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胃癌免疫治療相關(guān)的TCGA和ACRG分子分型

1、美國(guó)國(guó)家癌癥研究所(TCGA)分子分型:近年來(lái)隨著分子診斷技術(shù)的發(fā)展,特別是高通量測(cè)序和基因芯片技術(shù)的發(fā)展,提出了一些新的胃癌分子分型策略。2014年根據(jù)癌癥基因組圖譜(TCGA)分析提出4種分子亞型:EB病毒感染型(EBV)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定型(MSI)、染色體不穩(wěn)定型(CIN)以及基因組穩(wěn)定型(GS)。其中,EBV型和MSI型是免疫治療可能獲益類型,而CIN和GS型對(duì)免疫治療發(fā)生反應(yīng)的可能性較小。

(1)EBV型:約占8.8%,男性多見(jiàn)(82%),主要見(jiàn)于胃底和胃體(62%);PIK3CA是最常見(jiàn)的突變基因(80%),其他常見(jiàn)的突變基因包括:ARID1A和BCOR,而TP53突變罕見(jiàn)。此外,DNA超甲基化水平非常高,且在所有EBV感染的病例中都發(fā)現(xiàn)了CDKN2A啟動(dòng)子高甲基化導(dǎo)致p16失活,而CDKN2A被認(rèn)為是胃癌中最重要的抑癌基因之一。此外,JAK2、CD274[即細(xì)胞程序性死亡-配體1(PD-L1)]、PDCD1LG2(即PD-L2)和酪氨酸激酶受體(ERBB)2即人表皮生長(zhǎng)因子受體(HER-2)擴(kuò)增,以及PTEN、SMAD4、CDKN2A和ARID1A缺失也常發(fā)生。

(2)MSI型:TCGA中第二常見(jiàn)亞型,約占21.7%,多見(jiàn)于老年女性,好發(fā)于胃竇或幽門,具有較高的突變率,主要為PIK3CA、ERBB2、ERBB3和表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR),以及在其他腫瘤常見(jiàn)的熱點(diǎn)基因。富含DNA超甲基化,包含MLH1基因啟動(dòng)子超甲基化,導(dǎo)致MLH1錯(cuò)配修復(fù)蛋白沉默表達(dá),被認(rèn)為是造成MSI型病例的主要原因。

(3)CIN:TCGA研究中的大部分胃癌屬于此類,約占50%,常見(jiàn)于胃食管交界處和賁門,多屬Lauren分型中的腸型,老年人多見(jiàn)。最為常見(jiàn)的基因變異為TP53突變(73%),此外,具有大量ERBB擴(kuò)增,包括血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子 A (VEGFA)、EGFR、ERBB2、ERBB3、c-Met和編碼細(xì)胞周期相關(guān)的基因,如CCNE1、CCND1和CDK6等,為靶向治療提供了潛在靶點(diǎn)。

(4)GS:約占20%,初診年齡偏低,多屬Lauren分型中的彌漫型;CDH1(26%~37%)和RHOA(15%)基因突變頻率高。此外,與RHOA活性相關(guān)的RHO家族GTP酶活化蛋白基因融合現(xiàn)象(CLDN18-ARHGAP融合)也較為常見(jiàn),約占30%,通常RHOA突變和CLDN18-ARHGAP融合互相排斥。GS型一般缺少免疫原性和可靶向的驅(qū)動(dòng)基因突變,主要以細(xì)胞毒化療作為治療手段。

2、亞洲癌癥研究組織(ACRG)分子分型:2015年ACRG根據(jù)MSI狀態(tài)、TP53功能和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)分為4個(gè)亞型:MSI-H、MSS/TP53+、MSS/TP53-和MSS/EMT。ACRG與TCGA分類有部分交叉,不同之處在于ACRG不同亞型與臨床結(jié)果更為相關(guān),各型特征如下:(1) MSI-H(22.7%):該型多發(fā)于胃竇(75%),>60%為腸型,診斷時(shí)多為早期,預(yù)后最佳。有過(guò)度甲基化,尤其是編碼KRAS、PI3K-PTEN-mTOR途徑、ARID1A、ERBB2、ERBB3和ALK基因,該型患者預(yù)后最好;(2)微衛(wèi)星穩(wěn)定(MSS)/TP53+(26.3%):此型有更高EBV感染率,除有TP53途徑活化,還有抗原呈遞細(xì)胞(APC)、ARID1A、KRAS、PI3KCA和SMAD4突變,該型患者預(yù)后較好;(3) MSS/TP53-(35.7%):該型TP53突變率最高(60%),可能是TP53功能缺失的主要原因。有更多的非整體改變和再現(xiàn)性MDM2、ROBO2、GATA6、MYC、ERBB2、EGFR、CCNE1和CCND1擴(kuò)增,該型患者預(yù)后較差;(4) MSS/EMT(15.3%):多為彌漫型,此型的基因改變與細(xì)胞黏附和活動(dòng)性有關(guān)。多發(fā)于年輕患者,診斷時(shí)多為進(jìn)展期,復(fù)發(fā)概率高,腹膜傳播率高預(yù)后最差。

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