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從一篇預測模型文章學習nomogram列線圖

文章題目是:使用Nomograms預測接受聯(lián)合細胞毒性化療作為一線治療的不可切除或轉(zhuǎn)移性胃癌患者的生存率。研究的對象是949例化療的胃癌患者,觀察終點是1年后患者的生存情況。使用的方法是Cox生存分析,預測模型的展示方法是nomogram列線圖。


   圖一:Flowchart 流程圖

我們還是從圖表的角度剖析這篇文章。第一個圖是大家最熟悉的流程圖,流程圖的重要性就不在強調(diào)了,幾乎每篇文章必備。文章收集了2001年到2006年共計1327例接受化療的胃癌患者。排除328人,剩余949人進入Cox模型。


   一:研究人群描述

如果說圖一看不出什么端倪,那么從表一開始,這篇文章的獨特之處就可以顯現(xiàn)出來了:作者把人群分成了2組,一組是基線列線圖人群,一組是基于化療反應列線圖人群。


這是什么意思呢?作者整篇文章共做了2個預測模型,一個是基于患者化療之前的危險因素進行預測,另一個則是化療開始后9周觀察到患者對化療初期反應之后的因素進行預測。

換句話說,當一個胃癌患者來了之后,首先可以通過基線數(shù)據(jù)進行風險評估預測,決定是否進行接受聯(lián)合細胞毒性化療?;颊呋熤?,可以通過初期化療反應再次進行評估,決定是否繼續(xù)化療。兩個模型結(jié)合為醫(yī)生提供化療決策的幫助。


其實這個時候作者的思路就已經(jīng)顯現(xiàn)出來了,這也是文章的核心亮點,可以猜想,作者下面的內(nèi)容則是圍繞2個模型進行書寫,我們繼續(xù)往下看。


   表二預測因子篩選

表二是文章的重要內(nèi)容:納入列線圖的危險因素,這里展示了預測模型用到的變量,同時展示了每個危險因素的HR風險比。

預測模型的難點在于預測因子的篩選,很多同學都在苦惱用什么原則選擇,這篇文章則描述的非常清楚,大家可以學習。簡單概述一下:文章首先使用基礎(chǔ)模型和年齡調(diào)整模型進行單因素分析,定義出來潛在的危險因素,然后使用前進、后退、逐步分析方法在多因素模型中篩選出了最佳模型。在使用這些方法的時候,一類錯誤α的取值為0.20,也就是p<>

同時,在這個表中最下面一列,展示出來2個模型的最大差異之處:化療后9周之內(nèi)的反應?;€nomogram中沒有這個變量,基于化療反應的nomogram則使用了這個變量。


   圖二nomogram列線圖

最后一步就是展示列線圖了,有了前面表二的鋪墊,圖二分別展示了2個模型的nomogram,1個基于基線資料預測,1個基于化療后初期反應預測,一切水到渠成。文章沒有再放ROC曲線,直接列出了2個模型的C-index分別是0.656(95CI%,0.628-0.673)和0.718(95CI%,0.694-0.741)



   圖四、表三:校準曲線和風險分層

最后的圖和表作為文章的輔助材料,我一并放出來。一個是列線圖的校準曲線,校準曲線是實際風險和預測風險的對比曲線約接近對角線,說明預測效果越好。

第二個圖則是按照風險大小進行分層,分別展示了每組的人數(shù)和中為生存時間,從側(cè)面說明了不同風險值患者的實際生存情況,讓大家對生存時間有更直接的認識。

以上就是這篇文章的全部內(nèi)容啦,我們簡單整理一下思路:作者通過對醫(yī)院現(xiàn)有化療患者數(shù)據(jù)進行挖掘,建立了2個模型:一個是在化療開始前進行預后評估,另一個是在化療初期,通過化療反應進行預后評估。2個模型是文章的最大亮點,nomogram作為載體展示了預測模型的結(jié)果,較為新穎。


科室特色疾病數(shù)據(jù)的挖掘是一種非常常見的思路來源,也是大家最容易掌握的臨床科研方法。因此,如果條件允許,強烈建議大家把專病資料整理起來,后期進行挖掘分析。易侕團隊有一個這樣的工具,易侕EDC

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