《倚云軒醫(yī)集》又稱《倚云軒醫(yī)案醫(yī)話醫(yī)論》，包括《醫(yī)案》三卷，《醫(yī)話》三卷，《醫(yī)論》二卷，共計(jì)八卷合編，是清末民初醫(yī)學(xué)家方仁淵撰于清光緒二十五年（1899年）的手稿。作者曾整理其師王泰林的《王旭高臨證醫(yī)案》四卷于1898年出版，但他本人的這部書稿一直未能付梓。醫(yī)界知曉《倚云軒醫(yī)集》價(jià)值珍貴，遂于上世紀(jì)50年代將此稿本獻(xiàn)于剛成立的中醫(yī)研究院圖書館典藏。原稿頗零亂，現(xiàn)經(jīng)中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院信息研究所李洪濤等人系統(tǒng)整理后得以影印面世，收入《中醫(yī)古籍孤本大全》。
作者方仁淵，字耕霞，號(hào)倚云，別號(hào)思梅，江陰顧山鎮(zhèn)人，生于清道光二十四年（1844年），卒于民國(guó)十四年（1925年），享年八十二歲。先受業(yè)于無錫名醫(yī)王壽林（旭高）又從江南名醫(yī)邵杏泉先生。兩位醫(yī)家精于運(yùn)氣之學(xué)，方仁淵盡得其傳。
光緒初年，方仁淵移居常熟懸壺于城內(nèi)，名“倚云醫(yī)館”，其書齋曰“倚云吟館”。光緒庚辰年（1880年），歲值太陽寒水司天，太陰濕土在泉，民病多寒濕，方仁淵以溫燥辛開之劑，無不應(yīng)手，因而醫(yī)名鵲起。求醫(yī)者繼踵相接，遇有疑難危證，必竭力挽救。方仁淵對(duì)中醫(yī)學(xué)發(fā)展極為關(guān)注，民國(guó)十一年（1922年），為抗議國(guó)民政府內(nèi)務(wù)部頒布的旨在逐漸取締中醫(yī)的《管理醫(yī)士暫行規(guī)則》，他被選為常熟醫(yī)學(xué)會(huì)會(huì)長(zhǎng)，共議對(duì)策，并創(chuàng)辦《常熟醫(yī)學(xué)會(huì)月刊》出刊凡26期，為常熟縣醫(yī)學(xué)期刊之首創(chuàng)。其醫(yī)學(xué)著作除本書外，還有《新編湯頭歌訣》、《舌苔歌》等。
《倚云軒醫(yī)案》三卷完成于清光緒二十五年（1899年），包括外感寒熱、內(nèi)傷雜病、婦科疾患等18個(gè)門類的220個(gè)醫(yī)案，均采用扼要順敘式的書案方式，對(duì)其疑難者，有的案?jìng)?cè)竟一診、二診、三診，直記到十五診，患者病愈而案止。方仁淵先生辨證論治的技巧和思維方式均展現(xiàn)于他的醫(yī)案中。他又在案中把學(xué)習(xí)同道的有卓效方劑附于案中，例如第195案陸某，醫(yī)案之后記載了白喉吹方圣藥——鳳衣散。在220案后，又記有六則方論，即《喉癥備用方論》、《王應(yīng)懷梅毒搽藥方》、《沐泰山珠黃十寶丹》、《珠黃化毒散》、《種牛痘須知》、《調(diào)經(jīng)》。其后的《診余記事》也是28則醫(yī)案，采取敘述附案式的寫法。
《倚云軒醫(yī)話》三卷完成于清光緒三十四年（1906年），是時(shí)他已63歲，他深感年已花甲、未能十全，古今書籍雖未盡觀，于臨證之際，有些疾患尚不能拿穩(wěn)，自感精神衰老，不能再進(jìn)學(xué)業(yè)，愿來世仍為醫(yī)士，逐自作一挽聯(lián)于書眉。
“可憐身入紅塵，苦辛歷盡，志未成，學(xué)醫(yī)未濟(jì)世，安貧行我素，不學(xué)仙，不倭佛，惟望將來再為醫(yī)生。
從此魂歸碧落，色相皆空，登山可御見、玩水可乘云，壯志盡消磨，生無怨，死無恨，尚留空愿負(fù)于后人?！?/p>
數(shù)日后他對(duì)此聯(lián)又行修改，尾于引言之后：
“讀書不為世用，學(xué)醫(yī)未盡濟(jì)人，碌碌人寰，不學(xué)仙，不倭佛，惟愿來生，再為醫(yī)士。遇事不敢驕矜，立身惟求愈恭，茫茫無壤，生無怨，死無憾，要留耕地付于后人?！?/p>
甫稿與定稿可為獨(dú)立的二首挽聯(lián)，是方仁淵先生的名志，也是他著述的緣起。
《醫(yī)話》內(nèi)容豐富，有記述當(dāng)世醫(yī)學(xué)流變者，有評(píng)論各家學(xué)說者，有臨證和讀書心得者，有討論醫(yī)理藥用和治驗(yàn)者，更有醫(yī)籍的點(diǎn)評(píng)和精論。如在《中權(quán)居士誚前醫(yī)各派》的一則，當(dāng)時(shí)報(bào)牌曾登載署名中權(quán)居士的文章，譏誚當(dāng)時(shí)醫(yī)人中有看相的流弊，同時(shí)闊論明清醫(yī)學(xué)有溫補(bǔ)派、信古派和江湖派三派，其言娓娓，對(duì)三派皆有貶意。對(duì)此，方仁淵在醫(yī)話中寫道：“因?qū)儆懈杏谥卸l(fā)，但不知據(jù)彼意見須知何而后可夫？古人之言固有是有非，在讀書者胸有成竹，去短取長(zhǎng)乃為有益，彼已成名而至何必如此痛倒之，其狂亦可想見，況如喻葉吳三公，開辟溫?zé)嶂迹卺t(yī)學(xué)不為無功，今刻求此等人已不易得，又安可底訾乎！”對(duì)讀注仲景書和錯(cuò)簡(jiǎn)派攻訐王叔和，方仁淵提出了披堅(jiān)執(zhí)銳之見：“余讀仲師《傷寒論》、《金匱》注釋，幾數(shù)十家言，人人殊不知究竟何者為是，恨不能起仲師而問之。論者每疵王叔和撰次之非。夫叔和與仲師，相隔不過百十年，當(dāng)時(shí)必有原書可證，不至顛倒是非，如后人所云，設(shè)當(dāng)時(shí)無叔和之撰次，不知兩書當(dāng)能陳傳至今日與否，不崇其功、反攻其短，后學(xué)往往如此。且《傷寒》、《金匱》。原久已明白曉暢，后人愈注愈紛愈不明白，即陳修圓之《淺注》，唐容川佩之仍不滿意，再加《補(bǔ)正》，容川亦蹈此弊竇，不知如何而后中皆好名之累也！原后人切勿再注，即彰顯其學(xué)問，盡可自成一書以惠后學(xué)?！闭f得至切至要，十分精辟。
《倚云軒醫(yī)論》包括31論。首篇《五種傷寒論》篇幅長(zhǎng)，論述全面，成書較早。第四論《丁未年占病》，應(yīng)是在丁未即1907年之前占病的，此篇寫作應(yīng)在丁未年之前。第二十三論《張君小兒驚風(fēng)》，是寄給上海周雪樵《醫(yī)學(xué)報(bào)》的文搞，該刊1904年創(chuàng)刊1910年停辦，此文應(yīng)在此段時(shí)間完稿。
方仁淵的《倚云軒醫(yī)集》源出自家在臨證中的感悟和引驗(yàn)。可分為新的見新、辨治體會(huì)和新病新說三方面內(nèi)容。屬于新的見解，諸如《五種傷寒論》、《小兒外感多七情無論》、《兩感溫病論》等。辨治體會(huì)如《溫病誤汗止陰》、《肝胃氣論》等。屬于新病新說如《丹痧今昔不同論》、《煙痢論》等。這些都是作者實(shí)踐中的創(chuàng)新和新知。作者和其他臨床醫(yī)家一樣，很注重搜集民間驗(yàn)方，把自己親驗(yàn)的有效方劑和幾個(gè)可用于急救的方法記錄下來，附列于書的最后，以其實(shí)用性以示人。這也是蒼生大醫(yī)醫(yī)德的展現(xiàn)。方仁淵有子玉祥，世其業(yè)，不幸與仁淵同年卒。侄名君嘉繼其業(yè)，載入《吳中名醫(yī)錄》。
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