永平元年（506年），印度高僧勒拿摩提和菩提流支先后到少林寺開辟譯場，在少林寺西臺舍利塔設立翻經堂翻譯經書。之后，慧光在少林寺弘揚《四分律》等師說，經多代發(fā)展，后世最終形成四分律宗。
北魏孝明帝孝昌三年（527年），釋迦牟尼佛第二十八代徒菩提達摩來到少林寺，他在跋陀開創(chuàng)的基礎上，廣集信徒，傳授禪宗，東魏孝靜帝天平三年傳法于慧可，從此禪學在少林寺落跡流傳。
在南北朝佛教發(fā)展高峰期，北周武帝采納還俗沙門衛(wèi)元嵩刪寺減僧的建議，在建德三年（574年）下令禁止佛教傳流，史稱北周武帝滅佛，少林寺毀壞嚴重。
北周大象二年（580年），北周靜帝恢復少林寺，將其改名為陟岵寺。
（二）隋唐宋：隋文帝崇佛，復改陟岵寺為少林寺，并賜給少林寺土地一百頃，再加上其他賞賜，少林寺成為擁有百頃良田和龐大寺產的大寺院。
唐初，少林寺十三和尚因助唐有功，受到唐太宗的封賞，賜田千頃，水碾一具，并稱少林僧人為僧兵，從此，少林寺名揚天下，被譽為天下第一名剎。
至唐宋年間，少林寺擁有土地14000多畝，寺基540畝，樓臺殿閣5000余間，僧徒達2000多人。達摩開創(chuàng)的禪宗教派在唐朝興盛，是唐代佛教最大宗派。
宋仁宗慶歷三年（1043年）慶歷新政失敗后，留心空宗者始于汴京（今開封）設立禪院。
北宋元祐八年（1093年）左右，報恩禪師在少林寺弘揚曹洞宗風，終使少林寺“革律為禪”。
（三）元明清：元代初世祖命福裕和尚住持少林，并統領嵩岳一帶所有寺院。福裕和尚住持少林期間，創(chuàng)建了鐘樓、鼓樓，增修廊廡庫廚，僧徒云集至此演武禮佛。
嘉靖時期，日本倭寇襲擾中國沿海，少林僧侶抗倭有功，因此政府大規(guī)模修整寺院，少林寺還享有官府所賜予的免除糧差等特權。其后，少林僧人至少有六次被明朝政府征調，參與戰(zhàn)事，并屢建功勛，所以朝廷又多次為少林寺樹碑立坊修殿，而少林功夫在中國武術界的權威地位也得以確立。
康熙四十三年（1704年），康.熙皇.帝親書少林寺（原掛于天王殿，后移至山門）、寶樹芳蓮（原掛于大雄寶殿，后被火焚）二方匾額。
雍正十三年（1735年），雍.正皇.帝親覽寺院規(guī)劃圖，審定方案，重建山門，重修千佛殿，少林寺這次大修繕和改建耗銀達九千兩。
乾隆十五年（1750年），乾.隆皇.帝親臨少林寺，夜宿方丈室，寫下眾多詩詞、匾額。
二、少林功夫：少林功夫是中國武術中體系最龐大的門派，武功套路高達七百種以上，又因以禪入武，習武修禪，又有“武術禪”之稱?！吧倭帧币辉~成為中國傳統武術的象征。少林功夫包含少林七十二絕技、少林拳術、少林派棍術、少林派槍術、少林派刀術、少林派劍術。
少林武術兵器除上述刀、槍、劍、棍以外，還有三股叉（南方又稱大鈀）、方便鏟、套三環(huán)、峨嵋刺、月牙鏟、和戟鐮、秀圈、方天畫戟、雙錘、大斧、雙斧、三節(jié)棍、梢子棍、七節(jié)鞭、九節(jié)鞭、雙鞭等。少林套路有空手奪刀、空手奪槍、單刀對槍、空手奪匕首、棍穿槍、草鐮合槍、梢子棍合槍等。少林派技擊散打有：閃戰(zhàn)移身把、心意把、虎撲把、游龍飛步、丹鳳朝陽、十字亂把、老君抱葫蘆、仙人摘茄、葉底偷桃、腦后砍瓜、黑虎偷心、老猴搬枝、金絲纏法、應門鐵扇子、撥步炮、少鬼攥槍等。氣功是少林功夫的一大類，少林寺流傳的氣功有“易筋經”、“小武功”、“站樁功”、“益壽陰陽法”、“混元一氣功”等。 軟硬功夫練法有多種，有卸骨法、擒拿法、點穴秘法、短打手法、各種用藥法、救治法等。
少林功夫的要旨是禪武合一。少林寺是佛教禪宗的祖庭，禪宗以明心見性、頓悟成佛為要旨。在佛門眼中，參禪是正道，少林功夫傳人釋延芫曰：拳勇一類乃是末技，僧眾們不過是借練功習武達到收心斂性、屏慮入定的目的。同時也有強壯身體，益壽延年的效果。
