記憶|地處西藏，5年發(fā)MP/NC/PNAS等14篇通訊文章。西藏農(nóng)牧科學(xué)院尼瑪扎西組在青稞基因組及分...
通過我們公眾號(hào)iPlants統(tǒng)計(jì)，該課題組在2015-2019年中已經(jīng)發(fā)表了14篇通訊論文，其中包括1篇Molecalar Plant、1篇PNAS和1篇Nature Communications等多篇高水平等通訊文章。值得我們注意是，該課題組地處我國西藏自治區(qū)，環(huán)境惡劣，條件艱苦，能夠克服困難，作出一系列高水平的成果，實(shí)屬值得點(diǎn)贊！另外，西藏也擁有我國一些特有的植物物種，為他們研究提供了天然的研究材料。具體如下（由于MP文章剛在線online,還不能在Pubmed中查到）：
西藏是世界大麥馴化和青稞多樣化品種栽培中心之一。青稞，在植物分類學(xué)上是大麥的一個(gè)變種---裸大麥，和其他大麥不同，青稞經(jīng)過藏族人民長達(dá)3500~4000年的馴化栽培，已經(jīng)完全適應(yīng)了極端高原氣候、富含了濃郁民族文化、具有了特殊農(nóng)藝和品質(zhì)性狀的糧食作物。為培育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)青稞品種，揭示青稞的高原適應(yīng)性機(jī)制，解讀其起源、馴化及栽培選育過程，西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院聯(lián)合眾多研究單位，在2012年正式啟動(dòng)了青稞基因組研究合作項(xiàng)目。
1. 2015年1月12日，PANS雜志在線發(fā)表來自西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院尼瑪扎西課題組合作題為“The draft genome of Tibetan hulless barley reveals adaptive patterns to the high stressful Tibetan Plateau”的研究論文。該研究公布了全球首個(gè)青稞基因組圖譜，這是繼小麥、大麥基因組物理圖，國際小麥家族基因組研究工作的又一個(gè)里程碑式的進(jìn)步，給未來麥類作物的改良以及其他高原作物的研究工作提供了寶貴的參考資料。
該研究采用全基因組鳥槍法測序，對(duì)西藏的地方品種古老的青稞“拉薩鉤芒”（Lasa Garma-guri ）進(jìn)行了全基因組測序。研究表明，所獲青稞基因組圖譜大小為3.89Gb，共占青稞基因組的87%，包含了39,197個(gè)蛋白編碼基因。隨后，研究人員將青稞基因組和其他的禾本科作物基因組進(jìn)行了比對(duì)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)青稞約于1700萬年前從粗山羊草（小麥D），烏拉爾圖小麥（小麥A）以及冬小麥中分離出來。通過對(duì)10株野生和栽培青稞品種重測序，研究人員發(fā)現(xiàn)，野生青稞品種的SNP數(shù)目是栽培青稞的2倍，這說明人工選育過程給青稞品種帶來了基因瓶頸。而對(duì)于人們最感興趣的，青稞的高原適應(yīng)性機(jī)制問題，研究人員也做了專門的研究，并發(fā)現(xiàn)了一系列在青稞品種中發(fā)生了正向選擇的基因家族。這些基因改變使得青稞具有更好的高原適應(yīng)性和壓力調(diào)節(jié)機(jī)制。論文鏈接：http://www.pnas.org/content/early/2015/01/09/14236281122. 2018年12月，Nature Communications在線發(fā)表了由西藏農(nóng)牧科學(xué)院Nils Stein和Nyima Tashi課題組和華大基因合作題為“Origin and evolution of qingke barley in Tibet”的研究論文。本研究通過遺傳學(xué)分析來確定青稞的起源與進(jìn)化問題，明確了青稞進(jìn)入西藏的路線。研究人員從西藏和鄰近區(qū)域如青海、云南選擇了能代表現(xiàn)在西藏大麥遺傳多樣性的69個(gè)青稞地方品種、35個(gè)青稞育成品種以及10個(gè)西藏半野生大麥進(jìn)行全基因組重測序（平臺(tái)測序深度~9.6×），結(jié)合已經(jīng)發(fā)表的260份全球野生和地方品種的外顯子測序數(shù)據(jù)，共437個(gè)大麥材料一起分析。研究發(fā)現(xiàn)青稞起源于東方栽培大麥，在距今4,500年前到3,500年前通過巴基斯坦北部、印度和尼泊爾進(jìn)入西藏南部（見下圖III路線）。同時(shí)青稞很低的遺傳多樣性說明，西藏并不是大麥的起源和馴化中心。大麥5個(gè)主要馴化基因的單倍型，支持六棱野生大麥和西藏半野生大麥起源于栽培大麥的野化或與野生大麥的雜交，而不支持六棱野生大麥?zhǔn)钦嬲囊吧篼湣?/span>https://www.nature.com/articles/s41467-018-07920-5#Sec183. 2019年10月27日，Molecular Plant雜志在線發(fā)表了來自西藏農(nóng)牧科學(xué)院Nyima Tashi課題組和海南大學(xué)羅杰課題組合作題為“Genome-wide dissection of co-selected UV-B responsive pathways in the UV-Badaptation of qingke”的研究論文。該研究揭示了青稞適應(yīng)高原中高水平的UV-B的代謝及基因基礎(chǔ)。
該研究在196種不同的青稞和大麥的谷粒和葉片中進(jìn)行了全面的代謝譜分析和隨后基于代謝物的全基因組關(guān)聯(lián)研究（mGWAS）。研究表明90個(gè)重要的mGWAS基因座位于大麥-青科的分化區(qū)域，并且發(fā)現(xiàn)大量高水平的代謝產(chǎn)物性狀等位基因在青稞中顯著富集，表明多種苯丙烷類化合物地選擇與青稞共進(jìn)化（見下圖）。并且該研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)黃酮C-戊糖基轉(zhuǎn)移酶，酪胺羥基肉桂?；；D(zhuǎn)移酶和MYB轉(zhuǎn)錄因子等三個(gè)新蛋白是在自然變化下苯丙酸含量等決定因素。 論文鏈接：
https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(19)30335-1
尼瑪扎西 研究員 西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院院長院長
主要經(jīng)歷：1985年7月畢業(yè)地西北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)系，同年8月被分配到西藏自治區(qū)農(nóng)業(yè)研究所參加工作，并直接到北京中國農(nóng)科院研究生院進(jìn)修一年英語。1992年9月在加拿大沙省大學(xué)深造一年，1995年7月考入中國科學(xué)院研究生院攻讀碩士、博士研究生，1999年獲得中國科學(xué)院理學(xué)博士學(xué)位。
主要成就：先后主持和組織實(shí)施了40多項(xiàng)科研項(xiàng)目，在國內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊和學(xué)術(shù)研討會(huì)上發(fā)表中英文科技論文57篇，專著5部（其中英文2部），編輯論文集5部（英文1部，中文4部），組織編譯了多套（部）藏文農(nóng)業(yè)科普?qǐng)D書，主持翻譯1部英文譯文集。先后參與主持選育出了20多個(gè)春青稞優(yōu)異新品種（系），其中鑒定篩選出的藏青148、藏青311、藏青3179，在生產(chǎn)上大面積推廣應(yīng)用，經(jīng)濟(jì)效益顯著。主持選育的藏青690和藏青2000目前在生產(chǎn)示范推廣應(yīng)用。主持承擔(dān)國家973計(jì)劃前期研究項(xiàng)目課題2項(xiàng)、國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目1項(xiàng)，同時(shí)承擔(dān)自治區(qū)農(nóng)作物育種重點(diǎn)項(xiàng)目和青稞產(chǎn)業(yè)科技重大專項(xiàng)的首席專家。先后實(shí)施了7項(xiàng)國際科技合作項(xiàng)目，引進(jìn)了多項(xiàng)新技術(shù)、培養(yǎng)了一批人才、取得了良好的經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益。先后組織科技人員主持實(shí)施了農(nóng)作物新品種選育、種植業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化、農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)示范、新品種示范推廣等科技成果轉(zhuǎn)化與示范項(xiàng)目，為我區(qū)主要農(nóng)區(qū)篩選出了一批新品種、引進(jìn)了一批新技術(shù)、集成了多個(gè)適用技術(shù)、促進(jìn)了農(nóng)民增收和農(nóng)業(yè)增效。以上個(gè)人介紹來源西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院官網(wǎng)小麥族多組學(xué)網(wǎng)站：http://202.194.139.32
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