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生物化學(xué)丨酶

酶是生物催化劑,是一種具有生物活性的蛋白質(zhì),少數(shù)RNA分子也具有催化功能,稱為核酶。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是通過降低活化能加快反應(yīng)的速度。

酶的催化作用

一、酶的分子結(jié)構(gòu)與催化作用   

絕大多數(shù)酶的本質(zhì)是蛋白,根據(jù)酶的組成成分,分為單純酶和結(jié)合酶兩類。

1.單純酶:此類酶的結(jié)構(gòu)組成除蛋白外;無(wú)其他成分,酶的活性決定于蛋白部分。

2.結(jié)合酶:分子組成中除蛋白成分外,還有一些對(duì)熱穩(wěn)定的非蛋白小分子物質(zhì),把分子組成中的蛋白部分稱酶蛋白,非蛋白小分子物質(zhì)稱輔助因子。  

酶蛋白與輔助因子結(jié)合形成的復(fù)合物稱全酶。通常全酶才能起催化作用輔助因子+酶蛋白=全酶

3.在催化反應(yīng)中:酶蛋白與輔助因子所起的作用不同,酶反應(yīng)的專一性及高效性取決于酶蛋白,而輔助因子則起電子、原子或某些化學(xué)基團(tuán)的傳遞作用。 

4.酶的活性中心:酶的特殊催化能力只局限在它的大分子的一定區(qū)域,稱為酶的活性中心。 

酶的活性中心有兩個(gè)功能部位:(1)結(jié)合部位:(2)催化部位

5.必需基團(tuán)  

(1)活性中心內(nèi)的必需基團(tuán):。 

(2)活性中心外的必需基團(tuán)

二、酶促反應(yīng)的特點(diǎn)

高度特異、高效、不穩(wěn)定和可調(diào)節(jié)。  

(一)高度特異性(專一性)  

(二)高度催化效率   

(三)高度不穩(wěn)定性  

(四)酶活力的調(diào)節(jié)控制

輔酶與酶輔助因子

全酶中有蛋白質(zhì)部分和輔助因子。輔助因子又分為輔基與輔酶。輔酶與酶蛋白結(jié)合疏松,可用透析或超濾的方法除去    

一、維生素與輔酶的關(guān)系

1.維生素與輔酶的關(guān)系

----------------------------------------------  

輔酶         縮寫    維生素成分

----------------------------------------------  

焦磷酸硫胺素     TPP  B1  

黃素腺嘌呤二核苷酸  FAD  B2  

輔酶I/輔酶IINAD+/NADP+ 尼克酰胺   

輔酶ACoASH泛酸  磷酸

吡哆醛               B6  

輔酶B12   B12  

生物素                 生物素  

四氫葉酸                葉酸

---------------------------------------------

二、輔酶作用

在反應(yīng)中起運(yùn)載體的作用,傳遞電子、質(zhì)子或其他基團(tuán)。

酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)

一、底物濃度的影響  

(一)米氏方程 Km和Vmax的概念   

底物濃度與反應(yīng)速度的關(guān)系可以用米氏方程描述:

v =Vmax·[S]/Km+[S]

v :反應(yīng)速度; [S]:底物濃度; Vmax:反應(yīng)的最大速度; Km:米氏常數(shù)

1.米氏常數(shù):Km就是酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度,單位是mol/L。                              

2.米氏常數(shù)的意義   

(1)米氏常數(shù)是酶的特征常數(shù)之一,每一種酶都有它的Km值,Km值只與酶的結(jié)構(gòu)和所催化的底物有關(guān),與酶濃度無(wú)關(guān)?! ?/p>

(2)判斷酶與底物親和力的大小。Km值小,表示用很低的底物濃度即可達(dá)到最大反應(yīng)速度的一半,說明酶與底物親和力大??捎?/Km近似地表示親和力,1/Km愈大,酶與底物的親和力愈大,酶促反應(yīng)愈易進(jìn)行。   

(3)判斷哪些底物是酶的天然底物或最適底物(即Km值最小的底物)?! ?/p>

(4)判斷正逆兩向反應(yīng)的催化效率。如一個(gè)反應(yīng)的正逆方向由同一個(gè)酶催化,則Km值較小的那向反應(yīng)催化效率較高?! ?/p>

(5)求出要達(dá)到規(guī)定反應(yīng)速度的底物濃度,或根據(jù)已知底物濃度求出反應(yīng)速度?! ?/p>

例如:已知Km值,求使反應(yīng)達(dá)到95%Vmax時(shí)的底物濃度為多少?  

解:95%Vmax=Vmax·[s]/Km+[s]  

移項(xiàng)解出[s]=19Km 

二、最適pH值和最適溫度

(二)最適溫度:在某一溫度范圍時(shí)酶促反應(yīng)速度最大,此溫度稱為酶作用的最適溫度。人體內(nèi)酶最適溫度多在37℃左右。    

(三)最適pH:溶液的PH對(duì)酶活性影響很大。在一定的PH范圍內(nèi)酶表現(xiàn)催化活性。各種酶的最適pH不同,人體內(nèi)大多數(shù)酶的最適pH在7.35—7.45之間,胃蛋白酶最適pH為1.5—2.5,膽堿酯酶在pH大于7.0時(shí)有最大活性。

抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)的抑制作用

一、不可逆抑制      

這類抑制劑通常比較牢固的共價(jià)鍵與酶蛋白中的基團(tuán)結(jié)合,而使酶失活,不能用透析、超濾等物理方法除去抑制劑來(lái)恢復(fù)酶活性

二、可逆性抑制   

抑制劑與酶非共價(jià)結(jié)合,可以用透析、超濾等簡(jiǎn)單物理方法除去抑制劑來(lái)恢復(fù)酶的活性,因此是可逆的。根據(jù)抑制劑在酶分子上結(jié)合位置的不同,又可分為三類:

1.競(jìng)爭(zhēng)性抑制:抑制劑I與底物S的化學(xué)結(jié)構(gòu)相似,在酶促反應(yīng)中,抑制劑與底物相互競(jìng)爭(zhēng)酶的活性中心,當(dāng)抑制劑與酶形成EI復(fù)合物后,酶才不能再與底物結(jié)合,從而抑制了酶的活性,這種抑制稱為競(jìng)爭(zhēng)性抑制。Km增高,Vm不變。

2.非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑:抑制劑與底物結(jié)構(gòu)并不相似。也不與底物搶占酶的活性中心,而是通過與活性中心以外的必需基團(tuán)結(jié)合抑制酶的活性,這種抑制稱非競(jìng)爭(zhēng)性抑制。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制與底物并無(wú)競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系。Km不變,Vm降低

3.反競(jìng)爭(zhēng)催抑制:酶只有在與底物結(jié)合后,才能與抑制劑結(jié)合,即ES+I→ESI, ESl一×→P。比較起來(lái),這種抑制劑作用最不重要。 Km減小,Vm降低

酶活性的調(diào)節(jié)

一、別構(gòu)調(diào)節(jié)

一些代謝物可以與某些酶分子活性中心外的某一部位可逆的結(jié)合,使酶發(fā)生變構(gòu)并改變其催化活性。此結(jié)合部位稱為別構(gòu)部位或調(diào)節(jié)部位。對(duì)酶催化活性的這種調(diào)節(jié)稱為別構(gòu)調(diào)節(jié)。受別構(gòu)調(diào)節(jié)的酶稱為別構(gòu)酶。導(dǎo)致別構(gòu)效應(yīng)的代謝物稱為別構(gòu)效應(yīng)劑。

二、共價(jià)修飾 

酶蛋白肽鏈上一些基團(tuán)可以與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可遂的共價(jià)結(jié)合,從而改變酶活性。這一過程稱為酶的共價(jià)調(diào)節(jié)或化學(xué)修飾。在共價(jià)調(diào)節(jié)過程中,酶發(fā)生無(wú)(低)活性與有(高)活性的互變。(磷酸化最為常見) 

三、酶原激活

1.酶原:有些酶(大多數(shù)為水解酶)在細(xì)胞內(nèi)初合成或初分泌時(shí)是無(wú)活性的,這些酶的前身稱為酶原。

2.酶原的激活:在某些物質(zhì)作用下,無(wú)活性的酶原轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘拿傅倪^程。

3.酶原激活的本質(zhì):酶原激活的實(shí)質(zhì)是活性中心的形成和暴露的過程。首先是酶蛋白的一部分肽段被水解,去掉其對(duì)必需基團(tuán)的掩蓋和空間阻隔作用,然后三維構(gòu)象發(fā)生改變,必需基團(tuán)相對(duì)集中,形成活性中心。4.酶原激活的生理意義:酶原的存在形式對(duì)機(jī)體來(lái)說是一種保護(hù)作用。例如胰腺分泌的胰蛋白酶原和胰凝乳蛋白酶原。需在腸道內(nèi)經(jīng)激活才能催化蛋白質(zhì)水解,這樣也保護(hù)了胰腺不受酶的破壞。 

四、同工酶概念 

指能催化相同的化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。

LDH 五種同工酶,LDH1 心肌,LDH3在胰腺,LDH5 在肝臟 。Ck1 在腦組織,Ck2 在心肌,Ck3 在骨骼肌

核酶

核酶主要指一類具有催化功能的RNA。大多數(shù)核酶通過催化轉(zhuǎn)磷酸酯和磷酸二酯鍵水解反應(yīng)參與RNA自身剪切、加工過程。與蛋白質(zhì)酶相比,核酶的催化效率較低,是一種較為原始的催化酶。核酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于“所有酶都是蛋白質(zhì)”的傳統(tǒng)觀念提出了挑戰(zhàn)。

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