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假陽(yáng)性率40%!DTC基因檢測(cè)準(zhǔn)確性遭質(zhì)疑,行業(yè)規(guī)范勢(shì)在必行

近年來(lái),人們對(duì)遺傳學(xué)和個(gè)性化醫(yī)療的興趣日益增加,對(duì)直接面向消費(fèi)者(DTC)基因檢測(cè)的需求也不斷上升,23andMe、Ancestry.com、Family Tree DNA等基因檢測(cè)公司也在為用戶提供相關(guān)服務(wù)。與臨床基因檢測(cè)不同,DTC基因檢測(cè)不具有診斷意義,僅為用戶提供遺傳風(fēng)險(xiǎn)信息。但一些DTC公司仍會(huì)給客戶提供原始基因分型數(shù)據(jù)和免責(zé)聲明,因?yàn)槿绻脩舻腄TC基因檢測(cè)結(jié)果顯示他們攜有與某種疾病相關(guān)的基因變體,醫(yī)生有可能會(huì)根據(jù)這一檢測(cè)結(jié)果要求用戶進(jìn)行進(jìn)行額外的基因檢測(cè)和其他檢查。

早在2009年,英國(guó)人類遺傳學(xué)委員會(huì)就發(fā)布了一套直接面向消費(fèi)者基因檢測(cè)的原則辦法,旨在為消費(fèi)者提供正確指導(dǎo),并引導(dǎo)提供DTC基因檢測(cè)的公司提高檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)和結(jié)果一致性,建議在用戶進(jìn)行檢測(cè)之前和之后提供相應(yīng)的咨詢服務(wù),并考慮用戶私隱問(wèn)題,維護(hù)所有對(duì)DTC基因檢測(cè)感興趣的消費(fèi)者權(quán)益。

2017年4與,美國(guó)FDA已經(jīng)為23andMe的10份遺傳健康風(fēng)險(xiǎn)報(bào)告進(jìn)行上市前授權(quán)。2018年3月6日,F(xiàn)DA批準(zhǔn)了全球首個(gè)直接面向消費(fèi)者的癌癥基因檢測(cè)產(chǎn)品上市申請(qǐng),該產(chǎn)品被允許在沒(méi)有醫(yī)生處方的情況下,向用戶提供3個(gè)特定BRCA突變的基因檢測(cè),這些特定基因突變與乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌的高風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。這一舉動(dòng)也使23andMe成為首個(gè)獲得FDA批準(zhǔn)進(jìn)行癌癥風(fēng)險(xiǎn)篩查的消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè)公司。

盡管各方都在為DTC基因檢測(cè)的進(jìn)一步上市做出各種努力,但人們對(duì)于DTC基因檢測(cè)的準(zhǔn)確性仍存有疑慮,雖然檢測(cè)結(jié)果可能會(huì)在用戶的生活方式、飲食方面產(chǎn)生積極健康影響,但同時(shí)也可能導(dǎo)致不必要的負(fù)面情緒,例如當(dāng)DTC檢測(cè)缺乏全面分析或不準(zhǔn)確時(shí),意外結(jié)果會(huì)給用戶帶來(lái)不必要的失望與焦慮。

近日,來(lái)自Ambry Genetics的研究人員對(duì)DTC檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行了準(zhǔn)確度分析,發(fā)現(xiàn)目前DTC的原始數(shù)據(jù)報(bào)告約40%是錯(cuò)誤的,轉(zhuǎn)介給他們進(jìn)行確認(rèn)檢測(cè)的每五個(gè)樣品中有兩個(gè)是假陽(yáng)性。該結(jié)果已在Genetics in Medicine上發(fā)表。

該文章的第一作者、Ambry遺傳咨詢師Stephany Leigh Tandy-Connor在一份聲明中表示,在這項(xiàng)特定研究中,假陽(yáng)性率如此之高是我們沒(méi)有意料到的,這使我們對(duì)目前DTC基因檢測(cè)的準(zhǔn)確性感到擔(dān)憂。

對(duì)于這一出乎意料的分析結(jié)果,Ambry研究人員甚至查詢了他們的內(nèi)部數(shù)據(jù)庫(kù),以確認(rèn)那些在DTC基因檢測(cè)后轉(zhuǎn)介給他們的病人,發(fā)現(xiàn)在2014至2017年共有49例接受確認(rèn)檢測(cè)的病例,并且多數(shù)為癌癥基因檢測(cè)。這其中一半以上的病例是通過(guò)診所申請(qǐng)等轉(zhuǎn)介給Ambry,而略高于25%的案例來(lái)自DTC的原始數(shù)據(jù)報(bào)告,其余的則來(lái)自第三方基因檢測(cè)服務(wù)。

研究人員表示,Ambry的測(cè)試依賴于Sanger測(cè)序和NGS測(cè)序,DTC公司多采用一系列檢測(cè)方法。Ambry在驗(yàn)證基因檢測(cè)分析證實(shí)了60%的DTC基因檢測(cè)結(jié)果,但其余的均為假陽(yáng)性。驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)中,所有CFTRMEFV變異(分別與囊性纖維化和家族性地中海熱相關(guān))均得到驗(yàn)證,而BRCA變異的驗(yàn)證結(jié)果與種族相關(guān)。

圖:臨床基因檢測(cè)中的假陽(yáng)性變體

研究人員報(bào)告說(shuō),94.1%假陽(yáng)性結(jié)果都與癌癥基因相關(guān)。其中一些是由于基因變體在原始數(shù)據(jù)或第三方口譯服務(wù)中被錯(cuò)誤分類。例如,研究人員指出,五種基因變異(ATM、BRCA1、BRCA2、COL3A1、COL5A1 )被認(rèn)為會(huì)增加最初的基因檢測(cè)風(fēng)險(xiǎn),但Ambry和其他臨床實(shí)驗(yàn)室認(rèn)為其中一些變異是良性的,并且這些變異在普通人群中存在的水平很高,無(wú)法將它們與疾病聯(lián)系起來(lái)。

Tandy-Connor指出,該研究結(jié)果突出了對(duì)DTC基因檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證確認(rèn)的必要性。雖然該研究規(guī)模很小,參與者不到50人,但這可能是因?yàn)榇蠖鄶?shù)人不會(huì)尋求驗(yàn)證性基因檢測(cè)。人們可能會(huì)認(rèn)為DTC為他們提供了準(zhǔn)確的醫(yī)療級(jí)別基因檢測(cè),所以不會(huì)再為確認(rèn)檢測(cè)結(jié)果付費(fèi)。 

盡管驗(yàn)證結(jié)果不甚理想,但仍有部分DTC基因檢測(cè)給人希望,如23andMe首席執(zhí)行官兼聯(lián)合創(chuàng)始人Anne Wojcicki稱,公司提供的DTC基因檢測(cè)結(jié)果與Sanger 測(cè)序的一致性超過(guò)99%,并通過(guò)研究證明,重復(fù)性和可重復(fù)性大于99%,具有極高的準(zhǔn)確性和精確性,并能保證安全性和有效性。同樣根據(jù)Tandy-Connor所指出的,為確保準(zhǔn)確性,該基因檢測(cè)結(jié)果的驗(yàn)證仍需進(jìn)行。

FDA專員Scott Gottlieb也表示,F(xiàn)DA對(duì)于授權(quán)DTC基因健康風(fēng)險(xiǎn)檢測(cè)的策略可能鼓勵(lì)更多的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行DTC基因檢測(cè)的研發(fā)。希望隨著基因技術(shù)的發(fā)展,未來(lái)DTC基因檢測(cè)的準(zhǔn)確性能夠有大幅提升,為那些缺乏疾病家族史、臨床基因檢測(cè)無(wú)法進(jìn)行或者成本過(guò)高、保險(xiǎn)覆蓋率低等原因而無(wú)法進(jìn)行基因檢測(cè)的人們提供一種便利的基因檢測(cè)方式。

政策規(guī)范可以為消費(fèi)者提供正確指導(dǎo),引導(dǎo)DTC基因檢測(cè)公司提高檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)和結(jié)果一致性,因此國(guó)內(nèi)外基因檢測(cè)行業(yè)規(guī)范勢(shì)在必行,而面對(duì)目前國(guó)外已經(jīng)出現(xiàn)的各種問(wèn)題,國(guó)內(nèi)相關(guān)研究可以從中借鑒經(jīng)驗(yàn),進(jìn)而避免走重復(fù)的彎路。

參考文獻(xiàn):

1.FDA Authorizes Direct-to-Consumer Access for Multiple 23andMe Health Risk Tests.

2.Analysis Questions Accuracy of Direct-To-Consumer Genetic Test Results.

3.Oncology Community Sees Potential for Patient Harm in FDA OK of 23andMe BRCA Test

· END ·

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