PaddlePaddle的基本數(shù)據(jù)格式
根據(jù)官網(wǎng)的資料,總結(jié)出PaddlePaddle支持多種不同的數(shù)據(jù)格式,包括四種數(shù)據(jù)類(lèi)型和三種序列格式:
四種數(shù)據(jù)類(lèi)型:
dense_vector:稠密的浮點(diǎn)數(shù)向量。
sparse_binary_vector:稀疏的二值向量,即大部分值為0,但有值的地方必須為1。
sparse_float_vector:稀疏的向量,即大部分值為0,但有值的部分可以是任何浮點(diǎn)數(shù)。
integer:整型格式
api如下:
paddle.v2.data_type.dense_vector(dim, seq_type=0)
dim(int) 向量維度
seq_type(int)輸入的序列格式
說(shuō)明:稠密向量,輸入特征是一個(gè)稠密的浮點(diǎn)向量。舉個(gè)例子,手寫(xiě)數(shù)字識(shí)別里的輸入圖片是28*28的像素,Paddle的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入應(yīng)該是一個(gè)784維的稠密向量。
參數(shù):
返回類(lèi)型:InputType
paddle.v2.data_type.sparse_binary_vector(dim, seq_type=0)
說(shuō)明:稀疏的二值向量。輸入特征是一個(gè)稀疏向量,這個(gè)向量的每個(gè)元素要么是0,要么是1
參數(shù):同上
返回類(lèi)型:同上
paddle.v2.data_type.sparse_vector(dim, seq_type=0)
說(shuō)明:稀疏向量,向量里大多數(shù)元素是0,其他的值可以是任意的浮點(diǎn)值
參數(shù):同上
返回類(lèi)型:同上
paddle.v2.data_type.integer_value(value_range, seq_type=0)
seq_type(int):輸入的序列格式
value_range(int):每個(gè)元素的范圍
說(shuō)明:整型格式
參數(shù):
返回類(lèi)型:InputType
三種序列格式:
SequenceType.NO_SEQUENCE:不是一條序列
SequenceType.SEQUENCE:是一條時(shí)間序列
SequenceType.SUB_SEQUENCE: 是一條時(shí)間序列,且序列的每一個(gè)元素還是一個(gè)時(shí)間序列。
api如下:
paddle.v2.data_type.dense_vector_sequence(dim, seq_type=0)
說(shuō)明:稠密向量的序列格式
參數(shù):dim(int):稠密向量的維度
返回類(lèi)型:InputType
paddle.v2.data_type.sparse_binary_vector_sequence(dim, seq_type=0)
說(shuō)明:稀疏的二值向量序列。每個(gè)序列里的元素要么是0要么是1
參數(shù):dim(int):稀疏向量的維度
返回類(lèi)型:InputType
paddle.v2.data_type.sparse_non_value_slot(dim, seq_type=0)
dim(int):稀疏向量的維度
seq_type(int):輸入的序列格式
說(shuō)明:稀疏的向量序列。每個(gè)序列里的元素要么是0要么是1
參數(shù):
返回類(lèi)型:InputType
paddle.v2.data_type.sparse_value_slot(dim, seq_type=0)
dim(int):稀疏向量的維度
seq_type(int):輸入的序列格式
說(shuō)明:稀疏的向量序列,向量里大多數(shù)元素是0,其他的值可以是任意的浮點(diǎn)值
參數(shù):
返回類(lèi)型:InputType
說(shuō)明:value_range(int):每個(gè)元素的范圍
paddle.v2.data_type.integer_value_sequence(value_range, seq_type=0)
不同的數(shù)據(jù)類(lèi)型和序列模式返回的格式不同,如下表:
其中f表示浮點(diǎn)數(shù),i表示整數(shù)
注意:對(duì)sparse_binary_vector和sparse_float_vector,PaddlePaddle存的是有值位置的索引。例如,
對(duì)一個(gè)5維非序列的稀疏01向量 [0, 1, 1, 0, 0]
,類(lèi)型是sparse_binary_vector,返回的是 [1, 2]
。(因?yàn)橹挥械?位和第2位有值)
對(duì)一個(gè)5維非序列的稀疏浮點(diǎn)向量 [0, 0.5, 0.7, 0, 0]
,類(lèi)型是sparse_float_vector,返回的是 [(1, 0.5), (2, 0.7)]
。(因?yàn)橹挥械谝晃缓偷诙挥兄?,分別是0.5和0.7)
PaddlePaddle的數(shù)據(jù)讀取方式
我們了解了上文的四種基本數(shù)據(jù)格式和三種序列模式后,在處理自己的數(shù)據(jù)時(shí)可以根據(jù)需求選擇,但是處理完數(shù)據(jù)后如何把數(shù)據(jù)放到模型里去訓(xùn)練呢?我們知道,基本的方法一般有兩種:
一次性加載到內(nèi)存:模型訓(xùn)練時(shí)直接從內(nèi)存中取數(shù)據(jù),不需要大量的IO消耗,速度快,適合少量數(shù)據(jù)。
加載到磁盤(pán)/HDFS/共享存儲(chǔ)等:這樣不用占用內(nèi)存空間,在處理大量數(shù)據(jù)時(shí)一般采取這種方式,但是缺點(diǎn)是每次數(shù)據(jù)加載進(jìn)來(lái)也是一次IO的開(kāi)銷(xiāo),非常影響速度。
在PaddlePaddle中我們可以有三種模式來(lái)讀取數(shù)據(jù):分別是reader、reader creator和reader decorator,這三者有什么區(qū)別呢?
reader:從本地、網(wǎng)絡(luò)、分布式文件系統(tǒng)HDFS等讀取數(shù)據(jù),也可隨機(jī)生成數(shù)據(jù),并返回一個(gè)或多個(gè)數(shù)據(jù)項(xiàng)。
reader creator:一個(gè)返回reader的函數(shù)。
reader decorator:裝飾器,可組合一個(gè)或多個(gè)reader。
reader
我們先以reader為例,為房?jī)r(jià)數(shù)據(jù)(斯坦福吳恩達(dá)的公開(kāi)課第一課舉例的數(shù)據(jù))創(chuàng)建一個(gè)reader:
創(chuàng)建一個(gè)reader,實(shí)質(zhì)上是一個(gè)迭代器,每次返回一條數(shù)據(jù)(此處以房?jī)r(jià)數(shù)據(jù)為例)
reader = paddle.dataset.uci_housing.train()
2. 創(chuàng)建一個(gè)shuffle_reader,把上一步的reader放進(jìn)去,配置buf_size就可以讀取buf_size大小的數(shù)據(jù)自動(dòng)做shuffle,讓數(shù)據(jù)打亂,隨機(jī)化
shuffle_reader = paddle.reader.shuffle(reader,buf_size= 100)
3.創(chuàng)建一個(gè)batch_reader,把上一步混洗好的shuffle_reader放進(jìn)去,給定batch_size,即可創(chuàng)建。
batch_reader = paddle.batch(shuffle_reader,batch_size = 2)
這三種方式也可以組合起來(lái)放一塊:
reader = paddle.batch( paddle.reader.shuffle( uci_housing.train(), buf_size = 100), batch_size=2)
可以以一個(gè)直觀(guān)的圖來(lái)表示:
從圖中可以看到,我們可以直接從原始數(shù)據(jù)集里拿去數(shù)據(jù),用reader讀取,一條條灌倒shuffle_reader里,在本地隨機(jī)化,把數(shù)據(jù)打亂,做shuffle,然后把shuffle后的數(shù)據(jù),一個(gè)batch一個(gè)batch的形式,批量的放到訓(xùn)練器里去進(jìn)行每一步的迭代和訓(xùn)練。 流程簡(jiǎn)單,而且只需要使用一行代碼即可實(shí)現(xiàn)整個(gè)過(guò)程。
reader creator
如果想要生成一個(gè)簡(jiǎn)單的隨機(jī)數(shù)據(jù),以reader creator為例:
def reader_creator(): def reader(): while True: yield numpy.random.uniform(-1,1,size=784) return reader
源碼見(jiàn)creator.py, 支持四種格式:np_array,text_file,RecordIO和cloud_reader
__all__ = ['np_array', 'text_file', 'cloud_reader']
def np_array(x):
'''
Creates a reader that yields elements of x, if it is a
numpy vector. Or rows of x, if it is a numpy matrix.
Or any sub-hyperplane indexed by the highest dimension.
:param x: the numpy array to create reader from.
:returns: data reader created from x.
'''
def reader():
if x.ndim <>
yield x
for e in x:
yield e
return reader
def text_file(path):
'''
Creates a data reader that outputs text line by line from given text file.
Trailing new line ('\\\\n') of each line will be removed.
:path: path of the text file.
:returns: data reader of text file
'''
def reader():
f = open(path, 'r')
for l in f:
yield l.rstrip('\n')
f.close()
return reader
def recordio(paths, buf_size=100):
'''
Creates a data reader from given RecordIO file paths separated by ',',
glob pattern is supported.
:path: path of recordio files, can be a string or a string list.
:returns: data reader of recordio files.
'''
import recordio as rec
import paddle.v2.reader.decorator as dec
import cPickle as pickle
def reader():
if isinstance(paths, basestring):
path = paths
else:
path = ','.join(paths)
f = rec.reader(path)
while True:
r = f.read()
if r is None:
break
yield pickle.loads(r)
f.close()
return dec.buffered(reader, buf_size)
pass_num = 0
def cloud_reader(paths, etcd_endpoints, timeout_sec=5, buf_size=64):
'''
Create a data reader that yield a record one by one from
the paths:
:paths: path of recordio files, can be a string or a string list.
:etcd_endpoints: the endpoints for etcd cluster
:returns: data reader of recordio files.
.. code-block:: python
from paddle.v2.reader.creator import cloud_reader
etcd_endpoints = 'http://127.0.0.1:2379'
trainer.train.(
reader=cloud_reader(['/work/dataset/uci_housing/uci_housing*'], etcd_endpoints),
)
'''
import os
import cPickle as pickle
import paddle.v2.master as master
c = master.client(etcd_endpoints, timeout_sec, buf_size)
if isinstance(paths, basestring):
path = [paths]
else:
path = paths
c.set_dataset(path)
def reader():
global pass_num
c.paddle_start_get_records(pass_num)
pass_num += 1
while True:
r, e = c.next_record()
if not r:
if e != -2:
print 'get record error: ', e
break
yield pickle.loads(r)
return reader
reader decorator
如果想要讀取同時(shí)讀取兩部分的數(shù)據(jù),那么可以定義兩個(gè)reader,合并后對(duì)其進(jìn)行shuffle。如我想讀取所有用戶(hù)對(duì)比車(chē)系的數(shù)據(jù)和瀏覽車(chē)系的數(shù)據(jù),可以定義兩個(gè)reader,分別為contrast()和view(),然后通過(guò)預(yù)定義的reader decorator緩存并組合這些數(shù)據(jù),在對(duì)合并后的數(shù)據(jù)進(jìn)行亂序操作。源碼見(jiàn)decorator.py
data = paddle.reader.shuffle( paddle.reader.compose( paddle.reader(contradt(contrast_path),buf_size = 100), paddle.reader(view(view_path),buf_size = 200), 500)
這樣有一個(gè)很大的好處,就是組合特征來(lái)訓(xùn)練變得更容易了!傳統(tǒng)的跑模型的方法是,確定label和feature,盡可能多的找合適的feature扔到模型里去訓(xùn)練,這樣我們就需要做一張大表,訓(xùn)練完后我們可以分析某些特征的重要性然后重新增加或減少一些feature來(lái)進(jìn)行訓(xùn)練,這樣我們有需要對(duì)原來(lái)的label-feature表進(jìn)行修改,如果數(shù)據(jù)量小沒(méi)啥影響,就是麻煩點(diǎn),但是數(shù)據(jù)量大的話(huà)需要每一次增加feature,和主鍵、label來(lái)join的操作都會(huì)很耗時(shí),如果采取這種方式的話(huà),我們可以對(duì)某些同一類(lèi)的特征做成一張表,數(shù)據(jù)存放的地址存為一個(gè)變量名,每次跑模型的時(shí)候想選取幾類(lèi)特征,就創(chuàng)建幾個(gè)reader,用reader decorator 組合起來(lái),最后再shuffle灌倒模型里去訓(xùn)練。這!樣!是!不!是!很!方!便!
如果沒(méi)理解,我舉一個(gè)實(shí)例,假設(shè)我們要預(yù)測(cè)用戶(hù)是否會(huì)買(mǎi)車(chē),label是買(mǎi)車(chē) or 不買(mǎi)車(chē),feature有瀏覽車(chē)系、對(duì)比車(chē)系、關(guān)注車(chē)系的功能偏好等等20個(gè),傳統(tǒng)的思維是做成這樣一張表:
如果想要減少feature_2,看看feature_2對(duì)模型的準(zhǔn)確率影響是否很大,那么我們需要在這張表里去掉這一列,想要增加一個(gè)feature的話(huà),也需要在feature里增加一列,如果用reador decorator的話(huà),我們可以這樣做數(shù)據(jù)集:
把相同類(lèi)型的feature放在一起,不用頻繁的join減少時(shí)間,一共做四個(gè)表,創(chuàng)建4個(gè)reador:
data = paddle.reader.shuffle(
paddle.reader.compose(
paddle.reader(table1(table1_path),buf_size = 100),
paddle.reader(table2(table2_path),buf_size = 100),
paddle.reader(table3(table3_path),buf_size = 100),
paddle.reader(table4(table4_path),buf_size = 100),
500)
如果新發(fā)現(xiàn)了一個(gè)特征,想嘗試這個(gè)特征對(duì)模型提高準(zhǔn)確率有沒(méi)有用,可以再單獨(dú)把這個(gè)特征數(shù)據(jù)提取出來(lái),再增加一個(gè)reader,用reader decorator組合起來(lái),shuffle后放入模型里跑就行了。
PaddlePaddle的數(shù)據(jù)預(yù)處理實(shí)例
還是以手寫(xiě)數(shù)字為例,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理后并劃分train和test,只需要4步即可:
1.指定數(shù)據(jù)地址
import paddle.v2.dataset.common
import subprocess
import numpy
import platform
__all__ = ['train', 'test', 'convert']
URL_PREFIX = 'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/'
TEST_IMAGE_URL = URL_PREFIX + 't10k-images-idx3-ubyte.gz'
TEST_IMAGE_MD5 = '9fb629c4189551a2d022fa330f9573f3'
TEST_LABEL_URL = URL_PREFIX + 't10k-labels-idx1-ubyte.gz'
TEST_LABEL_MD5 = 'ec29112dd5afa0611ce80d1b7f02629c'
TRAIN_IMAGE_URL = URL_PREFIX + 'train-images-idx3-ubyte.gz'
TRAIN_IMAGE_MD5 = 'f68b3c2dcbeaaa9fbdd348bbdeb94873'
TRAIN_LABEL_URL = URL_PREFIX + 'train-labels-idx1-ubyte.gz'
TRAIN_LABEL_MD5 = 'd53e105ee54ea40749a09fcbcd1e9432'
2.創(chuàng)建reader creator
def reader_creator(image_filename, label_filename, buffer_size):
# 創(chuàng)建一個(gè)reader
def reader():
if platform.system() == 'Darwin':
zcat_cmd = 'gzcat'
elif platform.system() == 'Linux':
zcat_cmd = 'zcat'
else:
raise NotImplementedError()
m = subprocess.Popen([zcat_cmd, image_filename], stdout=subprocess.PIPE)
m.stdout.read(16)
l = subprocess.Popen([zcat_cmd, label_filename], stdout=subprocess.PIPE)
l.stdout.read(8)
try: # reader could be break.
while True:
labels = numpy.fromfile(
l.stdout, 'ubyte', count=buffer_size).astype('int')
if labels.size != buffer_size:
break # numpy.fromfile returns empty slice after EOF.
images = numpy.fromfile(
m.stdout, 'ubyte', count=buffer_size * 28 * 28).reshape(
(buffer_size, 28 * 28)).astype('float32')
images = images / 255.0 * 2.0 - 1.0
for i in xrange(buffer_size):
yield images[i, :], int(labels[i])
finally:
m.terminate()
l.terminate()
return reader
3.創(chuàng)建訓(xùn)練集和測(cè)試集
def train():
'''
創(chuàng)建mnsit的訓(xùn)練集 reader creator
返回一個(gè)reador creator,每個(gè)reader里的樣本都是圖片的像素值,在區(qū)間[0,1]內(nèi),label為0~9
返回:training reader creator
'''
return reader_creator(
paddle.v2.dataset.common.download(TRAIN_IMAGE_URL, 'mnist',
TRAIN_IMAGE_MD5),
paddle.v2.dataset.common.download(TRAIN_LABEL_URL, 'mnist',
TRAIN_LABEL_MD5), 100)
def test():
'''
創(chuàng)建mnsit的測(cè)試集 reader creator
返回一個(gè)reador creator,每個(gè)reader里的樣本都是圖片的像素值,在區(qū)間[0,1]內(nèi),label為0~9
返回:testreader creator
'''
return reader_creator(
paddle.v2.dataset.common.download(TEST_IMAGE_URL, 'mnist',
TEST_IMAGE_MD5),
paddle.v2.dataset.common.download(TEST_LABEL_URL, 'mnist',
TEST_LABEL_MD5), 100)
4.下載數(shù)據(jù)并轉(zhuǎn)換成相應(yīng)格式
def fetch():
paddle.v2.dataset.common.download(TRAIN_IMAGE_URL, 'mnist', TRAIN_IMAGE_MD5)
paddle.v2.dataset.common.download(TRAIN_LABEL_URL, 'mnist', TRAIN_LABEL_MD5)
paddle.v2.dataset.common.download(TEST_IMAGE_URL, 'mnist', TEST_IMAGE_MD5)
paddle.v2.dataset.common.download(TEST_LABEL_URL, 'mnist', TRAIN_LABEL_MD5)
def convert(path):
'''
將數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換為 recordio format
'''
paddle.v2.dataset.common.convert(path, train(), 1000, 'minist_train')
paddle.v2.dataset.common.convert(path, test(), 1000, 'minist_test')
如果想換成自己的訓(xùn)練數(shù)據(jù),只需要按照步驟改成自己的數(shù)據(jù)地址,創(chuàng)建相應(yīng)的reader creator(或者reader decorator)即可。
這是圖像的例子,如果我們想訓(xùn)練一個(gè)文本模型,做一個(gè)情感分析,這個(gè)時(shí)候如何處理數(shù)據(jù)呢?步驟也很簡(jiǎn)單。
假設(shè)我們有一堆數(shù)據(jù),每一行為一條樣本,以 \t 分隔,第一列是類(lèi)別標(biāo)簽,第二列是輸入文本的內(nèi)容,文本內(nèi)容中的詞語(yǔ)以空格分隔。以下是兩條示例數(shù)據(jù):
現(xiàn)在開(kāi)始做數(shù)據(jù)預(yù)處理
1.創(chuàng)建reader
def train_reader(data_dir, word_dict, label_dict):
def reader():
UNK_ID = word_dict['
'] word_col = 0
lbl_col = 1
for file_name in os.listdir(data_dir):
with open(os.path.join(data_dir, file_name), 'r') as f:
for line in f:
line_split = line.strip().split('\t')
word_ids = [
word_dict.get(w, UNK_ID)
for w in line_split[word_col].split()
]
yield word_ids, label_dict[line_split[lbl_col]]
return reader
返回類(lèi)型為: paddle.data_type.integer_value_sequence(詞語(yǔ)在字典的序號(hào))和 paddle.data_type.integer_value(類(lèi)別標(biāo)簽)
2.組合讀取方式
train_reader = paddle.batch(
paddle.reader.shuffle(
reader.train_reader(train_data_dir, word_dict, lbl_dict),
buf_size=1000),
batch_size=batch_size)
完整的代碼如下(加上了劃分train和test部分):
import os
def train_reader(data_dir, word_dict, label_dict):
'''
創(chuàng)建訓(xùn)練數(shù)據(jù)reader
:param data_dir: 數(shù)據(jù)地址.
:type data_dir: str
:param word_dict: 詞典地址,
詞典里必須有 'UNK' .
:type word_dict:python dict
:param label_dict: label 字典的地址
:type label_dict: Python dict
'''
def reader():
UNK_ID = word_dict['
'] word_col = 1
lbl_col = 0
for file_name in os.listdir(data_dir):
with open(os.path.join(data_dir, file_name), 'r') as f:
for line in f:
line_split = line.strip().split('\t')
word_ids = [
word_dict.get(w, UNK_ID)
for w in line_split[word_col].split()
]
yield word_ids, label_dict[line_split[lbl_col]]
return reader
def test_reader(data_dir, word_dict):
'''
創(chuàng)建測(cè)試數(shù)據(jù)reader
:param data_dir: 數(shù)據(jù)地址.
:type data_dir: str
:param word_dict: 詞典地址,
詞典里必須有 'UNK' .
:type word_dict:python dict
'''
def reader():
UNK_ID = word_dict['
'] word_col = 1
for file_name in os.listdir(data_dir):
with open(os.path.join(data_dir, file_name), 'r') as f:
for line in f:
line_split = line.strip().split('\t')
if len(line_split) < word_col:="">
word_ids = [
word_dict.get(w, UNK_ID)
for w in line_split[word_col].split()
]
yield word_ids, line_split[word_col]
return reader
總結(jié)
這篇文章主要講了在paddlepaddle里如何加載自己的數(shù)據(jù)集,轉(zhuǎn)換成相應(yīng)的格式,并劃分train和test。我們?cè)谑褂靡粋€(gè)框架的時(shí)候通常會(huì)先去跑幾個(gè)簡(jiǎn)單的demo,但是如果不用常見(jiàn)的demo的數(shù)據(jù),自己做一個(gè)實(shí)際的項(xiàng)目,完整的跑通一個(gè)模型,這才代表我們掌握了這個(gè)框架的基本應(yīng)用知識(shí)。跑一個(gè)模型第一步就是數(shù)據(jù)預(yù)處理,在paddlepaddle里,提供的方式非常簡(jiǎn)單,但是有很多優(yōu)點(diǎn):
shuffle數(shù)據(jù)非常方便
可以將數(shù)據(jù)組合成batch訓(xùn)練
可以利用reader decorator來(lái)組合多個(gè)reader,提高組合特征運(yùn)行模型的效率
可以多線(xiàn)程讀取數(shù)據(jù)
而我之前使用過(guò)mxnet來(lái)訓(xùn)練車(chē)牌識(shí)別的模型,50w的圖片數(shù)據(jù)想要一次訓(xùn)練是非常慢的,這樣的話(huà)就有兩個(gè)解決方法:一是批量訓(xùn)練,這一點(diǎn)大多數(shù)的框架都會(huì)有, 二是轉(zhuǎn)換成mxnet特有的rec格式,提高讀取效率,可以通過(guò)im2rec.py將圖片轉(zhuǎn)換,比較麻煩,如果是tesnorflow,也有相對(duì)應(yīng)的特定格式tfrecord,這幾種方式各有優(yōu)劣,從易用性上,paddlepaddle是比較簡(jiǎn)單的。
這篇文章沒(méi)有與上篇銜接起來(lái),因?yàn)榭吹接泻脦追忄]件都有問(wèn)怎么自己加載數(shù)據(jù)訓(xùn)練,所以就決定插入一節(jié)先把這個(gè)寫(xiě)了。下篇文章我們接著講CNN的進(jìn)階知識(shí)。下周見(jiàn)^_^!
聯(lián)系客服