microRNAs (miRNAs)是基因表達(dá)的主要調(diào)控因子，有多項(xiàng)研究表明其通過(guò)與靶基因的相互作用參與疾病的生理和病理過(guò)程。在癌癥中，miRNAs的一個(gè)重要作用是：它們可以作為“癌基因”或“抑癌基因”發(fā)揮作用，而這種相悖的作用取決于它們結(jié)合的靶點(diǎn)基因和細(xì)胞環(huán)境。此外，在乳腺癌中，miRNAs被認(rèn)為是有前途的分子“生物標(biāo)志物”，因?yàn)樗鼈兊膱D譜與不同的乳腺癌亞型相關(guān)聯(lián)。
所以，今天小編打算給小伙伴們分享一個(gè)miRNAs相關(guān)的網(wǎng)站——miRTissue，這個(gè)網(wǎng)站主要分析miRNA-target-protein的相互關(guān)系，它的數(shù)據(jù)來(lái)源于TCGA。好了，不多說(shuō)了，直奔主頁(yè)吧~
下拉頁(yè)面，點(diǎn)擊下圖紅色圈中的“here”。
跳轉(zhuǎn)頁(yè)面后，進(jìn)入分析界面~ 左側(cè)的是條件輸入框。橫向的是2種分析方式，包括：
＞Normal/Tumor miRNA-target analysis正常組織/腫瘤組織的miRNA靶點(diǎn)分析
＞miRNA-target-protein analysis for a specific tumor type具體腫瘤的miRNA-靶點(diǎn)基因-蛋白分析
接著，我們看下頁(yè)面中表格的內(nèi)容，也就是相互作用的類型，網(wǎng)站提供的所有miRNA-靶點(diǎn)相互作用有4類：降解，抑制，無(wú)相互作用和無(wú)相互作用*（不太確定）。每一種作用基因分別對(duì)應(yīng)相應(yīng)的顏色。
獨(dú)立情景1
具體腫瘤miRNA-基因-蛋白質(zhì)相互作用分析
點(diǎn)擊“miRNA-target-protein analysis for a specific tumor type”，比如我們分析miRNA hsa-miR-4668在乳腺癌中的miRNA-基因-蛋白質(zhì)相互作用，分別在收索框1、3中選擇“miRNA hsa-miR-4668”“BRCA”，2中也可以選擇相關(guān)基因，如果不選則默認(rèn)為網(wǎng)站能分析的所有基因，然后點(diǎn)擊下方的提交。
在分析界面，則可以看到miRNA hsa-miR-4668在乳腺癌中與不同靶基因的作用的P-value和相互作用的機(jī)制。
獨(dú)立情景2
兩種不同腫瘤類型的miRNA-靶基因比較分析
點(diǎn)擊“Normal/Tumor miRNA-target analysis”，比如輸入我們分析miRNA hsa-let-7b在乳腺癌和腎透明細(xì)胞癌中相互作用機(jī)制的比較，組織類型選擇Tumor。我們可以看到，同一miRNA-靶基因在不同癌癥的作用類型之間的差異。
獨(dú)立情景3
正常組織和癌組織之間的
miRNA-靶基因比較分析
點(diǎn)擊“Normal/Tumor miRNA-target analysis”，比如輸入我們分析miRNA hsa-let-7b在乳腺癌和正常組織中相互作用機(jī)制的比較，組織類型選擇Normal&Tumor。我們可以看到，同一miRNA-靶基因在正常組織和癌組織中的作用類型之間的差異。
NOTE：關(guān)于收索框提示一點(diǎn)，可以單個(gè)輸入，多個(gè)輸入，而不輸入則是代表網(wǎng)站中默認(rèn)的所有內(nèi)容的輸入。
1
miRNA在腫瘤治療學(xué)上的展望
miRNA作為致癌基因或腫瘤抑制因子的雙重作用，分別稱為miRNA-mimics或AntimiRs，這取決于它們與之相互作用的靶基因（分別是抑癌基因和癌基因）的功能，前者模仿相應(yīng)miRNA的功能，后者充當(dāng)miRNA拮抗劑。此外，若使這些合成miRNA作為治療劑的的一個(gè)特征是單個(gè)miRNA基因可以靶向多個(gè)mRNA的能力。這意味著單個(gè)miRNA治療劑可以同時(shí)作用于不同的靶點(diǎn)基因。因此可以發(fā)現(xiàn)用作潛在治療劑的miRNA分子，來(lái)多靶點(diǎn)治療腫瘤。
2
癌癥中的生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)
miRNA是小RNA分子，它們?cè)谏砗桶┌Y病理?xiàng)l件下存在差異，因此在臨床應(yīng)用中具有很大潛力。不同的研究表明它們?cè)谠\斷（癌癥類型分類和惡性結(jié)節(jié)與良性結(jié)節(jié)的診斷）、治療（根據(jù)靶向治療的分子特征選擇患者;放射抗性評(píng)估和監(jiān)測(cè)治療反應(yīng)）和治療后復(fù)發(fā)的早期檢測(cè)可以作為marker。
3
癌癥中的miRNA-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析
相互作用分析已成為當(dāng)前生物學(xué)研究的重點(diǎn)之一。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)可以提供關(guān)于生物體中生物過(guò)程理解的大量信息，但是蛋白表達(dá)常常與基因表達(dá)有關(guān)，而miRNA在這其中也常常發(fā)揮著重要作用。由于這些原因，如果擴(kuò)大這種網(wǎng)絡(luò)分析，分析更多的蛋白表達(dá)調(diào)節(jié)因素，就能更好地了解這些分子之間更多的潛在聯(lián)系，最終更好地確定疾病的分子病因及作用機(jī)制。
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