小美通過對2018年度1-7月份的微生態(tài)項目文章進行梳理，發(fā)現(xiàn)200余篇項目文章涵蓋了土壤微生物、動物微生物、人體微生物、食品安全、空氣污染治理和堆肥發(fā)酵六大領(lǐng)域，小美將在隨后幾周陸續(xù)推送各大領(lǐng)域項目文章解析：
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上期我們分享了土壤微生物多樣性篇的客戶文章案例，贏得很多老師的關(guān)注，本期我們開啟動物微生物多樣性篇，讓我們一起來探索該領(lǐng)域最新研究進展和科研思路吧！
第一篇
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)陳芳團隊研究發(fā)現(xiàn)喂食大麥葉會影響小鼠腸道微生物以及代謝產(chǎn)物的組成。該成果發(fā)表在《Journal of Nutritional Biochemistry》雜志上，此研究為探究微生物相關(guān)代謝物對宿主生理學(xué)的潛在影響提供了新見解。
Title: Gut microbiota promotes production of aromatic metabolites through degradation of barley leaf fiber
DOI: 10.1016/j.jnutbio.2018.05.001
文章摘要：
①喂食含有大麥葉食物的小鼠腸道微生物組成會發(fā)生改變，降解纖維素的細菌Lachnospiraceae和Prevotella在小鼠腸道中富集；②腸道微生物介導(dǎo)的大麥葉降解會促進丁酸鹽和丙酸鹽的產(chǎn)生；③代謝組學(xué)分析揭示喂食大麥葉的小鼠糞便中芳香代謝物的含量升高；④抗生素處理和厭氧發(fā)酵進一步證實了大麥降解期間腸道微生物在芳香代謝物生產(chǎn)中的專性作用。
圖1 LEfSe分析揭示對照組小鼠和喂食大麥葉小鼠之間存在差異的腸道微生物
第二篇
華東師范大學(xué)李東亮團隊研究發(fā)現(xiàn)微膠囊油可以改善高脂飲食喂養(yǎng)的羅非魚免疫功能和腸道健康。該文章發(fā)表在《Aquaculture》雜志上，此研究首次闡明了食用微膠囊油對高脂膳食的羅非魚的益處，為今后類似研究提供了依據(jù)。
Title: Dietary microencapsulated oil improves immune function and intestinal health in Nile tilapia fed with high-fat diet
DOI: 10.1016/j.aquaculture.2018.06.080
文章摘要：
①微膠囊油不會影響羅非魚的生長、機體組成和肌肉脂肪酸組成，但是提高了溶菌酶在腸道中的活性和對嗜氣單胞菌的抵抗力；②微膠囊油不僅改善了腸道微生物結(jié)構(gòu)，而且增加了有益菌（芽胞桿菌、芍藥桿菌）的豐度，減少了有害菌（假交替單胞菌、薔薇單胞菌）的豐度；③在正常PL油（60%棕櫚油+ 40%亞麻籽油）和微膠囊PL油之間，這些有益作用更為顯著，但在FL油（60%魚油+ 40%亞麻籽油）組中無顯著差異；④微膠囊油的有益作用主要與油的組成有關(guān)。
圖2 不同組羅非魚腸道微生物屬水平物種差異分析
第三篇
華東師范大學(xué)張美玲團隊研究發(fā)現(xiàn)環(huán)境中抗生素的濃度會損害斑馬魚的腸道健康。該文章發(fā)表在《Environmental Pollution》雜志上，此研究有利于未來評估抗生素殘留的潛在健康風(fēng)險。
Title: Environmental concentrations of antibiotics impair zebrafish gut health
DOI: 10.1016/j.envpol.2017.12.073
文章摘要：
①暴露于抗生素并不影響魚的體重增加，但增加了魚的代謝率，并導(dǎo)致更高的死亡率；②暴露于抗生素后，腸道杯狀細胞數(shù)量、堿性磷酸酶(AKP)、酸性磷酸酶(ACP)活性及抗氧化反應(yīng)均顯著降低，而炎癥因子表達顯著增加；③接觸抗生素也會干擾土霉素組斑馬魚的腸道微生物群。
圖3 抗生素暴露對腸道微生物組成的影響。左圖為腸道微生物組成情況，右圖為對照組、暴露于磺胺甲惡唑和土霉素中的羅非魚腸道細菌群落組成比較。
第四篇
北京林業(yè)大學(xué)張盼月團隊研究發(fā)現(xiàn)瘤胃液發(fā)酵能增強剪草的水解和酸化。該成果發(fā)表在《Journal of Environmental Management》雜志上，此研究將有利于優(yōu)化利用瘤胃液發(fā)酵來增強剪草酸化這項綠色技術(shù)。
Title: Rumen fluid fermentation for enhancement of hydrolysis and acidification of grass clipping
DOI: 10.1016/j.jenvman.2018.05.027
文章摘要：
①反芻動物瘤胃液中含有一個復(fù)雜的微生物類群，包括細菌、原生動物、真菌和古菌，具有很高的降解木質(zhì)纖維素生物質(zhì)的能力；②嚴(yán)格的厭氧條件、高剪草量以及較小的剪草顆粒有助于有機物的水解和酸化；③厚壁菌門和纖維桿菌門是降解木質(zhì)素和纖維素的主要細菌；④羧甲基纖維素酶、纖維二糖酶和木聚糖酶的活性升高。
圖4 瘤胃液中微生物群落組成隨著草料發(fā)酵時間的變化
第五篇
中科院亞熱帶農(nóng)業(yè)研究所王敏團隊研究發(fā)現(xiàn)奶牛瘤胃不同部位發(fā)酵終產(chǎn)物和產(chǎn)甲烷菌群落變化。該文章發(fā)表在《Journal of Dairy Science》雜志上，此研究提供瘤胃液研究的參考：在收集營養(yǎng)研究的瘤胃樣品時，可能需要考慮在不同瘤胃部位的發(fā)酵終產(chǎn)物、產(chǎn)甲烷菌群和產(chǎn)甲烷作用的變化。
Title: Short communication: Variability in fermentation end-products and methanogen communities in different rumen sites of dairy cows
DOI: 10.3168/jds.2017-14096
文章摘要：
①采集3頭沒有哺乳的中國荷斯坦奶牛3個不同部位以及3個時間點的瘤胃內(nèi)容物；②顱骨瘤胃樣品中溶解甲烷濃度和pH值最高；③與腹側(cè)瘤胃中樣品相比，顱骨瘤胃液中甲烷桿菌的拷貝數(shù)和Simpson指數(shù)也更高；④顱內(nèi)瘤胃中溶解CH4濃度高于中、后瘤胃，這可能是由于甲烷短桿菌數(shù)量增加所致。
圖5 左圖為三頭奶牛不同瘤胃部位的微生物群落組成比較，右圖為不同部位瘤胃產(chǎn)烷微生物群落組成
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