科研領(lǐng)域的“全才”
2013年11月,在日本京都市的一間大型音樂(lè)廳里,京都獎(jiǎng)的第二十九屆頒獎(jiǎng)典禮如期舉行,美國(guó)科學(xué)院院士、賓夕法尼亞大學(xué)生物學(xué)教授根井正利獲得了其中的基礎(chǔ)科學(xué)獎(jiǎng),以表彰他在分子水平上對(duì)進(jìn)化理論的開(kāi)拓性探索。
京都獎(jiǎng)是一項(xiàng)重量級(jí)的國(guó)際科學(xué)大獎(jiǎng),它由日本企業(yè)家稻盛和夫創(chuàng)立,由日本企業(yè)稻盛集團(tuán)主辦,每年評(píng)選一次,設(shè)置三個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng),分別授予全世界在尖端技術(shù)、基礎(chǔ)科學(xué)和思想藝術(shù)領(lǐng)域做出突出貢獻(xiàn)的三位科學(xué)家或藝術(shù)家,有“日本諾貝爾獎(jiǎng)”之稱(chēng)。每一位京都獎(jiǎng)的獲獎(jiǎng)?wù)呖梢缘玫?000萬(wàn)日元的獎(jiǎng)金,相當(dāng)于300萬(wàn)人民幣。
作為一位美籍日裔獲獎(jiǎng)?wù)?,根井正利的演講被安排為頒獎(jiǎng)典禮的壓軸節(jié)目,日本王妃高圓宮久子、企業(yè)家稻盛和夫以及眾多日本外交官親臨捧場(chǎng)。在眾人的掌聲中,82歲的根井正利緩緩登臺(tái),他用一面巨大的屏幕播放幻燈片,試圖向熱切而尊貴的觀眾展示開(kāi)拓性的研究技術(shù)以及革命性的進(jìn)化理論。這時(shí),根井正利卻遇到了一個(gè)小小的技術(shù)故障——他的幻燈片開(kāi)始隨機(jī)地“前進(jìn)”或“后退”,完全沒(méi)法控制。處理無(wú)果后,根井正利有些尷尬地對(duì)他的觀眾開(kāi)玩笑說(shuō):“我總是追求理論,而不是實(shí)用性”。
其實(shí),在根井正利的整個(gè)科研生涯中,他的“理論”和“實(shí)用性”做得都不錯(cuò)。比如,根井正利早期所做的農(nóng)業(yè)研究就很實(shí)用,后來(lái)他通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)從分子水平上分析生物進(jìn)化的機(jī)制,這又涉及到非常高深的數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)理論。1972年,根井正利發(fā)明了如今仍在被廣泛使用的“根井標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離”計(jì)算公式,可以比較不同生物種群關(guān)鍵基因的分化程度,從而估算這些種群在多久之前進(jìn)化出了“分支”。20世紀(jì)90年代,他又設(shè)計(jì)了“分子進(jìn)化遺傳學(xué)分析”軟件(簡(jiǎn)稱(chēng)“MEGA”),這款軟件功能非常發(fā)達(dá),是生物科研領(lǐng)域應(yīng)用最廣泛的計(jì)算機(jī)程序之一。
可以說(shuō),根井正利大部分研究成果都是“理論”和“實(shí)用性”的完美結(jié)合。從“動(dòng)腦”和“動(dòng)手”的角度來(lái)說(shuō),根井正利算得上是科研領(lǐng)域中的“全才”了。
生物進(jìn)化的“中性理論”
前面提到,根井正利最初所做的研究是農(nóng)業(yè)科學(xué),那么他后來(lái)又為何成為了一名進(jìn)化生物學(xué)家呢?這其實(shí)與另一位日本生物學(xué)家木村資生有關(guān)。
1931年,根井正利出生于日本宮崎縣,22歲時(shí)畢業(yè)于宮崎大學(xué)農(nóng)學(xué)系,1959年,在京都大學(xué)獲得農(nóng)學(xué)博士學(xué)位。隨后,根井正利來(lái)到日本國(guó)立放射學(xué)研究所任職,研究農(nóng)作物的育種,頻繁接觸到群體遺傳學(xué)的知識(shí)。群體遺傳學(xué)是一種用數(shù)學(xué)研究群體中的基因變化動(dòng)態(tài)的科學(xué),美國(guó)在這一領(lǐng)域的水平比較高。木村資生恰好從美國(guó)留學(xué)回來(lái),同時(shí)也是精通群體遺傳學(xué)的著名學(xué)者,根井正利便常常向他請(qǐng)教和探討問(wèn)題。根井正利結(jié)識(shí)木村資生不久,后者便創(chuàng)立了一種新的進(jìn)化理論——“分子進(jìn)化中性學(xué)說(shuō)”,簡(jiǎn)稱(chēng)“中性理論”。
在20世紀(jì)60年代以前,學(xué)術(shù)界最推崇的進(jìn)化理論是達(dá)爾文的自然選擇學(xué)說(shuō)。在《物種起源》這篇巨著中,達(dá)爾文指出,自然界現(xiàn)存的各種各樣的生物,是由其共同祖先經(jīng)過(guò)自然選擇進(jìn)化而來(lái)的,物種在自然選擇下進(jìn)行生存競(jìng)爭(zhēng),導(dǎo)致“適者生存,不適者被淘汰”。在自然選擇下,對(duì)生存競(jìng)爭(zhēng)有利的變異會(huì)保存下來(lái),不利的變異被淘汰,長(zhǎng)此以往,微小的變異積累為顯著的變異,就形成了新的亞種或新的物種。所以,達(dá)爾文及其學(xué)說(shuō)的繼承者認(rèn)為,自然選擇塑造了生物的性狀。
然而,在木村資生看來(lái),把一切進(jìn)化現(xiàn)象都?xì)w結(jié)為自然選擇是不妥當(dāng)?shù)?,因?yàn)樯锲毡榇嬖谥S多與適應(yīng)自然無(wú)關(guān)的性狀,比如人類(lèi)眼睛的單雙眼皮、鼻子鼻梁的高低、頭發(fā)顏色的深淺等等。在一般情況下,很難說(shuō)自然選擇對(duì)這些性狀的存在能產(chǎn)生多大的影響。這或許說(shuō)明,即使沒(méi)有自然選擇,生物也會(huì)出現(xiàn)性狀的差異,也能形成進(jìn)化。為了不和達(dá)爾文學(xué)說(shuō)產(chǎn)生太大的沖突,木村資生提出,生物存在兩種進(jìn)化模式:一種是發(fā)生在宏觀表型(基因等生物分子表現(xiàn)出來(lái)的整體性狀特征)水平上的進(jìn)化,它由自然選擇驅(qū)動(dòng);另外,還存在不受自然選擇影響的進(jìn)化,這種進(jìn)化發(fā)生在分子(比如基因、蛋白質(zhì)和核酸)水平上,它對(duì)生物個(gè)體是否適應(yīng)自然來(lái)說(shuō)無(wú)所謂好壞,是呈中性的——這就是“分子進(jìn)化中性學(xué)說(shuō)”。
“變異”驅(qū)動(dòng)進(jìn)化
木村資生的“分子進(jìn)化中性學(xué)說(shuō)”讓根井正利非常感興趣。于是,他于1969年離開(kāi)日本,前往美國(guó)研究進(jìn)化生物學(xué)。在隨后的幾十年里,根井正利先是在布朗大學(xué)任教,后來(lái)陸續(xù)擔(dān)任得克薩斯大學(xué)休斯頓分校以及賓夕法尼亞大學(xué)的教授,并于1997年當(dāng)選美國(guó)科學(xué)院院士。經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期研究,根井正利成為“分子進(jìn)化中性學(xué)說(shuō)”的代表人物,同時(shí)對(duì)于進(jìn)化生物學(xué)做出了許多革新。
比如,為了論證“中性理論”,根井正利利用統(tǒng)計(jì)學(xué)的知識(shí)建立了數(shù)學(xué)方程,利用計(jì)算機(jī)模擬生物分子的變異在生物傳代過(guò)程中的行為。結(jié)果發(fā)現(xiàn),生物分子的變異往往不影響分子(比如蛋白質(zhì)和核酸)的功能,也就是說(shuō)它并不引起宏觀表型的改變,也不影響生物個(gè)體適應(yīng)環(huán)境的能力。所以,生物分子水平上的變異無(wú)利亦無(wú)害,呈中性,自然選擇對(duì)其無(wú)能為力。
但是,這些隨機(jī)的、不受自然選擇影響的中性變異會(huì)在生物傳代過(guò)程中通過(guò)遺傳被固定下來(lái),或者消失。至于哪一種變異能夠保存下來(lái),哪一種變異趨于消失,同樣也全靠機(jī)遇。根井正利將這種中性變異的隨機(jī)的變動(dòng)稱(chēng)為“遺傳漂變”。由于生物身體的每一部分都是由分子控制的,而分子的進(jìn)化是通過(guò)中性變異的“遺傳漂變”實(shí)現(xiàn)的,自然選擇并不起作用,所以,根井正利提出一種新的觀點(diǎn):生物進(jìn)化的驅(qū)動(dòng)力是變異,而非自然選擇。
又比如,構(gòu)建“進(jìn)化樹(shù)”是理解生物進(jìn)化史的重要方法,為此,根井正利發(fā)明了一種計(jì)算機(jī)算法,可以通過(guò)比較不同物種之間關(guān)鍵基因的差異來(lái)快速構(gòu)建進(jìn)化樹(shù),相關(guān)的論文如今已經(jīng)被引用了超過(guò)3.4萬(wàn)次。另外,“根井標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離”計(jì)算公式以及“分子進(jìn)化遺傳學(xué)分析”軟件都是根井正利發(fā)明的新型研究方法,在進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。
獲得京都獎(jiǎng)后,根井正利被問(wèn)及自己成功的秘訣。他提到,獨(dú)立思考,勇于質(zhì)疑教條和拋棄先入為主的觀念,這才是最重要的科學(xué)素養(yǎng)。正是由于不迷信達(dá)爾文,他才在進(jìn)化生物學(xué)的研究道路上越走越遠(yuǎn),最終獲得成功。
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