我國各地氣候差異甚大，栽培方式也略有不同，在選用菌種之前，必須首先了解該菌種的栽培性狀，包括菌絲生長類型，對營養(yǎng)、溫度、濕度等條件的要求，出菇早晚，轉潮快慢，產量高低．質量好壞，菇體大小，抗病性強弱等。

    目前，國內的蘑菇菌株有氣生型和貼生型兩類。氣生型菌株：出菇較慢，產量主要分布在第一、二、三潮，潮次明顯，菇體質量較高，適合于制罐出口。該類型菌株比較容易形成菌被，產量較低。貼生型菌株：出菇較快，產量主要集中在前幾潮，潮次不明顯，每潮出菇量大，菇體較小，畸形菇也較多，易開傘，菇體質量較差，不適合于制罐，適于鮮銷或制鹽水菇。

    近年來，我國蘑菇主產區(qū)絕大多數(shù)提倡栽培氣生型菌種。

    從蘑菇菌種的培養(yǎng)基來分，有四種：糞草種、麥粒種（谷粒種）、羊糞種、復合顆粒種。糞草種：適于穴播，萌發(fā)力較弱，播種量較大（2瓶／米²），易發(fā)生球菇，產量略低，但不怕鼠害。糞草種目前已基本淘汰。麥粒種（谷粒種）：適于混播或撒播等播種方式，菌種在料中可分布均勻，萌發(fā)力強，發(fā)菌快，用種量?。?/span>0．5～1瓶／米²），產量高，但易遭鼠害。麥粒種是目前最為廣泛使用的菌種。羊糞種：基本與麥粒種相同，萌發(fā)力比麥粒種略低，用種量為1瓶/米²，不怕鼠害。復合顆粒種：菌種特性基本與麥粒種相同，但不怕遭鼠害。這類菌種生產成本較高，目前僅在部分地區(qū)推廣應用。

此外，優(yōu)質菌種還應具備無病蟲雜菌，瓶內上下菌絲均勻一致，不萎縮，不退化，無黃水，少或無菌被，萌發(fā)力強，菌絲粗壯、生活力旺盛等。在具體挑選菌種時要仔細檢查瓶壁四周、料面、瓶塞等處，不得有綠斑、黃斑、黑斑、銹斑等不正常斑塊，沒有黃水珠，沒有螨食斑（褪菌斑），菌瓶上部菌絲應潔白而不灰化稀弱。詳細詢問接種時間，推算菌齡。再取一兩瓶菌種于無菌操作下，耙掉0．5～1厘米上層老菌絲，再蓋上棉塞，于室溫下（25℃左右）培養(yǎng) 3～4天，觀察是否吐絲發(fā)白。培養(yǎng) 3～4天，順利吐絲發(fā)白（再生氣生菌絲）的菌種有活力，可以使用，否則，菌種已老化，萌發(fā)力弱，最好不使用。菌種選購好后，若暫不使用，應置于陰涼、通風、干燥、干凈的地方，不可放在陽光直射、悶熱，潮濕、不通風的地方。