類菌體供其呼吸。
值得一提的是,豆血紅蛋白使根瘤呈現(xiàn)粉紅色?!斑@就解釋了豆科植物的根瘤為什么是粉紅色的。”論文第一作者、分子植物卓越中心助理研究員姜蘇育告訴《中國科學(xué)報(bào)》。
已有研究表明,豆血紅蛋白的含量和組分直接影響根瘤內(nèi)固氮酶的活性,并使其在豆科植物生物固氮中發(fā)揮關(guān)鍵作用。其實(shí),生物固氮研究已有上百年的歷史,但迄今為止有關(guān)根瘤內(nèi)豆血紅蛋白基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制仍不清楚。
為根瘤菌找到“舒適的家”
Jeremy團(tuán)隊(duì)把目標(biāo)瞄準(zhǔn)了NLP。NLP家族是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,它能夠結(jié)合靶基因啟動因子中的特殊“元件”,即硝酸鹽響應(yīng)元件(NRE),進(jìn)而激活下游基因的表達(dá),參與調(diào)節(jié)植物氮代謝過程。他們研究發(fā)現(xiàn),NLP家族中的兩個成員NLP2和NIN在根瘤中具有“高人一等”的表達(dá)量。
“在對NLP2突變體根瘤進(jìn)行分析時意外發(fā)現(xiàn),當(dāng)植物缺少NLP2后,豆血紅蛋白的表達(dá)也受到了影響,并具有比野生型更淺的粉紅色?!苯K育說。
Jeremy進(jìn)一步解釋道,NLP2突變體根瘤中的豆血紅蛋白和血紅素水平顯著降低,這就解釋了為什么突變體根瘤粉紅色較淺?!耙?yàn)橥蛔儼l(fā)生在轉(zhuǎn)錄因子中,這是一種可以啟動其他因子表達(dá)的蛋白質(zhì)?!币虼怂麄儾聹y,這個基因可能會激活豆血紅蛋白的表達(dá)。
然后,研究團(tuán)隊(duì)對不同種類豆科植物的豆血紅蛋白基因分析發(fā)現(xiàn),一個DNA序列存在于所有豆血紅蛋白基因啟動子中,他們稱為雙重硝酸鹽響應(yīng)元件(dNRE)。NLP2“認(rèn)出”dNRE,調(diào)控豆血紅蛋白的表達(dá),從而平衡固氮所必需的氧氣微環(huán)境,也就是說為根瘤菌找到了“舒適的家”。
Jeremy認(rèn)為,dNRE和NLP2僅在豆科植物中高度保守,暗示著其進(jìn)化有助于提高根瘤中豆血紅蛋白的表達(dá)水平。而非共生血紅蛋白在植物體內(nèi)清除氧氣方面起著重要作用,有助于植物在低氧環(huán)境下生存。這也為水稻、玉米等非豆科植物實(shí)現(xiàn)自主固氮的研究提供了新見解。
Jeremy團(tuán)隊(duì)成功破解豆科植物固氮“氧氣悖論”,為生物固氮成為新型氮肥來源提供了可能,對節(jié)約農(nóng)業(yè)生產(chǎn)成本和生態(tài)環(huán)境保護(hù)具有重要意義。
Jeremy于2017年全職加入分子植物卓越中心。其團(tuán)隊(duì)同時隸屬于中國科學(xué)院與英國約翰·英納斯中心合作共建的國際聯(lián)合單元植物和微生物科學(xué)聯(lián)合研究中心。
該研究得到中國科學(xué)院基礎(chǔ)研究青年科學(xué)家項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金、國家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、中國科學(xué)院先導(dǎo)科技專項(xiàng)和國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的資助。
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