一是投附內(nèi)陸的準(zhǔn)噶爾人，其中大多數(shù)是原準(zhǔn)噶爾二十一昂吉的達(dá)什達(dá)瓦部屬，1764年春，500名攜眷之厄魯特達(dá)什達(dá)瓦官兵奉命來(lái)到伊犁，被安置于特克斯河、察林河及塔瑪哈一帶（今昭蘇縣境內(nèi)）。1765年達(dá)什達(dá)瓦部眾被編為一昂吉，為厄魯特營(yíng)左翼。
二是 清朝出兵準(zhǔn)噶爾汗國(guó)時(shí)逃入哈薩克、布魯特部游牧地后又陸續(xù)返回的準(zhǔn)噶爾人，及被清廷贖回的曾給維吾爾族當(dāng)奴隸的準(zhǔn)噶爾人。1760年后，少部分劫后余生的逃入哈薩克、布魯特游牧區(qū)等地的準(zhǔn)噶爾人不堪為奴，陸續(xù)投靠清朝，對(duì)此，清廷實(shí)行了招撫和安置政策。1762年有6個(gè)佐領(lǐng)，次年置一昂吉，設(shè)置了總管、副總管、佐領(lǐng)、驍騎校等官，并頒發(fā)了關(guān)防印記。1765年此6個(gè)佐領(lǐng)編入厄魯特營(yíng)右翼。直到1772年投清的準(zhǔn)噶爾人有1408人，其游牧區(qū)為崆吉斯河、哈什河及大小霍諾海等地，現(xiàn)尼勒克縣、特克斯縣及新源縣境內(nèi)。
第三部分為1771年隨土爾扈特部東返的大喇嘛羅卜藏丹增屬下的沙比納爾（門徒們之意—作者）。據(jù)清代滿文檔案載，其沙比納爾有1200余戶，1817年被編為4個(gè)佐領(lǐng)，歸厄魯特營(yíng)右翼碩通管轄，其牧地為特克斯河下游（今特克斯縣境內(nèi)）。
由此可見(jiàn)，準(zhǔn)噶爾汗國(guó)滅亡以后，劫后余生的準(zhǔn)噶爾牧民成了清帝國(guó)轄下的屬民，厄魯特營(yíng)的設(shè)立使準(zhǔn)噶爾一詞作為部落名已不存在了，取而代之的是“厄魯特”一詞。
1767年7月，厄魯特營(yíng)按八旗編制，左翼被編為三旗，即鑲黃、正黃、正藍(lán)，稱“上三旗”，置6個(gè)佐領(lǐng)，右翼置5個(gè)旗，即鑲白、正紅、正藍(lán)、鑲紅、鑲藍(lán)，稱“下五旗”，有佐領(lǐng)8個(gè)，1770年8個(gè)佐領(lǐng)擴(kuò)編為10個(gè)佐領(lǐng)。加上沙比納爾4個(gè)佐領(lǐng)，共有14個(gè)佐領(lǐng)。上三旗在特克斯河流域游牧，下五旗在諾海（即霍諾海）空吉斯（即崆吉斯）一帶地方游牧。
由于準(zhǔn)噶爾部是屬于反抗清朝統(tǒng)治，而被清朝征服的蒙古部，因此，和察哈爾營(yíng)一樣實(shí)行的是總管旗制。左右兩翼各設(shè)總管1員，上三旗設(shè)副總管1員，下五旗因佐領(lǐng)多，設(shè)副總管2員，又設(shè)沙比納爾副總管職銜1員?？偣?、副總管辦理八旗事務(wù)。每佐設(shè)佐領(lǐng)、驍騎校各1員，領(lǐng)催4人，管理佐領(lǐng)軍事、生產(chǎn)、訴訟各事，各翼還置空藍(lán)翎（輪住卡倫）2至3人，額設(shè)挑補(bǔ)卡倫侍衛(wèi)，委筆帖式（書記官）1至2人。厄魯特營(yíng)設(shè)領(lǐng)隊(duì)大臣1員，總攬邊防要?jiǎng)?wù)，大都由滿族人擔(dān)任。另?yè)?jù)《新疆識(shí)略》載，厄魯特營(yíng)還有世襲云騎尉1職，上三旗有2員，下五旗有3員。下五旗還有拜唐阿1員。
駐守卡倫：1763年，伊犁地區(qū)開(kāi)始設(shè)置卡倫，“東北則有察哈爾，西北則有索倫，西南則有錫伯，自西南至東南則有額魯特，四營(yíng)環(huán)處，各有分地”。
開(kāi)始厄魯特營(yíng)駐守著格根、哈爾奇喇、特克斯色沁、根格色沁、都圖嶺等處卡倫，這些卡倫均設(shè)在伊犁通往天山以南的要道及與俄國(guó)接壤的邊界線上。1788年又添設(shè)了察林河渡口等處卡倫。厄魯特營(yíng)所轄卡倫有32處，其中常設(shè)卡倫4處：特克斯色沁、敦達(dá)哈布哈克、伊克哈布哈克、察察；移設(shè)卡倫4處：特穆?tīng)柪锟?、烏弩古特、鄂博圖渡口、昌曼；添撤卡倫24處：特穆?tīng)柪锟硕煽?、雅巴爾布拉克、鄂博圖、額爾格圖、札拉圖、庫(kù)圖勒、格根、鄂爾果珠勒、哈爾干圖、齊齊罕圖、垓爾巴特、拜布拉克、博托木、綽羅圖（一作赤老圖）、那（納）喇特、博爾克阿滿（曼）、巴噶塔木（巴噶喀木哈）、察林河渡口、察林河察罕鄂博、格根西哩克、銅廠外、沙里（喇）雅斯、那林哈勒噶（一作那林哈布哈克）、哈爾奇喇。
厄魯特營(yíng)除了駐守以上卡倫外，還派兵5至17名不等協(xié)助巴彥岱（惠寧）、錫伯、索倫、察哈爾等營(yíng)領(lǐng)隊(duì)大臣駐守24座卡倫。
厄魯特營(yíng)軍民不僅駐守以上卡倫、臺(tái)站，而且又有派駐喀什噶爾、塔爾巴哈臺(tái)換防，巡查哈薩克、布魯特邊界，駐守哨卡、向?yàn)豸斈君R及內(nèi)陸運(yùn)送軍馬等項(xiàng)差事。
巡查哈薩克和布魯特游牧邊界：吹、塔拉斯原為西蒙古牧地，清朝統(tǒng)一新疆初，這一帶暫作為“閑曠之地”，對(duì)此，1763年始每年派出一定數(shù)量的軍隊(duì)到、吹、塔拉斯地區(qū)稽查和巡邏，厄魯特營(yíng)官兵也隨同前往。每年夏天特派領(lǐng)隊(duì)大臣1員，巡查布魯特邊界時(shí)，有兩滿營(yíng)協(xié)領(lǐng)1員，大城（惠員）官2員，其中額魯特營(yíng)有官2員，兵70名；每年秋季特派領(lǐng)隊(duì)大臣1員，巡查哈薩克邊界時(shí)，由兩滿營(yíng)派協(xié)領(lǐng)1員，惠遠(yuǎn)城滿營(yíng)官2員，其中額魯特營(yíng)有官2員、兵70名。屆時(shí)巡查官兵在邊界上會(huì)哨，巡查邊界，驅(qū)逐越界游牧者。
在西北邊疆安內(nèi)攘外的斗爭(zhēng)中；維護(hù)內(nèi)部的安定：19世紀(jì)20年代，大小和卓的后裔張格爾，在浩罕（烏孜別克人建立的封建國(guó)家）統(tǒng)治者的支持下，先后四次返回新疆進(jìn)行作亂。但很快被平息了，這同新疆各族人民的通力協(xié)作是分不開(kāi)的，在鎮(zhèn)壓張格爾的暴亂中，新疆的維吾爾、柯?tīng)柨俗?、蒙古、錫伯等民族都為了維護(hù)祖國(guó)的統(tǒng)一，作出了貢獻(xiàn)。
伊犁地區(qū)有著廣闊的牧區(qū)，土壤肥沃，水源充足，自古以來(lái)就是游牧民族的游牧、狩獵的休養(yǎng)生息之地。清朝統(tǒng)一新疆以后，為恢復(fù)和發(fā)展新疆地區(qū)遭受戰(zhàn)亂破壞的社會(huì)經(jīng)濟(jì)，在新疆進(jìn)行了一系列經(jīng)濟(jì)開(kāi)發(fā)活動(dòng)。其主要的一項(xiàng)是興辦官牧廠。自1760年時(shí)，清政府先后在伊犁、塔爾巴哈臺(tái)、巴里坤、烏魯木齊、設(shè)立官營(yíng)牧廠。伊犁牧廠有孳生馬廠、孳生羊廠、駝廠、孳生牛廠。
伊犁牧廠設(shè)立之初，牲畜除了部分羊和牛有維吾爾族牧放、部分馬、牛有錫伯營(yíng)牧放外，都有察哈爾、額魯特、索倫3營(yíng)放養(yǎng)。駱駝廠全部由額魯特營(yíng)經(jīng)營(yíng)。由于錫伯、索倫營(yíng)兵丁不善畜牧，因此1773年后停止了索倫營(yíng)經(jīng)營(yíng)馬廠、牛廠以及錫伯營(yíng)經(jīng)營(yíng)牛廠，而到嘉慶初年，先后停止錫伯、索倫兵丁牧放伊犁牧廠牲畜，將其牧放牲畜，全部交給察哈爾、額魯特兩營(yíng)。
以孳生廠為例，據(jù)1793年伊犁將軍保寧奏，馬廠共計(jì)有孳生本馬28569匹，其中厄魯特營(yíng)上三旗牧馬7210匹，下五旗牧放9857匹；牛廠有孳生本牛11845頭，其中厄魯特上三旗牧牛2483頭，下五旗及沙畢納爾4佐領(lǐng)牧牛4065頭；羊廠，1772年至共有孳生本牛140695只，厄魯特營(yíng)上三旗牧放羊29742只，下五旗及沙比納爾4佐領(lǐng)牧羊56666只；1802年共收獲滋生駝2665峰，上三旗牧駝1833峰，下五旗牧駝2343峰。
備差廠即儲(chǔ)備牲畜以供差用，孽生廠取孽牲畜均入備差廠。據(jù)1816年統(tǒng)計(jì)，伊犁備差廠有馬17738匹，內(nèi)厄魯特營(yíng)上三旗牧馬2636匹，下五旗牧馬5242匹，牛廠有牛11573頭，內(nèi)上三旗牧牛2463頭，下五旗牧牛4627頭，羊廠存羊32187只，上三旗牧羊9500只，下五旗牧羊12112只。厄魯特營(yíng)僅牧放伊犁牧廠的牲畜就有十幾萬(wàn)頭。
由于額魯特營(yíng)的“所有口糧，俱系自耕自食”。因此，其兵丁除放牧外，還種植農(nóng)作物。厄魯特營(yíng)上三旗6個(gè)佐領(lǐng)屯田4處：敦達(dá)察罕烏蘇、霍依圖察罕烏蘇、特爾莫土、哈牧哈；下五旗14個(gè)佐領(lǐng)屯田16處：昌滿、哈什春稽布拉克、蘇布臺(tái)、渾多賴、袞佐特哈、庫(kù)爾庫(kù)類、呢勒哈、大濟(jì)爾噶朗、算珠圖、特勤克、特克斯塔柳、沙喇博果沁、巴哈拉克、弩楚袞。以上田地都位于河流域，因此都用河水灌溉。
厄魯特營(yíng)的旗屯是清朝新疆屯墾事業(yè)的一部分，在當(dāng)時(shí)歷史條件下起了積極作用。他們屯田所獲糧食，不僅自己食用，有時(shí)多獲糧食還上繳官府，為當(dāng)?shù)伛v防軍提供軍糧。為開(kāi)發(fā)伊犁農(nóng)業(yè)生產(chǎn)做出了貢獻(xiàn)。
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