費(fèi)縣歷史悠久。上冶鎮(zhèn)翟家村、朱田鎮(zhèn)興富莊等大汶口文化遺址和新橋鎮(zhèn)西西蔣村、方城鎮(zhèn)古城里村等龍山文化遺址的發(fā)現(xiàn)和發(fā)掘，證明至遲在公元前4000年前，即原始父系氏族公社時(shí)期，即有先民在此活動(dòng)。
上古時(shí)期，費(fèi)縣為東夷部落首領(lǐng)少皞近畿之地。
魯僖公元年（公元前659年），鄪邑成為魯國(guó)上卿季友的私邑（又叫采邑）。魯元公二年（公元前427年）以后，季友后裔季孫氏據(jù)鄪邑自立為費(fèi)國(guó)。
秦昭王五十二年（公元前255年）前后，費(fèi)國(guó)又被楚國(guó)吞并。
秦始皇二十四年（公元前223年），楚國(guó)為秦國(guó)所滅。兩年后，秦始皇統(tǒng)一天下，建立秦朝，分天下為三十六郡，費(fèi)地屬薛郡。
西漢高帝六年（公元前201年）正月，韓信被封為楚王，費(fèi)地屬楚國(guó)。劉邦統(tǒng)一天下，分封諸侯，設(shè)立郡縣，費(fèi)地始為費(fèi)縣。
王莽新朝始建國(guó)元年（公元9年），全國(guó)郡縣更名，費(fèi)縣改為順從縣。
東漢光武帝建武六年（公元30年），費(fèi)城改隸兗州刺史部泰山郡，為侯國(guó)，屬泰山郡十二城之一。
獻(xiàn)帝建安三年（公元198年），費(fèi)城又改隸徐州瑯琊國(guó)。
永嘉之亂（時(shí)在公元311年）以后不久，西晉滅亡，淮水以北地區(qū)先后被前趙、后趙、前燕、前秦、后燕、南燕等北方少數(shù)民族政權(quán)占據(jù)，歷時(shí)約120年。費(fèi)縣隸瑯琊郡。
東晉政權(quán)建立后，晉元帝司馬睿為了安置隨其南遷的原瑯琊國(guó)士族和流民，于大興三年（公元320年）在江乘縣（今屬南京市）境內(nèi)僑置懷德縣，屬丹陽(yáng)郡。
咸和“土斷”（時(shí)在公元326—334年）后，懷德縣更名為費(fèi)縣，有實(shí)土，屬南徐州瑯琊郡。至南朝宋文帝元嘉十五年（公元438年）廢置。
唐平隋亂，于武德四年（公元621年）重建費(fèi)縣，屬河南道沂州（瑯琊郡）。
元朝在地方設(shè)行中書(shū)省，今山東地區(qū)直屬中書(shū)省，稱(chēng)腹里。費(fèi)縣屬腹里山東益都路沂州。
明代，改行中書(shū)省為承宣布政使司。洪武元年（公元1368年），沂州屬山東承宣布政使司濟(jì)寧府。五年，改隸濟(jì)南府。七年，屬青州府。十八年，屬兗州府。費(fèi)縣均屬沂州。
清朝初年，費(fèi)縣仍屬兗州府沂州。雍正二年（公元1724年），沂州由散州改為直隸州。十二年，沂州升府，費(fèi)縣屬沂州府。
民國(guó)二年（1913年）廢州府，設(shè)道。費(fèi)縣屬山東省岱南道，次年改屬濟(jì)寧道。十四年（1925年）改屬山東省瑯琊道。十七年（1928年）廢道，費(fèi)縣直屬山東省政府。二十五年（1936年）設(shè)督察專(zhuān)員公署，費(fèi)縣屬山東省第三區(qū)行政督察專(zhuān)員公署。
1937年11月，在尚巖鄉(xiāng)溝西村（今屬蘭陵縣）成立臨郯費(fèi)嶧四縣邊區(qū)聯(lián)莊會(huì)辦事處。1939年2月改稱(chēng)臨郯費(fèi)嶧四縣邊聯(lián)辦事處。
1939年7月，在康埠莊（今屬平邑縣）成立費(fèi)縣辦事處，又稱(chēng)四區(qū)（指一、四、五、六四個(gè)區(qū)）聯(lián)合辦事處。
1940年2月，在大夫?qū)幋澹ń駥倨揭乜h）成立費(fèi)縣抗日民主政府。6月，劃滋（陽(yáng)）臨（沂）公路以北、汶河以西為費(fèi)北行署，屬魯中行政區(qū)；滋臨公路以南的西半路為費(fèi)南縣，屬魯南行政區(qū)。8月，在大馮家樓子（今屬沂南縣）成立臨費(fèi)沂邊聯(lián)縣，屬魯中行政區(qū)。
1941年1月，在薛莊成立費(fèi)東行署。3月，臨郯費(fèi)嶧四縣邊聯(lián)辦事處改稱(chēng)臨郯費(fèi)嶧四縣邊區(qū)抗日民主政府（以下簡(jiǎn)稱(chēng)四縣邊聯(lián)縣）。
1942年5月，費(fèi)北行署改稱(chēng)費(fèi)北縣，屬魯中行署。6月，析費(fèi)南縣南部和滕縣東部成立費(fèi)滕邊辦事處，又稱(chēng)魯南實(shí)驗(yàn)縣。8月，成立臨費(fèi)辦事處。11月，成立費(fèi)西辦事處。
1943年1月，成立臨西辦事處。秋，改費(fèi)東行署為費(fèi)東縣。10月，撤銷(xiāo)費(fèi)滕邊辦事處。成立費(fèi)滕嶧辦事處，又稱(chēng)費(fèi)滕嶧縣。11月，撤銷(xiāo)費(fèi)西辦事處。
1944年1月，撤銷(xiāo)臨費(fèi)辦事處。成立溫河縣。費(fèi)南縣改稱(chēng)費(fèi)縣。2月，四縣邊聯(lián)縣改稱(chēng)趙鎛縣。臨費(fèi)沂邊聯(lián)縣改稱(chēng)沂臨邊聯(lián)縣。6月，沂臨邊聯(lián)縣改稱(chēng)沂臨縣。8月，臨西辦事處撤銷(xiāo)。費(fèi)滕嶧縣改為雙山縣。
1945年10月，撤銷(xiāo)沂臨縣，大部并入沂南縣。
1946年1月，費(fèi)東縣、費(fèi)北縣合并為蒙山縣。4月，費(fèi)縣改稱(chēng)平邑縣。溫河縣改稱(chēng)費(fèi)縣，隸屬魯南行政區(qū)第一專(zhuān)區(qū)。雙山縣改稱(chēng)麓水縣。
1947年3月，趙鎛縣分為趙鎛、蒼山二縣。10月，成立白彥縣和臨西縣。
1948年1月，費(fèi)縣改隸魯南行政區(qū)第三專(zhuān)區(qū)。7月，費(fèi)縣又改隸魯中南行政區(qū)第五專(zhuān)區(qū)。10月，臨西縣并入臨沂縣。
1949年7月，費(fèi)縣隸魯中南行政區(qū)臺(tái)棗專(zhuān)區(qū)。
1950年5月，麓水縣、趙鎛縣撤銷(xiāo)，費(fèi)縣改隸臨沂專(zhuān)區(qū)。
1953年8月，白彥縣撤銷(xiāo)。
1953年11月，費(fèi)縣人民政府改稱(chēng)費(fèi)縣人民委員會(huì)。
1967年3月，費(fèi)縣革命委員會(huì)取代了費(fèi)縣人民委員會(huì)，隸屬臨沂地區(qū)革命委員會(huì)。
1978年7月，費(fèi)縣革命委員會(huì)屬臨沂行署。
1981年5月，費(fèi)縣革命委員會(huì)改稱(chēng)費(fèi)縣人民政府。
1994年12月，臨沂行署改設(shè)臨沂市，費(fèi)縣仍隸屬之。
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