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解螺旋公眾號(hào)·陪伴你科研的第1764天

Graphpad Prism 8.0是由Graphpad公司推出的一款非常實(shí)用的醫(yī)學(xué)繪圖軟件，集生物統(tǒng)計(jì)、曲線擬合和科技繪圖于一體可用于Windows和Mac電腦，在生物學(xué)以及社會(huì)和物理科學(xué)界得到廣泛使用。酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)(ELISA)與蛋白濃度測(cè)定均涉及數(shù)據(jù)擬合，廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)中。今天給大家分享如何使用Graphpad Prism 8.0、Excel、ELISACalc、Origin軟件對(duì)散點(diǎn)圖進(jìn)行擬合。

Excel擬合數(shù)據(jù)

我們先分享使用Excel進(jìn)行簡(jiǎn)單的線性擬合。濃度與OD值原始數(shù)據(jù)如下：

步驟如下：

1. 鼠標(biāo)選中數(shù)據(jù)，點(diǎn)擊插入，插入散點(diǎn)圖：

2．點(diǎn)擊散點(diǎn)圖右上角加號(hào)，勾選上趨勢(shì)線：

點(diǎn)擊更多選項(xiàng)，勾選顯示公式和顯示R平方值：

即可得到擬合公式：Y=2.1758X+0.0315,R2=0.9986：

上述例子是對(duì)散點(diǎn)進(jìn)行了簡(jiǎn)單的線性擬合，處線性擬合外還可以進(jìn)行指數(shù)擬合、對(duì)數(shù)擬合、多項(xiàng)式擬合、冪擬合與移動(dòng)平均值擬合：

當(dāng)然還可以進(jìn)行自定義擬合：

ELISACalc對(duì)散點(diǎn)圖進(jìn)行擬合

在ELISACalc軟件中輸入與Excel相同數(shù)據(jù)：

點(diǎn)擊回歸擬合：

點(diǎn)擊回歸方程，得到與Excel擬合一樣的結(jié)果：

點(diǎn)擊

處簡(jiǎn)單的線性擬合外，ELISACalc軟件可以進(jìn)行以下多種擬合方法：

下圖是ELISA四參數(shù)擬合的標(biāo)準(zhǔn)曲線結(jié)果：

Origin軟件對(duì)散點(diǎn)圖進(jìn)行擬合

輸入數(shù)據(jù)后繪制基本散點(diǎn)圖：

進(jìn)行Logistic曲線四參數(shù)擬合。點(diǎn)擊Analysis，F(xiàn)itting，Nonlinear Curve Fit,Open Dialog…

進(jìn)入如下界面：

選擇Function，Logistic：

在Setting下選擇Find X/Y，由此根據(jù)測(cè)得待測(cè)樣品的OD值計(jì)算待測(cè)樣品的濃度。選擇Find X from Y，即由OD值計(jì)算濃度。

點(diǎn)擊Fit，得到擬合曲線以及擬合公式，R2：

Graphpad Prism 8.0對(duì)散點(diǎn)圖進(jìn)行擬合

4.1 Graphpad Prism 8.0進(jìn)行線性擬合

本期主角Graphpad Prism 8.0閃亮登場(chǎng)了，先以Excel線性擬合的數(shù)據(jù)為例，基本步驟為：

1. 打開Graphpad Prism 8.0軟件，新建XY散點(diǎn)圖，輸入數(shù)據(jù)：

2.點(diǎn)擊Analyze，Analyze Data下選擇XY Analyses，Linear regression：

得到擬合曲線：

在Graphs下Data1中得到擬合曲線為Y=2.176X+0.0315,R2=0.9986：

4.2 Graphpad Prism 8.0進(jìn)行二項(xiàng)式擬合

Graphpad Prism 8.0對(duì)散點(diǎn)圖的擬合過程無論是簡(jiǎn)單的線性擬合還是復(fù)雜擬合其基本過程相似。其差別在于Analyze，Analyze Data選擇對(duì)應(yīng)的擬合方法，例如二項(xiàng)式擬合：

點(diǎn)擊Analyze，Analyze Data下選擇XY Analyses，選擇Non linear regression （cruve fit）

得到擬合曲線：

擬合公式為Y=6-2.5X+0.5X2：

4.3 Graphpad Prism 8.0進(jìn)行四參數(shù)擬合

Graphpad Prism 8.0對(duì)ELISA結(jié)果進(jìn)行四參數(shù)擬合步驟與線性擬合、二項(xiàng)式擬合相似。

點(diǎn)擊Analyze，Analyze Data下選擇XY Analyses，選擇Non linear regression （cruve fit）選擇：

擬合曲線為：

擬合數(shù)值帶入公式Y(jié)=Bottom + (X^Hillslope)*(Top-Bottom)/(X^HillSlope + EC50^HillSlope)：

R2為0.9964：

得到的擬合公式、R2與ELISACalc軟件計(jì)算結(jié)果相同：

Graphpad Prism 8.0除線性擬合、二項(xiàng)式擬合、四參數(shù)擬合以外還有多種擬合模式可供選擇：

今天給大家分享使用Graphpad Prism 8.0、Excel、ELISACalc、Origin軟件對(duì)散點(diǎn)圖進(jìn)行擬合就告一段落，希望對(duì)大家有所幫助。