根據(jù)《國務(wù)院機構(gòu)改革方案》新組建的自然資源部，是將原國土資源部的職責(zé)，國家發(fā)改委的組織編制主體功能區(qū)規(guī)劃職責(zé)，住建部的城鄉(xiāng)規(guī)劃管理職責(zé)，水利部的水資源調(diào)查和確權(quán)登記管理職責(zé)，原農(nóng)業(yè)部的草原資源調(diào)查和確權(quán)登記管理職責(zé)，原國家林業(yè)局的森林、濕地等資源調(diào)查和確權(quán)登記管理職責(zé)，原國家海洋局的職責(zé)，原國家測繪局的職責(zé)整合，組建自然資源部，作為國務(wù)院組成部門，自然資源部對外保留國家海洋局牌子。
不再保留國土資源部、海洋局、國家測繪地理信息局。
據(jù)公開信息的統(tǒng)計，由自然資源部（本級）、國家林業(yè)和草原局、中國地質(zhì)調(diào)查局管理的局級單位（含機關(guān)內(nèi)設(shè)司局、派出機構(gòu)、直屬單位）共200家。
機構(gòu)設(shè)置（部本級）
國家林業(yè)和草原局（自然資源部管理的國家局） 中國地質(zhì)調(diào)查局（副部級事業(yè)單位）
內(nèi)設(shè)機構(gòu)（部本級27家）
辦公廳 綜合司 法規(guī)司 自然資源調(diào)查監(jiān)測司 自然資源確權(quán)登記局 自然資源所有者權(quán)益司 自然資源開發(fā)利用司 國土空間規(guī)劃局 國土空間用途管制司 國土空間生態(tài)修復(fù)司 耕地保護監(jiān)督司 地質(zhì)勘查管理司 礦業(yè)權(quán)管理司 礦產(chǎn)資源保護監(jiān)督司 海洋戰(zhàn)略規(guī)劃與經(jīng)濟司 海域海島管理司 海洋預(yù)警監(jiān)測司 國土測繪司 地理信息管理司 國家自然資源總督察辦公室 執(zhí)法局 科技發(fā)展司 國際合作司(海洋權(quán)益司) 財務(wù)與資金運用司 人事司 機關(guān)黨委 離退休干部局
派出機構(gòu)（16家）
國家自然資源督察北京局 國家自然資源督察沈陽局 國家自然資源督察上海局 國家自然資源督察南京局 國家自然資源督察濟南局 國家自然資源督察廣州局 國家自然資源督察武漢局 國家自然資源督察成都局 國家自然資源督察西安局 陜西測繪地理信息局 黑龍江測繪地理信息局 四川測繪地理信息局 海南測繪地理信息局 自然資源部北海局 自然資源部東海局 自然資源部南海局
直屬單位（部本級50家）
機關(guān)服務(wù)局 咨詢研究中心 信息中心 國家海洋信息中心 財務(wù)服務(wù)中心 宣教中心 評審中心 人力中心 寶石中心 整治中心 經(jīng)研院 規(guī)劃院 中國大地出版社（地質(zhì)出版社） 自然資源報社 博物館 油氣中心 不動產(chǎn)登記中心 中央地質(zhì)勘查基金管理中心 地圖技術(shù)審查中心 測繪發(fā)展研究中心 中國測繪科學(xué)研究院 國家基礎(chǔ)地理信息中心 國土衛(wèi)星遙感應(yīng)用中心 職業(yè)技能鑒定指導(dǎo)中心 國家測繪產(chǎn)品質(zhì)量檢驗測試中心 重慶測繪院 三亞測繪技術(shù)開發(fā)服務(wù)培訓(xùn)中心 北戴河休養(yǎng)院 中國地圖出版集團 國家海洋局極地考察辦公室 中國大洋礦產(chǎn)資源研究開發(fā)協(xié)會辦公室 國家海洋技術(shù)中心 國家海洋環(huán)境預(yù)報中心 中國極地研究中心 國家海洋標(biāo)準(zhǔn)計量中心 國家海洋衛(wèi)星應(yīng)用中心 海洋減災(zāi)中心 海洋咨詢中心 國家深?；毓芾碇行?海島研究中心 第一海洋研究所 第二海洋研究所 第三海洋研究所 第四海洋研究所（中國-東盟國家海洋科技聯(lián)合研發(fā)中心） 天津海水淡化與綜合利用研究所 海洋發(fā)展戰(zhàn)略研究所 國家南極考察訓(xùn)練基地 海洋出版社 中國海洋報社 城鄉(xiāng)規(guī)劃管理中心
國家林業(yè)和草原局
內(nèi)設(shè)司局（局本級16家）
辦公室 生態(tài)保護修復(fù)司（全國綠化委員會辦公室） 森林資源管理司 草原管理司 濕地管理司（中華人民共和國國際濕地公約履約辦公室） 荒漠化防治司 野生動植物保護司（中華人民共和國瀕危物種進出口管理辦公室） 自然保護地管理司 林業(yè)和草原改革發(fā)展司 國有林場和種苗管理司 森林公安局 規(guī)劃財務(wù)司 國際合作司（港澳臺辦公室） 人事司 機關(guān)黨委 離退休干部局
直屬單位（局本級 55家）
國家林業(yè)和草原局 西北華北東北防護林建設(shè)局 國家林業(yè)和草原局林業(yè)工作站管理總站 國家林業(yè)和草原局科技發(fā)展中心（國家林業(yè)和草原局植物新品種保護辦公室） 國家林業(yè)和草原局退耕還林（草）工程管理中心 國家林業(yè)和草原局天然林保護工程管理中心 國家林業(yè)和草原局世界銀行貸款項目管理中心 國家林業(yè)和草原局森林和草原病蟲害防治總站 國家林業(yè)和草原局林業(yè)和草原基金管理總站 國家林業(yè)和草原局對外合作項目中心 國家林業(yè)和草原局亞太森林網(wǎng)絡(luò)管理中心 四川臥龍國家級自然保護區(qū)管理局 甘肅白水江國家級自然保護區(qū)管理局 陜西佛坪國家級自然保護區(qū)管理局 國家林業(yè)和草原局宣傳中心 國家林業(yè)和草原局信息中心 國家林業(yè)和草原局經(jīng)濟發(fā)展研究中心 國際竹藤中心 國際竹藤中心安徽太平試驗中心 中國大熊貓保護研究中心 中國林業(yè)科學(xué)研究院院部
中國地質(zhì)調(diào)查局
機關(guān)部門（局本級11家）
辦公室 總工程師室 財務(wù)部 基礎(chǔ)調(diào)查部 資源評價部 水文地質(zhì)環(huán)境地質(zhì)部 科技外事部 裝備部 人事教育部 監(jiān)察審計室 直屬機關(guān)黨委
直屬單位（局本級27家）
地科院發(fā)展研究中心 天津地調(diào)中心 沈陽地調(diào)中心 南京地調(diào)中心 武漢地調(diào)中心 成都地調(diào)中心 西安地調(diào)中心 廣州海洋局 青島海洋所 航空物探遙感中心 物化探所油氣調(diào)查中心 地質(zhì)所 資源所 地質(zhì)力學(xué)所 環(huán)境監(jiān)測院 水環(huán)中心 水環(huán)所 巖溶所 實物資料中心 地學(xué)文獻中心 礦業(yè)報社 實驗測試中心 勘探技術(shù)所 探礦工程所 探礦工藝所 鄭州綜合利用所 成都綜合利用所
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