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如何評價“泛癌癥圖譜”(Pan-Cancer Atlas)這一研究成果?

“泛癌癥圖譜”(Pan-Cancer Atlas)大型研究項目,源于2012年在加利福尼亞州的圣克魯茲召開的一次國際癌癥醫(yī)學會議,此次會議發(fā)起了一項被稱為泛癌癥圖譜研究計劃的大型合作,研究者們希望從一個新的角度來研究癌癥。

提出革命性問題,并進行相關的研究,并取得了重大突破。

“泛癌癥圖譜”(Pan-Cancer Atlas)的研究分了三個主題(癌細胞起源、致癌過程和信號通路),涉及33種腫瘤,11,000多個腫瘤樣本。是一次大型的科學研究項目。該項目提出了許多具有重要價值的問題,并通過研究得到了相應的結論,對未來的癌癥理解和治療將產(chǎn)生革命性的影響。

  • 癌細胞起源

比如在癌細胞起源這個主題的述評論文中Hoadley提出了這樣一個問題:“癌癥可以根據(jù)分子標記而不是細胞/組織來源進行分類和治療嗎?”,這是一個能夠顛覆當今癌癥治療的革命性問題。


這個問題是什么意思?意思是以后,醫(yī)學界制定癌癥治療策略時不會再依據(jù)肺癌、肝癌、胃癌等制定治療指南,而將代之以癌癥特定的分子特征來制定治療策略,即呆在不同部位的腫瘤可以使用同樣的療法,而呆在同一部位的腫瘤則可能使用不同的治療方法。比如都是乳腺癌患者,但三陰乳腺癌就需要不同的治療方式。(三陰乳腺癌特指雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)及人表皮生長因子受體2(HER-2)均陰性的乳腺癌患者。

圖示:人體有29個部位是癌癥的高發(fā)部位。但以后醫(yī)學指南不會再簡單的根據(jù)部位來給出不同的治療指南和建議了。

容易患癌的解剖學部位分組

大腦; 眼睛; 頭部和頸部; 食道;

甲狀腺; 乳腺;胸腺;胰腺;腎上腺 ; 前列腺

肺; 胃; 肝 ;膽管; 腎;膀胱; 結直腸;睪丸

皮膚;血液; 骨骼; 骨髓; 淋巴結;神經(jīng)系統(tǒng) ;胸膜;

子宮頸; 子宮;卵巢


他們的研究小組,在這33種腫瘤中找到了28種不同的分子亞型,他們研究了非整倍體,DNA甲基化,mRNA和miRNA,并研究了細胞或組織來源與腫瘤的分子特征之間的關系。而最重要的發(fā)現(xiàn)是,癌癥起源的細胞能影響但并不能完全決定腫瘤的分類,并且癌癥亞型的完整分子特征,可能導致在治療時,將患者分到不同的組中去的巨大變化,這個發(fā)現(xiàn)必將顛覆現(xiàn)在的癌癥的治療。

Hoadley明確提出:盡管從同一解剖部位產(chǎn)生的惡性腫瘤傳統(tǒng)上一直作為單一實體在臨床上進行治療,但組織學和分子分類現(xiàn)在經(jīng)常用于確定對肺,乳房,胃腸,皮膚和骨髓衍生的惡性腫瘤的亞型的治療。隨著臨床上越來越多的藥物可用于靶向ALK,EGFR,ERBB2,ERα,KIT,BRAF和ABL1等癌癥驅動途徑靶點,傳統(tǒng)的解剖癌癥分類系統(tǒng)應該由基于分子改變的分類系統(tǒng)進行補充跨越不同組織類型的腫瘤。

  • 信號途徑

Sanchez-Vega 等對信號途徑研究的最關鍵發(fā)現(xiàn)是,超過一半的腫瘤樣本在細胞信號通路中至少有一個突變,并且許多腫瘤在多個信號通路中都有突變,這表明腫瘤的分子特征可能導致,可用的組合式療法。

  • 致癌過程

按照,致癌過程的述評文章作者的說法,這既是“癌癥基因組學研究的結束”也是一次新的開始。對于大多數(shù)癌癥,帶來了在分子水平上分析單個腫瘤細胞的更簡單實用的方法。


這一成果將是癌癥生物學研究中的豐碑,具有不亞于人類基因組測序的意義。

從2012年到2018年,歷時六年,史上最大規(guī)模癌癥基因組研究告一段落,Cell Press雜志上特別發(fā)表了一系列共計27篇論文,這些論文是迄今為止最全面的人類癌癥基因組分析論文。這個大型研究項目是由美國國家癌癥研究所(NCI)和美國國家人類基因組研究所(NHGRI)之間的一次合作,共分析了33種不同的癌癥共計11,000多個腫瘤樣本。

所有研究資源都是開放獲取的,全球有志于研究癌癥的個人、組織、公司和藥廠都可以使用這些數(shù)據(jù),除已經(jīng)取得的成果之外,人們還可以在源數(shù)據(jù)的基礎上做自己的特別的個性化研究,而這些開放的資源,必將能促進治療癌癥的新方法誕生。

“泛癌癥圖譜”(Pan-Cancer Atlas)的所有研究結果都在cell.com網(wǎng)站上,網(wǎng)站為此做了特別的專題,將它分為三個主題:(癌)細胞起源,致癌過程和信號通路。每個大類都有一篇述評文章,介紹這個主題并總結該主題下所取得的研究成果。對于任何癌癥研究者,至少這些文章是必須精讀細讀的。

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