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育種5G時代,未來已來
這意味著全球農(nóng)業(yè)和糧食生產(chǎn)面臨巨大壓力!

品種改良和栽培、生產(chǎn)技術(shù)的提升是保障農(nóng)業(yè)和糧食安全的有效途徑,作物產(chǎn)量的提高有50%來自品種的改良。

但栽培、生產(chǎn)技術(shù)對作物產(chǎn)量的提升作用仍受限于作物的品種特性,可見解決以上問題的核心關(guān)鍵在于品種改良,即選育高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、高效的優(yōu)良品種。

根據(jù)育種技術(shù)的發(fā)展階段

將作物育種技術(shù)分為5個時代育種體系


第1代育種技術(shù)(1G)

作物馴化技術(shù)

對作物進(jìn)行馴化大約從1萬年前開始,早期的農(nóng)民并不懂得遺傳多樣性的理論,但是已經(jīng)開始有意識或無意識地在利用其價值對植物進(jìn)行偶然的選擇,他們會選擇在產(chǎn)量或其他性狀表現(xiàn)好的單株作為下一季栽培的種子,并不斷地繁殖下去。 

在作物馴化階段,世界范圍內(nèi)主要種植了約7000種作物,為現(xiàn)代栽培品種的培育奠定了遺傳資源基礎(chǔ),但是這一時期主要通過耕作者對自然變異的肉眼觀察做出主觀判斷,作物改良的進(jìn)展非常緩慢。

第2代育種技術(shù)(2G)

雜交育種

雜交育種始于19世紀(jì)中后期,以1865年為起點(diǎn),孟德爾在發(fā)現(xiàn)了植物遺傳定律后,數(shù)量遺傳學(xué)理論被建立起來,育種家和專業(yè)的科學(xué)家通過人工雜交的手段,有目的地在選配不同的親本進(jìn)行雜交、自交、回交等,結(jié)合雙親的優(yōu)良性狀培育改良作物品種。 

這一階段主要利用了經(jīng)典遺傳理論、統(tǒng)計學(xué)和田間試驗(yàn)設(shè)計等理論和手段,具有一定的預(yù)見性,但是偶然性大,育種效率低。

雜交小麥

雜交水稻

第3代育種技術(shù)(3G)

傳統(tǒng)育種

這一時期的育種包括雜種優(yōu)勢育種及主動誘變育種。以1926年先鋒公司雜交玉米種為標(biāo)志,玉米雜種優(yōu)勢和雙雜交種在商業(yè)化上應(yīng)用突出的表現(xiàn)帶動了雜種優(yōu)勢在水稻、高粱、油菜、棉花等其他作物上的運(yùn)用。1940年,物理、化學(xué)或太空誘變等手段在作物育種上開始應(yīng)用。

雜交育種、雜種優(yōu)勢育種及主動誘變育種這3種相繼出現(xiàn)的育種技術(shù)可被統(tǒng)一歸納為傳統(tǒng)育種,這些育種手段在過去近100年的時間里極大地提高了作物產(chǎn)量,緩解了“人口爆炸”帶來的糧食緊缺問題。

但此階段仍依賴于育種家的經(jīng)驗(yàn)來選擇好的表型育種材料,且由于傳統(tǒng)育種對于復(fù)雜性狀的選擇有限,因此難以兼顧產(chǎn)量、品質(zhì)及生物脅迫和非生物脅迫的抗耐性。

目前,世界大多數(shù)育種項(xiàng)目仍處在傳統(tǒng)育種(2G和3G)階段;

or

處于從傳統(tǒng)育種(3G)到分子技術(shù)育種(4G)過渡階段。


第4代育種技術(shù)(4G)

分子技術(shù)育種

自20世紀(jì)80年代開始,以轉(zhuǎn)基因、分子標(biāo)記輔助選擇、全基因組選擇、等位基因挖掘等為代表的現(xiàn)代分子技術(shù)手段開始在作物育種上運(yùn)用。

自1983年第1例轉(zhuǎn)基因植物開始,轉(zhuǎn)基因已經(jīng)發(fā)展成最快、應(yīng)用效率最高的精準(zhǔn)育種技術(shù)之一。在北美地區(qū),90%以上的玉米、大豆、棉花、甜菜和油菜是轉(zhuǎn)基因品種。分子標(biāo)記輔助選擇是20世紀(jì)80年代興起的DNA標(biāo)記技術(shù):利用與目標(biāo)基因緊密連鎖或表現(xiàn)共分離的分子標(biāo)記對選擇個體進(jìn)行篩選,從而減少連鎖累贅,獲得目標(biāo)個體。全基因組選擇是近年來動、植物分子育種的全新策略,已成為分子技術(shù)育種熱點(diǎn)和趨勢。其采用覆蓋整個基因組的分子標(biāo)記來捕獲整個基因組上的變異并對育種值進(jìn)行有效預(yù)測。 

分子技術(shù)育種是對傳統(tǒng)育種理論和技術(shù)的重大突破。目前,各國對QTL、MAS、GS和基因定位等精準(zhǔn)育種的理論和試驗(yàn)研究很多,但在實(shí)際育種中應(yīng)用十分有限,僅有拜耳-孟山都和科迪華等跨國種業(yè)巨頭的主要作物育種真正處在分子技術(shù)育種(4G)階段。

第五代育種技術(shù)(5G)

智能育種

智能育種(Smart breeding)技術(shù)體系:

利用農(nóng)作物基因型、表型、環(huán)境、遺傳資源(例如水稻上的品種系譜信息)等大數(shù)據(jù)為核心基礎(chǔ),通過人工生物智能技術(shù),在實(shí)驗(yàn)室設(shè)計培育出一種適合于特定地理區(qū)域和環(huán)境下的品系品種。而傳統(tǒng)上的大田僅僅作為品種測試和驗(yàn)證的場所。從而節(jié)省了大量的人力、物力、財力、環(huán)境壓力等資源。智能育種是依托多層面生物技術(shù)和信息技術(shù),跨學(xué)科、多交叉的一種育種方式。 

核心一:基因型大數(shù)據(jù)

基因型數(shù)據(jù)主要來自5種基因技術(shù)利用數(shù)據(jù),巧合也是5G,但是這個G是技術(shù),而不是代數(shù)。
主要包括:
1)種質(zhì)資源鑒定 Germplasm characterization
2)基因編輯 Gene editing

基因編輯是應(yīng)用先進(jìn)的基因組學(xué)和分子生物學(xué)工具對功能已知的重要基因序列進(jìn)行定向敲出、單堿基替換、同源區(qū)段替換等操作,創(chuàng)造新的有益遺傳變異,從而實(shí)現(xiàn)作物的定向精準(zhǔn)改良,在農(nóng)作物抗病、抗逆性、園藝作物的花色、保存性等農(nóng)業(yè)性狀的改良上發(fā)揮作用。

3)基因功能鑒定 Gene function identification
4)基因組組裝 Genome assembly
5)基因組育種方法 Genomic breeding methodologies

核心二:表現(xiàn)型數(shù)據(jù)大數(shù)據(jù)

表現(xiàn)型大多數(shù)是平常可以看得到的東西,例如水稻上的稻谷大小、米粒長短等。傳統(tǒng)上都是用眼、筆、紙人工測定,但是20世紀(jì)90年代表型數(shù)據(jù)搜集基本已經(jīng)進(jìn)入數(shù)字化階段。

室外主要以衛(wèi)星、飛機(jī)、高密度攝像儀高空攝像機(jī)、地面小型機(jī)器人、紅外儀、紫外儀等;室內(nèi)表型技術(shù)以德國LemnaTec?(全球最大的室內(nèi)室外型植物表型系統(tǒng))以及原杜邦-陶氏化學(xué)的FAST-CORN?為代表。 

核心三:環(huán)境大數(shù)據(jù)

主要包括:
(1)地上部分的數(shù)據(jù):溫度、相對濕度、降雨量、降雪量、日長、日照強(qiáng)度等。
(2)地面上面的數(shù)據(jù):病菌(生理小種、群體、分布等)、昆蟲(生物型、群體、分布等)、雜草(類型、群體、分布等)。
(3)地下部分的數(shù)據(jù):土壤特性(類型、結(jié)構(gòu)、肥力、水分等)、土壤微生物(類型、群體、分布等)。 

目前世界上如拜耳-孟山都和科迪華等跨國種業(yè)巨頭基本上能夠?qū)崿F(xiàn)作物性狀調(diào)控基因的快速挖掘與表型的精準(zhǔn)預(yù)測,從而建立智能組合優(yōu)良等位基因的自然變異、人工變異、數(shù)量性狀位點(diǎn),具有多基因與多性狀聚合的育種設(shè)計方案,實(shí)現(xiàn)智能、高效、定向培育新品種。 

智能育種的基本技術(shù)路線

智能設(shè)計適合特定環(huán)境的、用于構(gòu)建育種分離群體的雜交組合;

在田間重復(fù)產(chǎn)量測試之前,應(yīng)用基于基因型大數(shù)據(jù)、表型大數(shù)據(jù)、環(huán)境大數(shù)據(jù)已建立和驗(yàn)證的基因型-表型環(huán)境模型,對優(yōu)異品系和試驗(yàn)性雜交種的適應(yīng)性、產(chǎn)量、品質(zhì)性狀進(jìn)行大量計算機(jī)模擬,模擬在不同環(huán)境條件下的表現(xiàn)和穩(wěn)定性;

對單個個體在同一世代進(jìn)行大規(guī)模、多位點(diǎn)的精準(zhǔn)基因組編輯,同時創(chuàng)造多個優(yōu)異等位基因;

在全基因組水平上對已知的不同位點(diǎn)等位基因的最佳組合進(jìn)行多基因與多性狀的聚合;

培育出像聰明蛋(SmartStack?)玉米品種為代表的真正的高科技農(nóng)作物品種。

深度融合了生命科學(xué)、信息科學(xué)和育種科學(xué)的智能育種是科技發(fā)展帶來的新機(jī)遇,預(yù)計在未來10~20年,智能育種發(fā)展的快慢勢必成為種業(yè)核心價值和競爭力的體現(xiàn)。


由傳統(tǒng)育種到分子育種,再到智能育種:

育種的“科學(xué)”成分含量越來越多,而育種的“藝術(shù)”成分含量越來越少;

實(shí)驗(yàn)室基因型分析的個體、品系數(shù)目越來越多,而需要在田間測試的個體、品系數(shù)目越來越少。

可見,育種的預(yù)見性、準(zhǔn)確性、效率越來越高,實(shí)現(xiàn)的經(jīng)濟(jì)、社會和環(huán)境效益也越來越高。
目前我國大部分作物育種仍然處在傳統(tǒng)育種(2G和3G)階段,僅少部分作物已經(jīng)處于傳統(tǒng)育種(3G)向分子技術(shù)育種(4G)的轉(zhuǎn)變階段,而世界種業(yè)巨頭憑借著雄厚的資本、先進(jìn)的技術(shù)基礎(chǔ)等優(yōu)勢,已加速朝智能育種(5G)階段邁進(jìn)。

必須緊抓全球新一輪科技革命和產(chǎn)業(yè)革命迭代的機(jī)遇,整合和引導(dǎo)科技資源及人才向育種5G技術(shù)靠攏,加快原始創(chuàng)新,搶占種業(yè)技術(shù)制高點(diǎn),確保我國種業(yè)具有持續(xù)競爭力,保障我國糧食安全、食品安全和生態(tài)安全。

5G 時代 未來已來




● 本文選自《5 代(5G)作物育種技術(shù)體系》

● 作者:應(yīng)繼鋒,劉定富,趙健 

● 單位:中國水稻研究所,華智生物技術(shù)有限公司,武漢金玉良種科技有限公司

● 刊于《中國種業(yè)》2020年第10期1-3頁 轉(zhuǎn)載請注明



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