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要想寫好sci論文，多讀文獻是關(guān)鍵。俗話說：熟讀唐詩三百首,不會作詩也會吟。我在海德堡大學(xué)攻讀博士期間讀了不下大幾百篇文獻，特別是精讀兩百篇左右在高水平的期刊尤其是Cell, Nature, Science上發(fā)表的論文，記下讀書筆記，對文章的研究思路，研究路線，技術(shù)方法，結(jié)果分析等方面一一解析，最后總結(jié)文章的創(chuàng)新點，為何能發(fā)，有哪些可以學(xué)習(xí)借鑒，并要求自己用一兩句話并盡可能用一個model圖概括該文特色，也就是take home message，記到本子上，下次看就可以一目了然，提綱挈領(lǐng)，便于記憶。事實上，自今年2010年起，Cell雜志開始要求作者投稿時提供graphical abstract,勾勒出該文的要點，以便讀者一目了然領(lǐng)會文章的貢獻和意義，也正是出于此意。如今要求投稿時提供graphical abstract和在發(fā)表論文時同時刊出graphical abstract的雜志越來越多

寫好論文后就要選刊投稿了，選刊的關(guān)鍵是看自己的研究結(jié)果和意義與本領(lǐng)域哪些雜志所發(fā)文章處于類似的水準。如果經(jīng)常讀文獻，這點不難，沒事就瀏覽一下本領(lǐng)域的每個雜志的要目table of contents, 感興趣的title就點擊看看摘要，大概就對自己的文章水平略知一二了。自己的博士課題做出了一個比較有意義的新發(fā)現(xiàn)，覺得投十多分的Nature Cell Biology，Genes Development一檔的雜志比較有戲，自己很快根據(jù)Nature Cell Biology雜志的要求并精讀了該雜志最近發(fā)表的兩篇同領(lǐng)域的論文作為范文寫了初稿，給導(dǎo)師修稿后就投稿了。得到評審意見是要補充新數(shù)據(jù)，我們補充了一些，但是有些數(shù)據(jù)無法很快補充，針對所研究蛋白的抗體很不容易制備，我們在回復(fù)信中進行了辯解，二稿投出后莫名其妙被編輯直接拒絕了，并沒有送一審專家再審。在投Genes Development之前，我想還是碰碰運氣投稿Science，在等待審稿的同時嘗試一些新試驗以替代必須要有抗體才能進行的試驗?？上驳氖穷A(yù)審?fù)ㄟ^（Science預(yù)審會直接淘汰大約75%稿件不送出審稿），一個多月得到外審意見，要求對我們提出的model給出更多證據(jù)支持，這個任務(wù)在當(dāng)時的實驗室條件下很難達到，而且我也想早點畢業(yè)，只得放棄。很快就投了保底的雜志Genes Development。一個月得到意見，accept dependent on revision，只有3個月修回期限。好在要求補充的一些試驗就是我們預(yù)計到的正在補的，補充的試驗雖然有挑戰(zhàn)性，經(jīng)過艱苦摸索進展順利。3個月后投出修回稿接受了。整個投稿過程回頭看，受益匪淺。其實如果我們先就補了一些數(shù)據(jù)，也許Nature Cell Biology會接受，不過Genes Development公認是發(fā)育生物學(xué)領(lǐng)域的No.1，所以也不足為惜。這篇文章發(fā)表一年多就被引用10多次，還被University of North Carolina at Chapel Hill的研究生課程DevelopmentalGenetics列為選讀文獻。另外就是學(xué)會了正確看待審稿人的意見，一般來說審稿人意見是比較負責(zé)的，可以說沒有評審意見，文章質(zhì)量不會上到一個高度，自己看自己評，總是有局限性，所謂當(dāng)局者迷，旁觀者清，就是這個道理。Peer review系統(tǒng)飽受爭議這么多年，還是在采用說明其存在的合理性。

人總是有點惰性，力圖發(fā)高水平sci論文會逼迫自己去寫、改、構(gòu)思和補充試驗，通過上述的過程我的能力提高不少，發(fā)表在Genes Development的論文我和導(dǎo)師共享通訊作者。博士畢業(yè)后我覺得自己有能力獨立投稿，所以就想以自己博士論文前言部分為基礎(chǔ)，結(jié)合最近的一些本領(lǐng)域的好文章（包括自己的這篇文章），寫篇綜述來評論本領(lǐng)域的進展。自己不是大牛，導(dǎo)師也幫不上忙，不可能得到一流雜志的編輯來邀請我撰稿，所以我就自己查擬投雜志，找到Cellular and Molecular Life Sciences這個雜志感覺比較對口，IF有5分多（自己雖然不完全認同IF，但是大家都以此為參照，所以在選刊時也得考慮）。在投稿時自己有信心，因為看了一些該雜志最近發(fā)的文章知道水平和我的差不多，果然接到審稿意見基本接受，要求修稿，這是第一次獨立修稿和寫回復(fù)信，更是鍛煉也是寶貴的經(jīng)驗，文章得以發(fā)表。

下一步比較有挑戰(zhàn)性，我經(jīng)過多年腫瘤研究的積累，以及博士期間對新領(lǐng)域發(fā)育生物學(xué)的學(xué)習(xí)，開始關(guān)注胚胎發(fā)育和腫瘤發(fā)生之間的類似性，并著手寫篇綜述闡述我的新假設(shè)：即一個胚胎發(fā)育中重要的信號通路可能在腫瘤發(fā)生尤其是轉(zhuǎn)移中有意義。在選刊時同樣是瀏覽期刊，找出最近發(fā)表的類似的文章做參考，這次我選擇了Molecular Cancer Therapeutics雜志，該雜志為全球最大的腫瘤研究協(xié)會美國腫瘤研究協(xié)會（AACR）主辦，IF 5分。因為我提出的新假設(shè)涉及不同領(lǐng)域，得到的3個評審專家意見，一個可能對本領(lǐng)域不熟悉，提出很多負面評價，另外兩個則提出很好的評價。在寫回復(fù)信時我堅持立場對第一個專家意見做出辯解，對另外兩個專家的建設(shè)性意見致謝和采納。文稿修回后很快接受發(fā)表。2009年8月第8期登出不久，就收到素不相識的美國衛(wèi)生研究院下屬的美國腫瘤研究所一研究室主任（本領(lǐng)域一大牛）給我的email 評價我的綜述 very nice。9月份的AACR網(wǎng)上期刊Cancer Review Online也收錄我的文章，主編對我的文章給予150余字的評價。發(fā)表半年多就收到世界各地的幾十個研究人員來信索取全文，迄今6年多根據(jù)Scopus檢索被引用92次，包括這些牛期刊Cell, Nature Genetics, Nature Reviews Cancer, Nature Reviews DrugDiscovery, PNAS, Cancer Research, Clinical Cancer Research, Oncogene, StemCells Development, Development等等。以上兩篇綜述文章都是一投就基本接受，沒有費力再投其他雜志。我覺得選好擬投雜志很關(guān)鍵，不要盲目投稿浪費時間精力。目前來說一篇稿件不經(jīng)修回直接接受的可能性微乎其微，所以投稿前要有充分的思想準備如何修回，并盡早開始。修回過程很有必要，確實能提高文章質(zhì)量，所以有時候?qū)徃迦说囊庖娒菜坪芴籼?，其實長遠來看是對自己有益。當(dāng)然對于明顯不對的意見要敢于爭辯，最終文章是否接受的決定權(quán)在編輯而不是審稿人。

目前全球科研經(jīng)費緊縮，所以選擇擬投期刊還要注意審稿費和版面費。要求審稿費的SCI期刊實在不多，前面談到的期刊Cellular and Molecular Life Sciences是瑞士的一家公司出版，主要以綜述為主，每期有少量研究論著（就我個人理解綜述類雜志的IF一般高些，現(xiàn)在越來越多的比較權(quán)威的傳統(tǒng)雜志如Cancer Research, Development等也紛紛開辟綜述專欄，要知道以前這些雜志只登原始論著基本不登綜述，真所謂與時俱進）。我當(dāng)時投稿時綜述類不需要版面費，但是限定只給2個彩圖，2個以上彩圖就要收彩圖費。所以我在描繪圖的時候就制定2彩圖，1黑白圖，就一分錢不花啦。在我投稿前述腫瘤的綜述時，也是煞費苦心，力求投入產(chǎn)出比最佳。很多雜志要求除了約稿外都要版面費，我還沒機會得到約稿，只好放棄。最后選擇投稿Molecular Cancer Therapeutics，在網(wǎng)上投稿時有欄目要填是否能支付版面費，我寫明本綜述在于總結(jié)現(xiàn)有研究現(xiàn)狀，提出新假設(shè)，以便為申請基金開展此類研究打下基礎(chǔ)，目前本人沒有任何基金資助本綜述所涉及的內(nèi)容，所以不能支付版面費。最終免掉了400多美金版面費。

一個朋友的碩士論文托我?guī)兔υu估，其課題是研究某生理條件下基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的一些機制。雖然研究不深入，但是有siRNA試驗和幾個指標覺得還是有戲。朋友寫了英文初稿，在我的建議下改了幾次，投了4個雜志IF在1-3之間，有的直接被編輯拒稿，有的經(jīng)過審稿被拒主要意見是據(jù)太膚淺，要求補數(shù)據(jù)，當(dāng)時的條件補數(shù)據(jù)也不現(xiàn)實。最后試投英國雜志Cell Biochemistry Function（當(dāng)時IF 1分多，現(xiàn)在升到2分多）。出人意外，兩個審稿人第一個審稿意見很好，只要求對一些語句進行修改和補些文獻，沒有要求只是建議補些數(shù)據(jù)。而第二個審稿人可能是對領(lǐng)域不熟或者沒費心審，負面意見多，并提出很多疑問?？磥砭庉嬛饕春玫谝粚徃迦说囊庖?，決定accept upon revision and satisfactory response。在回復(fù)信中致謝第一審稿人，仔細解釋了為何該建議的試驗無法實行，請其理解。對第二審稿人的問題逐一解釋。修回第一稿后大約3周得到二審意見，第一審稿人滿意修改建議接受，而第二審稿人還是對第一次的問題糾纏不休，還針對文章內(nèi)容提出一個明顯錯誤的質(zhì)問。我心中暗喜，這個傻問題編輯應(yīng)該能辨別出來吧。在第二次的回復(fù)信中直接對第二審稿人意見反駁。不到兩天就收到接收函，果然編輯看到了第二審稿人的紕漏，都沒有再外審就決定直接接受啦。所以如果你的審稿意見中有意見露出破綻或者明顯不著邊際，那要恭喜你啦。一般來說編輯看到審稿人打錯板子，那他也許會給你相對的補償或者說同情心，只要有一個審稿人說好，那你文章也許就有戲接受啦。還有一點體會就是不同審稿人確實水平和態(tài)度都參差不齊，其實這些審稿人也許就是我們中的一員，一些很小的因素很影響審稿意見，所以大家如果盯著SCI低分雜志，只要時間允許，就一定要多投幾家，屢敗屢戰(zhàn)，直到成功。當(dāng)然也不要太盲目，瞎投亂投，至少要靠譜。這次投稿因為朋友的課題是國家自然科學(xué)基金資助的，版面費不是問題。他還擔(dān)心怎么匯版面費給國外雜志呢，哪知道出版社只收彩圖版面費，我就勸朋友把紙質(zhì)版的彩圖變黑白，而網(wǎng)絡(luò)版的還是彩圖，一點不影響效果，這樣他一分銀子未花，就發(fā)了SCI。

這一原則同樣適合另一實例。一個臨床醫(yī)生有點基礎(chǔ)研究的數(shù)據(jù)在國內(nèi)雜志發(fā)了，但是一直沒有條件深入機制研究。根據(jù)最近文獻他提出一些有趣的假設(shè)來解釋一種疾病的致病機制，但是沒條件做試驗驗證（可惜呀，如果真驗證出來了絕對是十多分的文章）。我建議投Medical Hypothesis, IF 1分多，按雜志要求整理好格式，條理清楚，邏輯嚴密，滿懷希望投出。誰知被主編拒稿，說不符合雜志征稿范圍。也許太基礎(chǔ)啦。這下很沮喪，因為假設(shè)類的文章不象綜述，很少有雜志登。這么好的假設(shè)和精心繪制的模型圖就這樣放棄實在不甘心。我就費心逐個雜志瀏覽，大海撈針，發(fā)現(xiàn)一個基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)的雜志IF 5分多，不定期發(fā)些假設(shè)類的文章,但不是每期都發(fā)，而且每期登載的文章一起就4-5篇，朋友很沒信心。不管三七二十一，試試看吧。這家雜志審稿很慢，投稿一個月還沒消息，催問后才說要列出2個審稿人，初生牛犢不怕虎，我?guī)兔φ业絻蓚€本領(lǐng)域?qū)＜遥ɡ贤猓?。又過了一個月，還沒反應(yīng)，再次催問，編輯部說兩個審稿人拒絕審稿因為和作者熟悉，這怎么可能，這些專家拒絕審稿也不要用這種理由呀。編輯部要求再找3個審稿人，于是再推薦幾個專家。這家雜志倒是很認真，真找了3個審稿人（我個人審稿經(jīng)驗來看一般雜志看2個審稿人意見就定奪了），但是不是推薦的就不得而知啦。3周后得到意見：第一個沒作任何好壞評價，只是說要補充很多材料，加入更多的背景介紹這種疾病，以便讓基礎(chǔ)專業(yè)的讀者了解醫(yī)學(xué)背景；第二個說假設(shè)不錯，但要求多介紹些該蛋白的分子生物學(xué)最新進展；第三個連連說好，要求修飾一些用詞。編輯要求至少有3個圖，而且如果是引用別人的圖要聯(lián)系原作者和原出版社征得版權(quán)。原來想這就是一個假設(shè)，沒必要寫的象綜述，所以只做了一個假設(shè)模型圖。針對意見，多花點時間看文獻，模仿別人的圖但是加入一些自己的東西，重新作圖就不必去和作者聯(lián)系版權(quán)了。修回稿加了很多內(nèi)容和2個圖達到要求的3個圖，現(xiàn)在幾乎是篇綜述了，更利于讀者理解本假設(shè)（初稿是按Medical Hypotheses格式寫的，篇幅不長）。修回稿投出很快就得到接收函，沒有要求再改任何語言。原來目標是1分多的，最后成功發(fā)表5分多雜志，真是意外之喜呀！所以一個雜志拒稿不一定是壞事，留得青山在，不愁沒柴燒，文章的idea好，還是有市場。還有就是這類文章（假設(shè)綜述類）只要得到修回機會就是成功了一半，因為這些文字修改只要下苦功總是能完成的，只是時間和周折問題。而試驗論著遇到編輯和審稿人要求補充數(shù)據(jù)，不一定就能做出所期待的數(shù)據(jù)，就不能保證文章修回后能接受了。

最后，我分享臨床常見的病例報道（case report）的一次投稿經(jīng)歷：case report不要輕易放棄作為letter來發(fā)表。2014年圣誕節(jié)后元旦前復(fù)旦大學(xué)附屬醫(yī)院皮膚科的一位醫(yī)生來信咨詢說她的一篇病例報道投稿2分多的Journal of Dermatology不幸拒稿，雜志建議修改后作為letter to editor的形式重新投稿，但是letter to editor是書信形式的，篇幅會縮減為不到500單詞，國內(nèi)很多單位是不承認這種形式的書信為論著的。我建議她不要輕易放棄而屈服于編輯的要求改為letter形式投稿，我看到該雜志還有一種concise communication的投稿方式，雖然不是原始論著但是也可以算為研究簡報而不是letter，字數(shù)也可以是1500單詞，可算為研究論著的，逐幫她寫了一份申辯信發(fā)給編輯，辯解不以letter形式而是以concise communication形式投稿的理由，并對論文從布局、組織到語言等進行加工。修回稿投出后一個多月收到接收函，同意以concise communication形式接受和發(fā)表此篇case report，正是不要輕易放棄，自助者天助也！