蛋白作為生命功能的主要的執(zhí)行物質(zhì),蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)對(duì)細(xì)胞功能的正常發(fā)揮是至關(guān)重要的。在其行使完其功能或者在合成、折疊、轉(zhuǎn)運(yùn)等過(guò)程中,有時(shí)會(huì)發(fā)生錯(cuò)誤或損傷時(shí),這時(shí)需要及時(shí)啟動(dòng)降解和清除計(jì)劃,如果該過(guò)程出現(xiàn)問(wèn)題,則會(huì)引發(fā)各種病變。例如,蛋白穩(wěn)態(tài)失衡在一系列的神經(jīng)退行性病變中是很常見(jiàn)——中樞神經(jīng)系統(tǒng)的細(xì)胞內(nèi)或細(xì)胞外異常聚集著突變或損傷的蛋白,包括阿爾茲海默癥、帕金森癥和肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥等。
人類(lèi)細(xì)胞中存在兩類(lèi)主要的蛋白質(zhì)降解途徑,即泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)和溶酶體-自噬通路。(細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞外的垃圾蛋白清理 | 來(lái)源文獻(xiàn)DOI: 10.3390/ijms20010210)真核生物80%-90%蛋白質(zhì)的降解是由泛素-蛋白酶體系統(tǒng)完成的。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)中,泛素(Ub)用于「鎖定目標(biāo)」,結(jié)合到靶蛋白上,形成多聚泛素鏈【該步也被稱(chēng)為泛素化】;而蛋白酶體(主要是26S蛋白酶體)用于識(shí)別、降解帶有多聚泛素鏈的靶蛋白。
(UPS蛋白降解過(guò)程示意圖 | 來(lái)源文獻(xiàn)DOI:10.3390/biom4030862)在UPS系統(tǒng)中,泛素是一種由76個(gè)氨基酸組成的小分子蛋白質(zhì),分子量約8.5kDa,在進(jìn)化過(guò)程中高度保守(如酵母和人的泛素僅有3個(gè)氨基酸序列的差別),普遍存在于真核細(xì)胞內(nèi)。泛素分子全長(zhǎng)包含7個(gè)賴(lài)氨酸(Lys)位點(diǎn)(K6,K11,K27,K33,K48和K63)、一個(gè)位于N端的甲硫氨酸(Met)位點(diǎn)(M1)以及一個(gè)位于C端的甘氨酸(Gly)位點(diǎn)(G76)。根據(jù)現(xiàn)有研究,無(wú)論在細(xì)胞內(nèi)環(huán)境還是胞外反應(yīng)體系,泛素自身的每個(gè)賴(lài)氨酸位點(diǎn)以及N端的甲硫氨酸(Met1)位點(diǎn)都可以發(fā)生泛素化從而延伸泛素鏈。泛素化(Ubiquitination)是指泛素在一系列酶的催化作用下對(duì)靶蛋白進(jìn)行特異性修飾的過(guò)程(是蛋白質(zhì)組中最普遍的翻譯后修飾之一)。泛素化過(guò)程通常需要3種泛素化酶的協(xié)同作用:E1泛素激活酶、E2泛素結(jié)合酶和E3泛素連接酶。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),泛素化過(guò)程就是:②E1上的泛素被轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2上,隨后泛素連接酶E3非特異性的結(jié)合E2,然后把E2帶到特異性的靶標(biāo)蛋白質(zhì)上(或E3接過(guò)泛素,把泛素連到靶標(biāo)蛋白上)。如果靶蛋白結(jié)合單個(gè)泛素分子,則稱(chēng)為單泛素化;如果靶蛋白的多個(gè) Lys 殘基同時(shí)被單個(gè)泛素分子標(biāo)記稱(chēng)為多泛素化;而靶蛋白的單個(gè)Lys殘基被多個(gè)泛素分子標(biāo)記則稱(chēng)為多聚泛素化。( 來(lái)源文獻(xiàn)DOI:10.1016/bs.ircmb.2018.05.012)不同的泛素化鏈長(zhǎng)度及多種多樣的泛素化鏈類(lèi)型[K6、K11、K27、K29、K33、K48、K63和Met1 (linear)]在蛋白質(zhì)活性、蛋白-蛋白相互作用以及蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位中發(fā)揮極為重要的調(diào)控功能。其中對(duì)K48和K63位多聚泛素化的研究最廣泛。- 與前面所提到的蛋白酶體降解相關(guān)的泛素化為K48。
MET1連接的線(xiàn)性泛素鏈可以作為NF-κB信號(hào)的關(guān)鍵正向調(diào)節(jié)因子,在腫瘤、炎癥和免疫等方面發(fā)揮重要作用。
K11與K48結(jié)合形成的Lys48/Lys11支鏈可以加強(qiáng)蛋白酶體的降解,另外K11泛素鏈還可以調(diào)控細(xì)胞周期與有絲分裂。
- K27連接的泛素鏈可以作為DNA損傷反應(yīng)中蛋白質(zhì)招募的支架,還參與蛋白酶體信號(hào)傳導(dǎo)。
- K6泛素鏈與DNA損傷反應(yīng)、線(xiàn)粒體自噬等相關(guān)。
- K33泛素鏈可以調(diào)控TCR反應(yīng),在的各種生物過(guò)程中都有涉及。
K63連接的泛素鏈修飾和單泛素化修飾可能參與NF-κB信號(hào)調(diào)節(jié),DNA修復(fù)和自噬等功能。
(來(lái)源文獻(xiàn)DOI:10.1177/0022034520949486)總之,泛素化通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、活性、亞細(xì)胞定位以及與其它蛋白質(zhì)相互作用等方面進(jìn)行調(diào)控,廣泛參與了諸如免疫反應(yīng)調(diào)控、線(xiàn)粒體自噬、DNA損傷修復(fù)、細(xì)胞周期調(diào)控、表觀(guān)遺傳調(diào)控、細(xì)胞增殖、凋亡和蛋白質(zhì)降解等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。因而一旦失調(diào),就會(huì)引發(fā)諸如癌癥、肌肉營(yíng)養(yǎng)不良、免疫疾病以及代謝綜合征等病變。基于泛素化通路的蛋白降解已被認(rèn)為是腫瘤及神經(jīng)退行性疾病的一種極具前景的治療策略,其中代表性的PROTAC技術(shù)和分子膠技術(shù)已進(jìn)入多種癌癥治療的臨床研究階段。泛素化也是一個(gè)被嚴(yán)格調(diào)控的可逆過(guò)程,尤其是去泛素化酶使泛素化修飾具有良好的平衡性。研究表明,細(xì)胞內(nèi)廣泛存在許多去泛素化酶(DUBs)。去泛素化酶可移除蛋白質(zhì)上的單聚泛素分子或多聚泛素鏈,使泛素化修飾具有良好的平衡性。它主要通過(guò)水解泛素羧基末端的酯鍵、肽鍵或異肽鍵,將泛素分子特異性地從連接有泛素的蛋白質(zhì)或者前體蛋白上水解下來(lái)。去泛素化酶對(duì)泛素化過(guò)程不僅起著抑制作用,而且可以通過(guò)分解泛素化抑制因子、再循環(huán)泛素分子、校對(duì)泛素化進(jìn)程等方式促進(jìn)泛素化過(guò)程,從而與泛素化系統(tǒng)共同組成一個(gè)復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。總而言之,泛素化和去泛素化是一個(gè)整體的、動(dòng)態(tài)的、特異性的生物學(xué)過(guò)程。泛素化和去泛素化的平衡影響了細(xì)胞內(nèi)很多可溶性蛋白質(zhì)的命運(yùn),調(diào)節(jié)了包括蛋白分選、蛋白降解、DNA修復(fù)、轉(zhuǎn)錄激活和基因沉默等大量的生物學(xué)過(guò)程。(泛素化和去泛素化的過(guò)程,來(lái)源文獻(xiàn)DOI:10.1038/nrd.2017.152)自從1975年泛素被發(fā)現(xiàn)以來(lái),各類(lèi)相關(guān)研究層出不窮。2004年,Ciechanover,Hershko和Rose因發(fā)現(xiàn)泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)降解共同獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。近十年來(lái)泛素化相關(guān)文章也是日益增多,在2002年P(guān)ubMed發(fā)文數(shù)量就達(dá)到5000篇,并一直保持增長(zhǎng),2021年就有6875篇。但目前的認(rèn)知只是冰山一角,很多問(wèn)題仍有待探索。泛素化在國(guó)自然中也是一大熱點(diǎn),中標(biāo)項(xiàng)目數(shù)一直保持穩(wěn)定的增長(zhǎng),是一個(gè)不錯(cuò)的研究方向。(來(lái)源:梅斯醫(yī)學(xué)國(guó)家自然科學(xué)基金分析——medsci.cn截圖)
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