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GSK最新案例:如何在M7規(guī)則下開發(fā)工藝和控制基因雜質(zhì)
GW641597X是GSK正在開發(fā)中的PPAR-alpha受體拮抗劑,主要用于心血管疾病的治療。
一、工藝優(yōu)化歷程
初始工藝及第一代優(yōu)化
開發(fā)了初始工藝,成功完成前期的小批量合成任務(wù),但是仍舊存在一些問題制約著以后的工藝放大。
對初始工藝的問題以及優(yōu)化策略總結(jié)如下:

步驟
主要問題
優(yōu)化方法
2~3
20V的溶劑丙酮
反應(yīng)三天時間
4.5eq溴異丁酸乙酯
2會形成苯酚鉀鹽沉淀
溴異丁酸乙酯是基因毒性雜質(zhì)
丙酮換成乙醇10V
滴加溴異丁酸乙酯,減少反應(yīng)時間和用量
 
3~4
m-CPBA不經(jīng)濟(jì)
/
6~7
回流32h

羥胺蒸餾有風(fēng)險
三乙胺替換碳酸鉀,反應(yīng)時間從32h減到1.5h
中間體7直接結(jié)晶,避免蒸餾。
收率從76%提高到93%
5+8~9
需要反應(yīng)時間較長
中間體4反應(yīng)到5不分離直接和8偶聯(lián)
9~1
THF混溶性較差,脫乙酯效率低
變性乙醇替代THF
API重結(jié)晶
使用2V甲苯,導(dǎo)致體系濃稠
8V變性乙醇重結(jié)晶
使用優(yōu)化后的工藝生產(chǎn)了1kg,不過優(yōu)化后的路線依舊存在問題:

第二代優(yōu)化


步驟
主要問題
優(yōu)化方法
2~3
溴異丁酸乙酯需要補(bǔ)加
后處理比較復(fù)雜,不適合放大
滴加時間延長到7h
正己烷萃取液直接用于反應(yīng)
3~4
m-CPBA不經(jīng)濟(jì),具有安全隱患
使用NaBO3和乙酸氧化
4+8~9
產(chǎn)生較大雜質(zhì)10和11
4脫乙?;鶕Q用叔丁醇鉀,雜質(zhì)10和11較小
反應(yīng)完稀釋后直接下步反應(yīng)
API重結(jié)晶
雜質(zhì)10乙醇結(jié)晶無法去除
控制生成量
  • 雜質(zhì)10和雜質(zhì)11是由體系中的乙醇鈉強(qiáng)堿條件和中間體8作用產(chǎn)生:
  • 叔丁醇鉀替換乙醇鈉會引入額外的麻煩,會產(chǎn)生叔丁酯雜質(zhì)12,該雜質(zhì)通過在粗品中使用正庚烷打漿去除。
  • 其中一個生產(chǎn)批次中還發(fā)現(xiàn)一個新產(chǎn)生的雜質(zhì)14,大約1%,產(chǎn)生原因是強(qiáng)堿條件下中間體8自身縮合。
使用該優(yōu)化后工藝在實驗室完成了放大,生產(chǎn)了1.2kg。
第三代優(yōu)化
不過為了適應(yīng)二期臨床的更大需求,需要包括安全性等更全面的評估優(yōu)化。
步驟
主要問題
優(yōu)化方法
3~4
過硼酸鈉的大量使用風(fēng)險

正己烷易燃性
中間體4高溫易分解
分批加入過硼酸鈉,控制溫度低于30℃
去除正己烷只用乙酸溶劑
控制溫度低于39℃
6~7
7在高溫度(>114oC)下不穩(wěn)定
羥胺高溫度(>64oC)下不穩(wěn)定
40~45℃的較低溫度下反應(yīng)3小時
7~8
放大后較多的三乙胺鹽沉淀,影響攪拌
三乙胺生成潛在的基因毒性雜質(zhì)氯乙烷
用容易溶解的三丁胺替換三乙胺,不產(chǎn)生大量沉淀
氯丁烷不具有遺傳毒性
4+8~9
叔丁醇鉀導(dǎo)致副反應(yīng)增多
用碳酸鉀替換叔丁醇鉀,得到干凈的9
化合物9乙酯水解的過程中也會產(chǎn)生一些開環(huán)雜質(zhì),中間體7和15通過純化可以去除:
  • 改進(jìn)后的工藝用于藥物的中試生產(chǎn),兩批次合成了35.4kg
  • 最終的總收率從6計算53%,從2計算為44%,沒有雜質(zhì)超過ICH Q3A規(guī)定的0.1%閾值,其中最大的0.09%的雜質(zhì)鑒定為雜質(zhì)16。
  • 產(chǎn)生原因是溴異丁酸乙酯中含有的2-溴丙酸乙酯反應(yīng)生成。所以有必要在溴異丁酸乙酯中制定標(biāo)準(zhǔn)。
二、基因毒性雜質(zhì)評估
對反應(yīng)體系中的物料/降解/潛在雜質(zhì)評估后,得到以下結(jié)果:
  • 鹽酸羥胺雖然不具有致突變性,歸為5類,但是具有致癌性,需要按照致癌性數(shù)據(jù)計算PDE=23μg/day。
  • 8是一種單官能團(tuán)的烷基氯,應(yīng)控制在每天小于15微克的限量內(nèi),根據(jù)同類氯代烷烴推算。
  • 根據(jù)ICH M7 對長期給藥的描述,單個基因雜質(zhì)日攝入量不超過1.5μg。

  • 該藥物中單個基因毒性雜質(zhì)的限度為2500μg/g。

  • 控制策略依舊是使用清除因子的方法。




所以重新了解一下一些定義:
Required purge factor(所需清除因子):從起始濃度計算,到清除到合格限度以下所需要的清除因子。
Predicted purge factor (預(yù)估清除因子):根據(jù)化合物物理化學(xué)性質(zhì)得到的對應(yīng)數(shù)值計算得到。
Measured purge(檢測清除數(shù)據(jù)):在給定處理階段已清除到特定閾值以下的分析數(shù)據(jù)
Purge Ratio(清除比PR):預(yù)估清除因子除以所需清除因子
不同的清除比PR數(shù)值對應(yīng)著不同的控制策略:
對以上三個化合物分別討論如下:

溴異丁酸乙酯的控制策略

  • 溴異丁酸乙酯投料2eq,反應(yīng)1eq,剩余1eq,折合為1g/g=1000000μg/g。
  • 降低到2500μg/g的限度需要理論計算所需清除因子為400(1000000/2500=400)。
  • 預(yù)估清除因子為1.0 x 105,PR=1.0 x 105/400=250,處于1000X>PR>100X范圍。
  • 如果按照方法4,需要額外收集一些分析數(shù)據(jù)來支持,如果沒有支持?jǐn)?shù)據(jù),建議參考方法1/2/3。

溴異丁酸乙酯的額外支持?jǐn)?shù)據(jù)

由于化合物3沒有經(jīng)過分離純化,所以假設(shè)剩余的1eq溴異丁酸乙酯全部帶入化合物4中,事實上取出化合物3,去除溶劑,通過NMR分析發(fā)現(xiàn),溴異丁酸乙酯剩余的摩爾比小于5%。
現(xiàn)在從化合物4開始計算,含有5%(50000μg/g)的溴異丁酸乙酯,經(jīng)過步驟4a/4b/5反應(yīng)
  • 該階段的預(yù)估清除因子為1.0 x 105
  • 所需清除因子為20(50000/2500=20)
  • PR=1.0 x 105/20=5000>1000x,所以采用方法4是合理的
  • 在GW641597X的粗品中通過NMR未檢測到溴異丁酸乙酯,進(jìn)一步證明清除數(shù)據(jù)有效

鹽酸羥胺的控制策略

  • 鹽酸羥胺加入2.5當(dāng)量剩余1.5當(dāng)量,換算為1.5g/g=1500000μg/g
  • 羥胺的PDE為23μg/g,相當(dāng)于API中38333μg/g,所需的清除因子為39.1(1500000/38333=39.1)
  • 預(yù)估清除因子為1.0 x 108,PR=1.0 x 108/39=2.56 x 106>1000X
  • 按照方法4控制

中間體8的控制策略

  • 中間體8投料比為1.15eq,剩余為0.15eq
  • 根據(jù)同類氯代烷烴的數(shù)據(jù)得到PDE=15μg/day,在API中含量可以達(dá)到2.5%,但是M7規(guī)定不得超過0.5%,因此取下限5000μg/g。所需清除因子=150000/5000=30
  • 預(yù)估清除因子為1000,PR=1000/30=33<100X
  • 如果沒有足夠的數(shù)據(jù)支持需要參考M7方法1/2/3控制

中間體8的額外數(shù)據(jù)

為了獲得實際的清除因子,通過NMR檢測GW641597X粗品,發(fā)現(xiàn)中間體8殘留大約為0.2%摩爾比。
這個數(shù)值已經(jīng)低于所需的0.5%的限度。
繼續(xù)通過HNMR在GW641597X中檢測,已經(jīng)觀測不到中間體8的殘留,說明采用方法4的控制策略也是合理的。
完成了三個雜質(zhì)的討論,剩下的就是清晰明了的將這些信息整理并提交到監(jiān)管機(jī)構(gòu)。
簡明扼要的提交資料信息表

工藝路線的繼續(xù)探索

開發(fā)了一條中間體和API均可以通過結(jié)晶純化的路線,該路線也有明顯的優(yōu)勢,主要劣勢是線性合成。
參考文獻(xiàn):1:Development of a scalable process for the PPAR-alpha agonist GW641597X incorporating Baeyer-Villiger Chemistry and retrospective ICH M7 assessment

2:A consortium-driven framework to guide the implementation of ICH M7 Option 4

control strategies

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