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長鏈非編碼RNA（lncRNA）在腫瘤發(fā)生中起重要作用。然而，喉鱗狀細胞癌（LSCC）中l(wèi)ncRNA的表達模式和功能尚不清楚。為了研究晚期LSCC中異常表達的lncRNA和m RNA，通過lncRNA和mRNA整合芯片對9對原發(fā)性IVA階段LSCC組織和相鄰非腫瘤組織進行高通量檢測。研究通過功能和通路富集分析， 發(fā)現(xiàn)差異mRNA參與的重要功能和通路。接著構建全局信號網絡圖和ceRNA網絡，篩選出核心mRNA，而lncRNA-m RNA共表達網絡識別lncRNA和mRNA之間的相互作用。 qRT-PCR進一步驗證晚期LSCC中l(wèi)ncRNA和mRNA的表達。我們發(fā)現(xiàn)1459個差異lncRNA和2381個差異mRNA， 包括846個上調的lncRNA和613個下調的lncRNAs，1542個上調mRNA和839個下調mRNA。通過數(shù)據(jù)分析我們篩選出3個核心基因： ITGB1，HIF1A和DDIT4，它們主要參與生物過程，包括基質組織，細胞周期，粘附和代謝通路。 LncRNA-mRNA共表達分析顯示LncRNA NR_027340，MIR31HG分別與ITGB1， HIF1A正相關。 LncRNA SOX2-OT與DDIT4呈負相關。 qRT-PCR進一步驗證了這些lncRNA和mRNA的表達。這項工作提供了令人信服的證據(jù)，確定了lncRNA和mRNA是潛在的生物標志物，可用于晚期LSCC進一步研究。  

參考文獻

1. The Long Noncoding RNA lncTCF7 Promotes Self-Renewal of Human Liver Cancer Stem Cells through Activation of Wnt Signaling. Cell Stem Cell. 2016.

2. LncBRM initiates YAP1 signalling activation to drive self-renewal of liver cancer stem cells . Nature communication. 2016 .