目的建立一種合理、詳盡、可行的HIV-1基因分型方法。方法采集南昌地區(qū)部分男性性接觸人群(MSM)人類免疫缺陷病毒(HIV)感染者血漿,測量HIV病毒載量。提取其病毒RNA,設(shè)計引物并對HIV的Env區(qū)和Gag區(qū)進行反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)。對擴增后的c DNA進行測序,比對序列并分別構(gòu)建Env區(qū)和Gag區(qū)的分子進化樹,確定樣本的基因亞型,并分析p V3環(huán)氨基酸序列特征。結(jié)果本研究的3例樣本中,1例樣本的HIV病毒載量為43.9 copies/ml,其余2例均<20 copies/ml。3例樣本經(jīng)核酸序列分析,均鑒定為crf01_ae亞型。結(jié)論此hiv-1基因分型方法合理、詳細,可為國內(nèi)hiv分子流行病學研究提供一些參考。>
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