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從零開(kāi)始認(rèn)識(shí)c-MET(上)——基礎(chǔ)篇

作者:小山丘的旅行

對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者來(lái)說(shuō),MET擴(kuò)增或突變,是我們繞不開(kāi)的靶點(diǎn)。確診時(shí)發(fā)現(xiàn),或者靶向耐藥后出現(xiàn),都會(huì)影響我們接下來(lái)的治療跟選擇。

一、主要關(guān)注類型

c-MET通路的異常激活: 過(guò)表達(dá),基因變異(擴(kuò)增,突變,融合和反式激活等)。

(MET異常激活-文獻(xiàn)16)

我們重點(diǎn)關(guān)注:MET-14跳躍突變、MET擴(kuò)增、MET蛋白過(guò)表達(dá)。

我們不太認(rèn)為MET過(guò)表達(dá)是腫瘤的驅(qū)動(dòng)因素,傾向認(rèn)為它是基因異常激活發(fā)生的二次事件??紤]到它的預(yù)后相關(guān),以及各癌種不低的發(fā)生率(比如乳腺癌35-65%,胃癌30-70%,肝癌25-60%,腎細(xì)胞癌15-80%等),我們通常也將它列為了解的重點(diǎn)。

二、檢測(cè)方法

NCCN指南建議,對(duì)于EGFR-TKI耐藥患者,如果沒(méi)有檢測(cè)到T790M,應(yīng)考慮進(jìn)行MET擴(kuò)增復(fù)測(cè)。提示了MET檢測(cè)的必要和重要性。

MET過(guò)表達(dá)

免疫組化IHC檢測(cè),便宜、快速,很多醫(yī)院將它作為病理操作的常規(guī)項(xiàng)。

MET高表達(dá)+++相對(duì)有價(jià)值一些。雖然不太能直接指導(dǎo)治療,但如果靶向耐藥后檢測(cè)不到明確的耐藥因素 或者基因檢測(cè)到EGFR/ALK突變但用藥仍在進(jìn)展的,高表達(dá)或許能提示我們往MET方向考慮,甚至盲聯(lián)。

MET-14跳躍

RT-PCR跟二代NGS測(cè)序是主要方法,推薦二代測(cè)序NGS。

理由:

①RT-PCR快速便宜,但缺乏質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),假陰性也多;

②NGS技術(shù)的位點(diǎn)/類型覆蓋較全,更能匹配MET-14跳躍的多樣及共突變情況 (可能檢出的MET-14exon點(diǎn)突變,雖然發(fā)生頻率不高,但可能產(chǎn)生和MET-14skipping類似的生物學(xué)結(jié)果,影響MET通路。例如某肺腺癌病友,液體NGS檢出MET Y1003s突變,克唑替尼用藥效果良好,持續(xù)緩解近1年。)

液體NGS檢測(cè)存在漏檢,漏檢率可能達(dá)36%,也就是常說(shuō)的“檢出率問(wèn)題”。

為了提高檢出,NCCN指南推薦在DNA-NGS測(cè)序后,可以增加RNA-NGS檢測(cè)補(bǔ)充。(根據(jù)哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的回顧分析,液體ctDNA panel檢測(cè)到2.5%,但后續(xù)通過(guò)RNA驗(yàn)證檢測(cè)時(shí)增加到3.9%。)

MET擴(kuò)增

臨床常用的檢測(cè)技術(shù):FISH法(醫(yī)院/不貴)和NGS測(cè)序(院外/基因檢測(cè))。

條件理想的話,FISH和NGS都進(jìn)行檢測(cè)

理由:

FISH檢測(cè)可以較好地篩選出MET靶向獲益患者,而NGS可以更全面的了解MET和非MET的基因異常情況。

①M(fèi)ET擴(kuò)增形式=定點(diǎn)擴(kuò)增+多倍體

FISH或NGS檢測(cè)值,并不意味著都是有治療意義的MET擴(kuò)增及用藥有效。

因?yàn)檩^低水平的檢測(cè)值,很可能不是因?yàn)镸ET定點(diǎn)擴(kuò)增,而只是腫瘤細(xì)胞的7號(hào)染色體重復(fù)引起的拷貝數(shù)增加而已,即我們講的MET多體或多倍體。

(來(lái)源:91360智慧病理網(wǎng):MET突變/擴(kuò)增/14外顯子跳躍突變檢測(cè)方法的系統(tǒng)總結(jié)及注意事項(xiàng))

②組織FISH的Cut-off值

組織FISH是臨床研究常用的檢測(cè)法,多倍體和定點(diǎn)擴(kuò)增均能檢出,被認(rèn)為是MET擴(kuò)增檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn)。

從表格里的3個(gè)經(jīng)典臨床看,MET擴(kuò)增程度和不同藥物的響應(yīng)率有關(guān)。不同MET擴(kuò)增水平,療效數(shù)據(jù)明顯不一樣。

(MET基因擴(kuò)增與病人響應(yīng)率關(guān)系-文獻(xiàn)11)

為更好的預(yù)測(cè)、篩選區(qū)分MET用藥的獲益人群,我們有必要對(duì)檢測(cè)值進(jìn)行劃分。

按Cappuzzo和UCCC標(biāo)準(zhǔn),我們把FISH拷貝數(shù)GCN≥5或MET/CEP7比值≥2.0的定義為MET擴(kuò)增(定點(diǎn)擴(kuò)增),而如果是GCN<5或MET/CEP7比值<2,則定義為MET多倍體。[5]

實(shí)際上,以上的劃分標(biāo)準(zhǔn)也沒(méi)有成為共識(shí),臨床患者的篩選經(jīng)常不同。好在偏差也不會(huì)很大。綜合PROFILE 1001研究和上面的標(biāo)準(zhǔn),一般劃分為:

③NGS檢測(cè)的Cut-off值

  • 液體NGS

液體NGS檢測(cè),是可行的選擇。畢竟,每次都進(jìn)行組織活檢不太現(xiàn)實(shí)。缺點(diǎn)在于檢出率問(wèn)題。而且液體NGS對(duì)檢測(cè)技術(shù)要求較高。這方面的檢測(cè),推薦找大公司進(jìn)行檢測(cè),雖然價(jià)格高一些。

Le X,ASCO2021:基于Guardant 360試劑盒進(jìn)行NGS液體檢測(cè),GCN≥2.5為MET擴(kuò)增陽(yáng)性。特泊替尼的VISION試驗(yàn)也是以此為參考進(jìn)行入組篩選。

  • 組織NGS

Camidge R,JTO 2020 及Wolf J,NEJM 2020:基于FoudationONE CDX檢測(cè)GCN≥6為MET擴(kuò)增陽(yáng)性的Cut-off值。

(來(lái)源:2021ASCO Annual Meeting)

NGS檢測(cè)出的拷貝數(shù)GCN<6就意味著不是定點(diǎn)擴(kuò)增,用藥無(wú)效么?也不見(jiàn)得。只能說(shuō)GCN≥6的療效相對(duì)更好。

同時(shí)應(yīng)該了解的是,組織NGS同樣存在檢出率的問(wèn)題??赡苁荖GS對(duì)多倍體/真性擴(kuò)增的生信解讀存在過(guò)濾問(wèn)題,也可能是樣本質(zhì)控等問(wèn)題。

參考TATTON 1b 期的研究,質(zhì)控標(biāo)本的腫瘤細(xì)胞≥20%,可能更有利于準(zhǔn)確檢測(cè)。

MET融合

NGS二代測(cè)序應(yīng)該更有優(yōu)勢(shì)。

三.發(fā)生情況

按已有的臨床詢證,重點(diǎn)關(guān)注的是MET-14跳躍和MET擴(kuò)增。典型的,像上圖中的肺肉瘤樣癌PSC,MET-14跳躍突變發(fā)生率達(dá)到了20-31.8%,比例很高。

MET擴(kuò)增:原發(fā)+繼發(fā)

雖然MET擴(kuò)增的患者可能有50%以上有吸煙史,但MET擴(kuò)增水平跟性別、吸煙不見(jiàn)得有關(guān)系。

(1)原發(fā)MET擴(kuò)增,也就是MET異常引起,而不是因靶向或治療耐藥后得到。肺腺癌患者里,它的發(fā)生率大概2-4%。

其中,低水平的原發(fā)MET擴(kuò)增,可能有50%攜帶其他驅(qū)動(dòng)基因異常。而高水平的擴(kuò)增,較少出現(xiàn)驅(qū)動(dòng)基因共存的情況(如罕見(jiàn)的原發(fā)MET擴(kuò)增+EGFR突變)。

(2)繼發(fā)MET擴(kuò)增,也叫獲得性MET擴(kuò)增,是很常見(jiàn)的腫瘤耐藥機(jī)制之一。比如EGFR突變的患者,在使用一段時(shí)間EGFR靶向藥后,出現(xiàn)了MET基因異常導(dǎo)致EGFR-TKI耐藥和進(jìn)展。

①EGFR突變患者的獲得性耐藥

上海胸科醫(yī)院回顧性研究,NGS檢測(cè):原發(fā)MET擴(kuò)增3.27%(82/2507),EGFR靶向藥耐藥后獲得的MET擴(kuò)增16.04%。

其中,EGFR 1/2代靶向耐藥后約占5~10%左右。一線奧希替尼耐藥后大概是10-15%(III 期 FLAURA 試驗(yàn)15%)。二線奧希替尼耐藥后的MET耐藥約15-25%(III 期 AURA3 試驗(yàn)的血液樣本測(cè)序有19%)。

基于獲得性MET突變的發(fā)生率不低,NCCN和CSCO指南均提到,EGFR靶向耐藥后,除了T790M檢測(cè)外,可以考慮做個(gè)MET擴(kuò)增檢測(cè)。

②ALK突變患者的獲得性耐藥

分析136例ALK患者,靶向耐藥后的組織/血液標(biāo)本,約15%存在MET擴(kuò)增。其中二代阿來(lái)替尼/塞瑞替尼耐藥后12%,三代勞拉替尼耐藥后22%。

整體來(lái)說(shuō),一線克唑替尼后再用二代藥出現(xiàn)的MET擴(kuò)增大概9%,而一線阿來(lái)替尼/塞瑞替尼再用勞拉替尼出現(xiàn)MET擴(kuò)增的概率大約在33%。

MET-14跳躍

非小肺癌中,MET-14跳躍在確診時(shí)的發(fā)生率大概3-4%,在已知的NSCLC驅(qū)動(dòng)基因中排第四。男性>70歲的晚期患者群體比較多見(jiàn)。常見(jiàn)于肉瘤樣癌4.9-31.8%,腺鱗癌4-8%,鱗癌1-2%。

(MET外顯子14跳躍突變的發(fā)生率-文獻(xiàn)17)

ASCO2020報(bào)道,1387例NSCLC患者組織基因NGS檢測(cè),總計(jì)發(fā)現(xiàn)2.3%存在MET-14跳躍突變。而在這些患者里,跟EGFR突變同時(shí)發(fā)生的情況非常罕見(jiàn)(僅0.65%),但同時(shí)存在MET擴(kuò)增的可能有15-20%。

一些研究顯示,MET-14跳躍突變患者,如同時(shí)伴隨MET擴(kuò)增或MET高表達(dá),則MET抑制劑療效可能更好。

MET融合

MET融合基因類型有:SLC1A2-MET,PTPRZ1-MET,KIF5B-MET,HLA-DRB1-MET等。

盡管發(fā)生率非常低,但現(xiàn)有的報(bào)道表明MET融合基因在肺癌中具有致癌活性。其中,肺腺癌的MET融合發(fā)生率據(jù)報(bào)道為0.5%。

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參考文獻(xiàn)

⑴Lai GGY, Lim TH, Lim J, et al. Clonal MET Amplification as a Determinant of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance in Epidermal Growth Factor Receptor-Mutant Non-Small-Cell Lung Cancer. J Clin Oncol. 2019 Apr 10;37(11):876-884.

⑵Canadian Consensus Recommendations on the Management of MET-Altered NSCLC(2021)

⑶肺癌獲得性MET D1228V突變及對(duì)MET抑制劑的耐藥性: Cancer Discov. 2016 December ; 6(12): 1334–1341. doi:10.1158/2159-8290.CD-16-0686.

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⑸Gillianne G.Y. Lai,et al.Clonal MET Amplification as a Determinant of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance in Epidermal Growth Factor Receptor–Mutant Non–Small-Cell Lung Cancer.Journal of Clinical Oncology.January 24, 2019: DOI https://doi. org/10.1200/JCO.18.00177

⑹Camidge RD, Ou S-HI, Shapiro G, et al. Efficacy and safety of crizotinib in patients with advanced c-MET-amplified non-small cell lung cancer. J Clin Oncol 2014;32(Suppl 5):Abstract 8001.

⑺Wolf J, Seto T, Han JY, et al. Capmatinib in MET Exon 14-Mutated or MET-Amplified Non-Small-Cell Lung Cancer. N Engl J Med. 2020 Sep 3;383(10):944-957. doi: 10.1056/NEJMoa2002787. 

⑻Paik PK, Felip E, Veillon R, et al. Tepotinib in Non-Small-Cell Lung Cancer with MET Exon 14 Skipping Mutations. N Engl J Med. 2020 Sep 3;383(10):931-943. doi: 10.1056/NEJMoa2004407.

⑼Recondo G, Bahcall M,et al. Molecular Mechanisms of Acquired Resistance to MET Tyrosine Kinase Inhibitors in Patients with MET Exon 14-Mutant NSCLC. Clin Cancer Res. 2020 Jun 1;26(11):2615-2625. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-3608. Epub 2020 Feb 7. PMID: 32034073.

⑽OA15.04 - Telisotuzumab Vedotin (teliso-v) Monotherapy in Patients With Previously Treated c-Met+ Advanced Non-Small Cell Lung Cancer.2021 World Conference on Lung Cancer

⑾Robin Guo et al, MET-dependent solid tumours - molecular diagnosis and targeted therapy,Nat Rev Clin Oncol . 2020 Sep;17(9):569-587.

⑿Mark M. Awad, et al. Characterization of 1,387 NSCLCs with MET exon 14 (MET-14) skipping alterations (SA) and potential acquired resistance (AR) mechanisms. Presented at: 2020 ASCO Virtual Scientific Program; May 29, 2020. Abstract 9511.

(13)Kron A, , et al. Genetic heterogeneity of MET-aberrant non-small cell lung cancer and its impact on the outcome of immunotherapy.J Thorac Oncol.2020. DOI:10.1016/j.jtho.2020.11.017

(14)Sabari JK, Leonardi GC, Shu CA, et al: PD-L1 expression, tumor mutational burden, and response to immunotherapy in patients with MET exon 14 altered lung cancers. Ann Oncol.2018  DOI: 10.1093/annonc/mdy334

(15)Yasuhiro Kato,et al.Long-term efficacy of immune checkpoint inhibitors in non-small cell lung cancer patients harboring MET exon 14 skipping mutations. Int J Clin Oncol.2021  DOI: 10.1007/s10147-021-01893-0

(16)Hang-Ping Yao et al, Progress and challenge in development of biotherapeutics targeting MET receptor for treatment of advanced cancer,Biochim Biophys Acta Rev Cancer . 2020 Dec;1874(2):188425.

(17)Socinski, Mark A et al. “MET Exon 14 Skipping Mutations in Non-Small-Cell Lung Cancer: An Overview of Biology, Clinical Outcomes, and Testing Considerations.” JCO precision oncology vol. 5 PO.20.00516. 13 Apr. 2021, doi:10.1200/PO.20.00516

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