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近2.2萬名晚期癌癥患者的血液里都測出來了什么基因突變?

血液做基因檢測到底準(zhǔn)不準(zhǔn)?花錢都幾乎測不出來什么結(jié)果。對于這個問題有兩個答案。

答案1:不同的公司,不同的技術(shù)平臺確實存在靈敏度的差異,也就是血液里有腫瘤的基因變異,但是沒有測出來,換了個靠譜的公司和技術(shù)平臺測出來了結(jié)果。這個就可以判斷為'真不準(zhǔn)'。

答案2:病人血液里腫瘤細(xì)胞釋放的DNA含量真的很少,而且動態(tài)性很大,2-4小時一半的游離DNA就被降解了,即便是數(shù)字PCR的十萬分一的靈敏度也沒有測出來。這個就不能判斷為'不準(zhǔn)'了,因為不能說一定要給出來測序結(jié)果,推薦的藥物使用之后一定見效果,其實誰也做不了絕對的這種保證。

今日,《Clinical cancer research》發(fā)布的一項研究可以給一個更為客觀的結(jié)果,這一研究包含50多種類型的癌癥,對21807名晚期癌癥患者的血液樣本進(jìn)行深度測序,在血液樣本中檢測和分析了70多個癌癥相關(guān)的基因變異。如上圖所示,可以看到多個癌癥腫瘤血液基因檢測出體細(xì)胞的頻率,但不管是小細(xì)胞肺癌,非小細(xì)胞肺癌,還是乳腺癌等,沒有任何一個癌癥類型可以100%都能檢測出基因突變,檢測出基因突變的概率跟患者所患的癌癥類型、病理分期有關(guān),另外還有一些未知的其他原因,比如可能在癌細(xì)胞休眠的時期抽血,這個時候也往往測不到突變。

好,既然我們接受了不是100%地測出來,那么測出的結(jié)果,就一定準(zhǔn)確嗎?答案是基本上是準(zhǔn)確的。

如上圖所示,坐標(biāo)軸的上面部分是組織樣本檢測的結(jié)果,下面是血液樣本檢測的結(jié)果,我們挑選出了TP53基因和EGFR基因,可以看到兩種樣本類型的一致性性還是很好(在同一個位置上面和下面的直線差不多是等長的)。即便是存在部分變化也是個別腫瘤患者經(jīng)過治療所導(dǎo)致的。而且我們需要知道,即便是組織樣本穿刺做基因檢測,也有它的不足之處。

1、不易獲取,跟患者的體制特點有關(guān)。如果穿刺取樣時,患者的體位發(fā)生改變,則往往穿刺不準(zhǔn)確。取到了癌癥病灶旁邊的正常組織。

2、即使是取到了組織,但是由于腫瘤的異質(zhì)性,取樣部位的癌細(xì)胞基因突變,不能代表其他未被穿刺取樣的組織基因突變頻譜。

3、尋找耐藥原因的時候,影像學(xué)CT觀察到的腫瘤病灶變大,但是變大的原因是那一部分腫瘤細(xì)胞的增殖結(jié)果呢,是內(nèi)部的,還是外部的,或者是某個區(qū)域的病灶呢,其實只有穿刺到正在增殖的癌細(xì)胞才能找到耐藥的原因。

上面是組織樣本穿刺活檢做基因檢測的一些不足,從這個方面看,其實難有什么完全絕對的樣本類型。我們再看血液樣本,下面是幾種常見癌癥類型,當(dāng)腫瘤進(jìn)展之后,再次血液樣本做基因檢測找到的耐藥原因。

上面這個圖,灰色的部分是沒有找到耐藥的原因,這個概率還是不小的。左面圖片非小細(xì)胞肺癌,耐藥之后很長的那個黑色柱狀圖部分是T790M。其他的突變也有被檢測到,但是灰色的那部分區(qū)域,是抽血沒有測到基因變異,而且比例還是挺高的。

我們在看上面這個圖片,是對于一個EGFR基因L858R點突變病人的連續(xù)三次血液樣本基因檢測的結(jié)果,其實只在第三次測到了T790M突變開始出現(xiàn),同時還伴隨有低頻度的MET基因擴(kuò)增,這說明我們在選擇抽血做基因檢測的時機(jī)上,也需要格外注意。但是也不是說某一次什么也沒有測到,或者是沒有找到耐藥原因,就完全放棄,這個其實也是不可取的。

總結(jié)一下,基因檢測是我們其中的一項工具,我們認(rèn)識腫瘤的武器還有腫瘤標(biāo)志物,影像學(xué)CT檢查,患者自身的體感,蛋白的免疫組化檢查等等。在所有的檢測技術(shù)之中,沒有任何一種技術(shù)是絕對化的。我們也不建議從事基因檢測領(lǐng)域的工作人員做絕對承諾和保證。我們其實都在圍繞'維護(hù)病人的利益'而努力,但是在這個過程之中,誠實確實無比重要的。

參考文獻(xiàn):

Oliver A. Zill, PhD,et al., The landscape of actionable genomic alterations in cell-free circulating tumor DNA from 21,807 advanced cancer patients, May 18, 2018, clinical cancer research

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