富集分析是快速了解興趣基因功能傾向性的方法之一，主要有兩種方式：①基于差異基因判斷上調(diào)或下調(diào)基因在GO或KEGG通路的富集情況，即GO或KEGG分析；②不篩選，直接根據(jù)基因的表達量或與表型相關(guān)度排序，判斷基因集是否傾向于落在參考基因集的頂部或底部，從而判斷基因集對表型差異的影響，即GSEA富集分析。富集分析在SCI論文中的應(yīng)用越來越廣泛，涉及到許多領(lǐng)域，比如癌癥研究、免疫學(xué)研究等，成為了生信領(lǐng)域最常見的分析方法之一。
通俗說，GO分析在描述“一個人的顏值和實力”，KEGG分析在闡述“一個人的社會關(guān)系”，而GSEA分析則探究“一個人的階層屬性”。富集情況可視化展示的方式很多，如條形圖、氣泡圖、富集圈圖等，其中條形圖和氣泡圖最常見。盡管有些在線平臺可以展示GO分析、KEGG分析和GSEA分析的結(jié)果，但是用R個性化分析和展示才是王道吧。
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Enrichr是一個基于網(wǎng)頁端的綜合性基因集富集分析工具。Enrichr包含大量可用于分析和下載的，來自102個基因集庫的180184個注釋基因集。此外，新版Enrichr還增加了一些新功能，包括提交模糊集，上傳BED文件，改進的應(yīng)用程序編程接口以及將結(jié)果可視化為簇的能力。因此，Enrichr是一個綜合性資源，是一個可用于基因組和詞條搜索的引擎。因此，我們推薦Enrichr用于富集分析。
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