編者按:
然而,科學(xué)家對什么是“壞”菌、什么是“好”菌、健康人的菌群應(yīng)該長成怎樣等等最基礎(chǔ)的問題都還沒有確切的答案。那么,所謂的“菌群失調(diào)”其實可能是個偽命題,至少并沒有好的量化標(biāo)準(zhǔn)。
因此,“菌群失調(diào)”這個概念可能誤導(dǎo)醫(yī)生、研究者等專業(yè)人士,針對普通消費者、患者的產(chǎn)品和干預(yù)方案可能是不可靠的。
近期科普作者 Elizabeth Preston 的一篇文章,特別討論了“菌群失調(diào)”這個概念的使用爭議,以及可能給消費者、患者帶來的誤區(qū),我們覺得非常值得分享,特別進(jìn)行了全文編譯,以饗讀者。
原文標(biāo)題:The Problem With Labeling Gut Troubles ‘Dysbiosis’
作者:Elizabeth Preston
翻譯:董麗娜
原文地址:https://undark.org/2019/10/21/microbiome-scientists-debate-dysbiosis
Heinz Koop 的糞便檢測分析報告首頁上,一條豎線顯示了他的結(jié)果在色條(從綠色到紅色)上的位置,上面有一個標(biāo)簽用德語寫著“整體失調(diào)(Overall dysbiosis)”。Koop 的結(jié)果不在綠色區(qū)域,甚至也不在黃色區(qū)域,而在一個令人擔(dān)心的橙色區(qū)域。這個結(jié)果很糟糕,不過 Koop 反而覺得有點高興。
對于他反復(fù)出現(xiàn)的腹瀉帶血和其它腸道問題,醫(yī)生沒有給他一個滿意的答案。但 Koop 在 Facebook 上了解到,他或許可以通過腸道菌群檢測找到問題所在。
Koop 去德國當(dāng)?shù)氐囊粋€機(jī)構(gòu)做了糞便檢測,檢測結(jié)果顯示他的腸道菌群失調(diào),就是文章開頭那一幕。他對這個結(jié)果感到高興,因為他覺得這意味著他找到了病因,就可能有治療的辦法。根據(jù) Facebook 上的建議,他可能會嘗試把朋友的新鮮糞菌移植到他的腸道來改善他的失調(diào)。
我們已經(jīng)知道,我們的體表和體內(nèi)生活著數(shù)萬億的微生物,尤其是我們的腸道里,這些微生物構(gòu)成了我們的微生物群落。正如1970年一位研究者推測的那樣,腸道問題不僅僅會導(dǎo)致我們便秘,還與我們的健康存在更為復(fù)雜的關(guān)系。腸道菌群可以幫助我們消化食物,合成一些關(guān)鍵維生素,并將致病菌拒之門外。
過去十幾年里,隨著越來越多的研究者試圖揭示疾病和宿主菌群之間的關(guān)系,菌群研究呈現(xiàn)爆炸式增長。
德國 Evotec 公司計算生物學(xué)家 Katarzyna Hooks 估計,如今至少有10%已發(fā)表的菌群相關(guān)論文中使用了“菌群失調(diào)”這個詞來描述菌群的一些變化。一些科學(xué)家認(rèn)為這個詞雖然有局限性,但在表達(dá)特定的發(fā)現(xiàn)時很有用。
也有一些科學(xué)家非常討厭這個詞。主要問題是“菌群失調(diào)”這個詞字面上看,不僅僅是說菌群發(fā)生了變化,而且常常會意味著不好的變化。愛爾蘭科克大學(xué)胃腸病學(xué)家和微生物學(xué)家 Fergus Shanahan 說:“這意味著我們的菌群某些方面失衡或者出問題了?!?/p>
但是,在菌群研究這一非常新的領(lǐng)域,腸道菌群和疾病的關(guān)系仍然不明確。大多數(shù)情況下,研究者并不知道菌群的變化是否是不好的變化。它可能是疾病帶來的副作用,也可能是我們的腸道菌群對新情況的一個適應(yīng)。有時候看起來不正常,可能實際上是正常反應(yīng)。
Hooks、Shanahan,還有一些其他專家認(rèn)為,使用“菌群失調(diào)”這個詞不僅是科學(xué)傳播上的一個偏差,而且是科學(xué)思維的失敗。Shanahan 認(rèn)為,這種用法本身自帶偏見,即使科學(xué)家們并不想誤導(dǎo)大眾,實際上這個概念已經(jīng)足夠誤導(dǎo)大眾。
這種用法已經(jīng)給公眾帶來了一些困惑,一部分誤導(dǎo)來源于直接面向消費者做的糞便檢測結(jié)果,這導(dǎo)致很多人試圖想做糞菌移植。而一些研究者認(rèn)為,由于目前較為有限的科學(xué)基礎(chǔ),糞菌移植本身存在潛在的風(fēng)險,并不適合普遍應(yīng)用。
2007年美國啟動了人類微生物組計劃(HMP),目標(biāo)非常遠(yuǎn)大。研究者利用新技術(shù)去詳細(xì)分析大量的微生物群落,得出的這些數(shù)據(jù)將改變我們對這些定居者在健康和疾病中所扮演的角色的理解。
在一期成果中,科學(xué)家研究了細(xì)菌的種屬、基因以及基因產(chǎn)物。今年5月份發(fā)布的二期成果中,研究了三類特殊人群的菌群,分別是懷孕和早產(chǎn)(PTB)、炎癥性腸?。↖BD)和前驅(qū)二型糖尿病患者。這些研究已經(jīng)累計了42 TB 的巨量數(shù)據(jù)。
然而結(jié)果顯示,我們的腸道菌群存在很大的個體差異,所有的數(shù)據(jù)中,并沒有出現(xiàn)普遍性或者可以定義為正常標(biāo)準(zhǔn)的菌群出現(xiàn)。
加州大學(xué)圣地亞哥分校的 Rob Knight 教授是 HMP 項目的主要參與者,地球微生物組計劃(EMP)的負(fù)責(zé)人之一,同時也是美國腸道計劃(AGP)的發(fā)起人之一。他說,這個結(jié)果表明,健康人的菌群可以是多種多樣的組成方式。
進(jìn)一步講,當(dāng)我們對比疾病人群和健康人群時,很難區(qū)分他們之間菌群差異是疾病的誘因,還是受疾病影響的結(jié)果??茖W(xué)家們說,可能是菌群的差異導(dǎo)致了疾病的發(fā)生,但也可能是疾病改變了菌群。
Shanahan 說:“我認(rèn)為更有可能的是,大多數(shù)這些改變是繼發(fā)性的,這更令人興奮,這些改變甚至可能是我們的身體對這些疾病做出的恰當(dāng)反應(yīng)。”
還有其它可能的解釋。Knight 教授舉了一個2型糖尿病的例子,糖尿病患者的菌群變化是是由一種常見的糖尿病藥物二甲雙胍引起的。還有的情況是,疾病和菌群變化能夠互相加強。
一些研究結(jié)果會給人們一些誘人的暗示。Knight 在2013年的一篇研究論文中,把肥胖和非肥胖人群的腸道菌群移植給無菌小鼠。由于無菌小鼠生長在一個完全無菌的環(huán)境中,所以它們沒有自身的菌群。當(dāng)這些小鼠接受肥胖者的菌群后,體脂增加了10%。
這項研究發(fā)表之后,一度成為了很多新聞媒體的頭條,題目也很吸引眼球,比如“你的腸道菌群可能讓你變胖”,“瘦子的腸道菌群有助于減肥”,“腸道細(xì)菌可能是對抗肥胖的秘密武器”等等。
Knight 說:“這項研究非常有趣,但這并不能證實在人體上也會具有這種關(guān)系?!毙∈蟛⒉皇俏⒖s版的人,小鼠試驗只是一種提示,并不能推斷在人體會有同樣的作用。
早期一項關(guān)于肥胖的研究就很好地證明了這一點??茖W(xué)家給肥胖的老鼠注入瘦素,老鼠奇跡般地苗條了。但是臨床試驗卻是一個大的打擊,因為這個分子在人體內(nèi)并不能以相似的方式發(fā)揮作用。
在2017年的一篇論文中,Hooks 和其共同作者 Maureen O’Malley 分析了500篇使用 “菌群失調(diào)”這個詞的菌群相關(guān)研究論文。他們發(fā)現(xiàn)半數(shù)以上的論文定義“菌群失調(diào)”為一個失衡,而其它語境下只是指菌群的變化,或者是特定菌種的改變。
Hooks 說:“我開始認(rèn)為‘菌群失調(diào)’是一個無意義的詞,但是很不幸,我們還找不到更確切的詞,它或許還是一個偷懶的選擇?!?/p>
2019年的一篇論文里,Shanahan 和他的共同作者也持類似觀點。還有麻省理工學(xué)院(MIT)的 Scott Olesen 和 Eric Alm 在2016年也提出了同樣觀點,他們認(rèn)為這種說法是“科學(xué)發(fā)展以前的思想的延續(xù)”,跟體液平衡或者失衡類似。在文章中,Olesen 和 Alm 對其他研究者經(jīng)常使用“菌群失調(diào)”感到懊惱,他們覺得這個詞表達(dá)的語義非常不明確。
當(dāng)然,也有不少研究者認(rèn)為“菌群失調(diào)”是一個非常好的概念,因此被廣泛的應(yīng)用。某些情況下,他們在論文中使用這個定義完全沒有問題。
比如,加州大學(xué)戴維斯分校的微生物學(xué)家 Andreas Baumler 就不回避這個概念。他認(rèn)為腸道菌群是免疫系統(tǒng)的一個武器,其功能就是清除侵入的致病菌。菌群失調(diào)就是保護(hù)宿主的免疫武器失去應(yīng)有的作用了,不管這些菌群里有哪些種屬存在。
明尼蘇達(dá)州梅奧醫(yī)學(xué)中心的胃腸病和微生物組專家 Purna Kashyap 也發(fā)表過菌群失調(diào)的論文。不過,他說他不喜歡這個詞常?!氨挥脕砻枋鼍旱囊恍┳兓?。他對菌群失調(diào)的定義與 Baumler 略有不同,他認(rèn)為,健康的人都擁有一個健康的腸道菌群,當(dāng)“菌群被破壞,對宿主產(chǎn)生了不良影響”時可以稱為“菌群失調(diào)”。
最近的一篇論文中,Kashyap 和合作者發(fā)現(xiàn),一些腹瀉患者有著與眾不同的菌群,當(dāng)把這些患者的糞菌移植到無菌小鼠體內(nèi),這些小鼠更易受到艱難梭菌的感染。艱難梭菌是一個常見的致病菌,在美國這一致病菌一年可引起將近50萬人患病。
Kashyap 說,當(dāng)科學(xué)家們發(fā)表的研究論文以及一些新聞報道宣稱疾病和菌群失調(diào)間的關(guān)系時,人們就想要檢測一下看看他們自己的菌群是否失調(diào)了。所以我們在表達(dá)時,要慎重使用這個詞。
糞菌移植的效果真的非常的不可思議,已經(jīng)成為臨床治療的一部分。
由于糞菌移植的潛在作用機(jī)制我們理解的還非常不夠,在美國,醫(yī)生只給患有復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染的患者實施糞菌移植。這意味著,美國那些寄希望于醫(yī)生檢測他們的菌群并給他們做糞菌移植的患者可能會感到失望。
34歲的 Lindsay Calverley 住在加州,多年來她一直受消化道疾病的困擾,影響到了她生活的多方面。醫(yī)生無法給她一個明確的解釋,但是她懷疑自己的菌群出了問題,而且她在多個公司做的糞便檢測也證實了她的擔(dān)心。
Calverley 說:“我做了五、六次不同公司和機(jī)構(gòu)的糞便檢測,以這種或那種方式發(fā)現(xiàn)了某種程度的菌群失調(diào)?!边@些檢測結(jié)果各有不同結(jié)論,有的說“過度生長”,有的說“生長不夠”,有的說“失去平衡”了。
最終,她決定通過 DIY 的糞菌移植去恢復(fù)這種平衡。 她在網(wǎng)上聯(lián)系了一個佛羅里達(dá)的私人商販,以80美元六盎司(滿足一次治療)過濾糞便的價格,花1120美元買到了14包用干冰凍著的糞便。這是那時候她能夠負(fù)擔(dān)得起的最多的治療次數(shù)。
對于 Calverley 的檢測結(jié)果,Shanahan 認(rèn)為檢測機(jī)構(gòu)可能要負(fù)很大責(zé)任,比如說“過度生長”這樣的結(jié)論,盡管細(xì)菌過度生長是一個公認(rèn)的醫(yī)學(xué)現(xiàn)象,但是它發(fā)生在小腸而不是結(jié)腸,而且并不能夠通過糞便來檢測出來。
像 Kashyap 一樣,也會有一些患者請求他通過糞菌移植去治療他們的“菌群失調(diào)”。對于像 Calverley 這樣的人群,他們急需緩解自己的病癥,但從醫(yī)生那里得不到解釋,陌生人的糞便似乎能夠給他們帶來一點希望。
在美國,能夠接受來自醫(yī)生的糞菌移植的唯一方法是診斷為復(fù)發(fā)性艱難梭菌感染,或參與一些臨床試驗。因此,很多人嘗試自己 DIY 糞菌移植。
今年一月,Kashyap 加入了 uBiome 公司的咨詢委員會,這是一家提供菌群檢測的公司。該公司的檢測報告會告訴用戶,他們的糞便中某些細(xì)菌超出了“正?!狈秶?,這些細(xì)菌與什么疾病是相關(guān)的。例如,uBiome 的一份報告中說,一個患者的擬普雷沃菌(Alloprevotella)豐度較低,這將增加心血管疾病風(fēng)險。
Kashyap 說,他加入是為了“就如何使他們的檢測報告更科學(xué)、更透明提出一些建議,以免給患者造成焦慮”。Kashyap 已經(jīng)多次向 uBiome 表達(dá)了他的擔(dān)憂。
這可能是一個有爭議的問題,今年春天,美國 FBI 突擊搜查了 uBiome 的辦公室,調(diào)查了這家公司的一些不當(dāng)做法。今年9月,該公司已向相關(guān)部門申請破產(chǎn)保護(hù)。
關(guān)于 uBiome 的相關(guān)報道,延伸閱讀如下:
壞榜樣!估值6億美元的明星公司uBiome涉嫌騙保恐墜入深淵
焦點:uBiome申請破產(chǎn)保護(hù)+7專家預(yù)測微生態(tài)療法的未來5年
Kashyap 表示,目前能夠告訴你是否需要做糞菌移植,唯一有用的檢測是艱難梭菌檢測。如果從菌群檢測中尋找其它的解釋,“那不是現(xiàn)在科學(xué)能夠做到的,除非你是一只小白鼠?!?/p>
Heinz Koop 在臉書上貼出了一張新鮮糞便的照片,題目是“這是他的糞便,你們覺得如何?”
在 Facebook 上,有一個患者自發(fā)組成的糞菌移植興趣小組,人們在上面互相分享自己的經(jīng)驗,比如在焦慮和痤瘡等情況下自行進(jìn)行糞菌移植,或者為他們的自閉癥兒童進(jìn)行移植,甚至為他們的狗進(jìn)行移植。
Koop 照片中的糞便來自他的一個朋友。Koop 描述說:“他是我所認(rèn)識的人里看上去最健康的,而且非常健壯。”他認(rèn)為他的朋友可能是很好的供體。盡管下面很多評論的關(guān)注點是這個樣本的形狀看起來并不是那么好,Koop 還是用他朋友的糞便給自己做了四次灌腸治療。
Koop 描述說:“操作很簡單,他住在離我僅10分鐘路程的地方,他把糞便裝進(jìn)小盒子,放在冰箱里,然后給我發(fā)信息說‘我有一個新的樣本哦’,然后我就去取回來?!钡?,Koop 后來對他朋友的糞便進(jìn)行了菌群檢測,結(jié)果并不讓他滿意,這個 DIY 試驗就沒有繼續(xù)進(jìn)行下去。
Lindsay Calverley 也開始在家自己 DIY 糞菌移植。她給自己每天的灌腸劑中加入通過特殊渠道獲得的陌生捐贈者的糞便,但是在用完一段時間之后,她并沒有感覺更好,反而出現(xiàn)了新的癥狀。Calverley 聯(lián)系她的捐贈者,得到了退款。
前面提到的 MIT 的 Olesen ,現(xiàn)在是非盈利性糞菌銀行 OpenBiome 的科學(xué)主管。他說:“我們認(rèn)為糞菌移植是一種重要的療法,但需要科學(xué)的研究和嚴(yán)格的臨床試驗證明?!?/p>
他覺得“菌群失調(diào)”這個概念的廣泛使用,可能會使糞菌移植這種整體療法極具吸引力?!翱傆幸恍┭芯空撐母嬖V你,如果你的身體出了什么問題,這可能與腸道菌群有關(guān)。這容易讓人覺得,通過糞菌移植似乎可以包治百病?!?/p>
然而,糞菌移植除了并不總是有療效之外,還有不確定的風(fēng)險。今年早些時候,美國 FDA 公布了兩名免疫缺陷的成年人在接受 FMT 治療后引起了耐藥性細(xì)菌菌血癥,其中一人死亡。作為回應(yīng),F(xiàn)DA 發(fā)出安全警示并開始強制性審查相關(guān)臨床試驗,包括嚴(yán)格篩查捐贈者及其糞便。
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