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教你繪制繁雜的信號(hào)通路

如此眼花繚亂的信號(hào)通路圖,我能行嗎?

當(dāng)然可以,讀完這篇就OK。


信號(hào)通路是指能將細(xì)胞外的分子信號(hào)經(jīng)細(xì)胞膜傳入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮效應(yīng)的一系列酶促反應(yīng)通路。在基因研究過程中尋找表型背后的可能參與機(jī)制,與細(xì)胞信號(hào)通路密切相相關(guān)。如何尋找以及繪制科研課題相關(guān)的信號(hào)通路圖呢?


一、尋找信號(hào)通路

1
1.打開KEGG網(wǎng)站。舉個(gè)栗子,輸入“p53”


2
點(diǎn)開KEGG PATHWAY下面的map04115,p53 signaling  pathway


3

點(diǎn)擊GO之后進(jìn)入結(jié)果頁(yè)面,首先可以看到p53信號(hào)通路相關(guān)描述:由DNA損傷、氧代謝等過程激活,可以導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯,細(xì)胞凋亡,生長(zhǎng)抑制等


4
點(diǎn)擊map,可以看到P53信號(hào)通路的詳細(xì)信息



二、繪制信號(hào)通路


1

首先,打開Pathway Builder Tool 2.0軟件

2
軟件提供了基本信號(hào)通路的模板,以及預(yù)先設(shè)計(jì)好的信號(hào)通路??梢赃x擇在模板上添加自己需要的分子

3
軟件包含分子生物學(xué)基本元素,如細(xì)胞膜、細(xì)胞器、分子等細(xì)胞生物學(xué)基本元素

4
Pathway Builder Tool 2.0 提供了非常多的選擇,如受體模型、分子模型、化學(xué)結(jié)構(gòu)模型等,可以根據(jù)實(shí)際需要進(jìn)行繪圖

5
含有臨床常用的器官模型、細(xì)胞種類,對(duì)于臨床教材也很實(shí)用

6
當(dāng)然,軟件還含有人體肌肉系統(tǒng)、循環(huán)系統(tǒng)、神經(jīng)系統(tǒng)等解剖圖,適合臨床教材

對(duì)于如此好用的信號(hào)通路繪制軟件如何獲取呢?回復(fù)“信號(hào)通路”,獲取軟件壓縮包。記得回復(fù)哦...









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