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艾倫研究所:2019年6月重磅腦科學(xué)資訊

1.研究大腦同步活動的新模型誕生

為什么把兩個半腦放在一起能夠整合一體,而非碎片的總合?在大腦中,連接至關(guān)重要,人類大腦約有100萬億個突觸連接。

艾倫研究所通過計算機(jī)模型對小鼠大腦連接圖的分析表明,遠(yuǎn)距離連接可能對哺乳動物大腦同步活動尤為重要,而這些連接和同步活動在阿爾茨海默病患者中往往會減少。此外,阿爾茨海默病患者的大腦在同步和異步活動之間的快速切換能力也出現(xiàn)下降。

Hannah Choi博士表示:“由于大腦的連接結(jié)構(gòu)存在非常獨(dú)特的復(fù)雜性,所以即使存在相對簡單的模型,我們?nèi)孕杞⒌讓咏Y(jié)構(gòu)模型來捕捉大腦的工作方式?!边@項(xiàng)研究用的是艾倫研究所鼠腦連接圖譜中的數(shù)據(jù)建立大腦某個功能的神經(jīng)活動同步模型。

大腦中最強(qiáng)的連接發(fā)生在相近神經(jīng)元之間,但是一小部分大腦的連接會跨越更長的距離,這些連接對于模擬大腦的自然動力學(xué)計算模型十分必要。而大多數(shù)以前的建模工作都沒有考慮到它們。

Mihalas博士說,這個模型只是朝著理解大腦的復(fù)雜結(jié)構(gòu)的一個步驟,神經(jīng)科學(xué)家們還在努力了解在阿爾茨海默病的小鼠模型中的連接和同步是否和如何改變,這些發(fā)現(xiàn)可能會闡明驅(qū)動這種神秘疾病的另一生物學(xué)原因。

2.成癮和視覺系統(tǒng)的數(shù)據(jù)故事

目前,大腦神經(jīng)元多樣性的作用尚不清楚。要破解該問題,就需要開發(fā)先進(jìn)的技術(shù),在離散的感覺線索和行為背景的呈現(xiàn)過程中,評估單基因定義的神經(jīng)元,從而監(jiān)測大腦的生理和行為。

感覺編碼和解碼是神經(jīng)科學(xué)、神經(jīng)修復(fù)術(shù)和人工智能領(lǐng)域的熱門研究方向,Randy Ellis研究員利用艾倫大腦觀測平臺的數(shù)據(jù)集來尋找治療藥物成癮的新方法,發(fā)現(xiàn)了成癮與視覺系統(tǒng)千絲萬縷的聯(lián)系

研究者們利用了一組來自于大約25000個由單基因定義的小鼠視覺皮層神經(jīng)元在118個獨(dú)特的自然場景呈現(xiàn)過程中的數(shù)據(jù),證明了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以用于解碼神經(jīng)元鈣反應(yīng)中的離散視覺場景,準(zhǔn)確率高達(dá)96%。

這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)突出了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在利用神經(jīng)元鈣成像數(shù)據(jù)進(jìn)行感官解碼方面的新用途,并揭示了一張跨越腦區(qū)、皮層、神經(jīng)元類型和時間的視覺解碼強(qiáng)度的神經(jīng)解剖學(xué)圖。

3."細(xì)胞登記"技術(shù)實(shí)現(xiàn)腦細(xì)胞類型數(shù)據(jù)集的建立

總部設(shè)在艾倫研究所的腦細(xì)胞數(shù)據(jù)中心通過腦細(xì)胞普查網(wǎng)絡(luò)啟動了一個新的集中數(shù)據(jù)資源倡議,以期為腦細(xì)胞類型數(shù)據(jù)開發(fā)新的探索工具。

該工具主要通過腦細(xì)胞普查網(wǎng)絡(luò)、旨在建立哺乳動物大腦細(xì)胞參考圖譜的BICCN,允許用戶搜索和探索來自全國不同實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)的多個數(shù)據(jù)集,通過諸如物種、研究者、授權(quán)號或?qū)嶒?yàn)技術(shù)的特征來過濾,最終集成不同的數(shù)據(jù)來描述細(xì)胞類型,提供一種用于集成、可視化和可分析的社區(qū)資源。

Cell Registry是一個可公開訪問的門戶網(wǎng)站,供用戶瀏覽該數(shù)據(jù)。艾倫腦科學(xué)研究所的的高級總監(jiān)LydiaNG博士說:“這是朝著建立全面的細(xì)胞類型普查邁出的第一步?!?/span>

4. 2019年生物圖像信息學(xué)研討會

2019年102日至4日在艾倫學(xué)院主辦的生物圖像信息研討會將探討生物醫(yī)學(xué)圖像的信息和知識的處理、分析和提取,現(xiàn)已開放注冊和海報摘要提交。

生物細(xì)胞和組織標(biāo)記、自動化顯微鏡和成像的進(jìn)展已使分子、細(xì)胞和房室結(jié)構(gòu)可視化?,F(xiàn)今幾乎細(xì)胞生物學(xué)和神經(jīng)科學(xué)的每一個分支正通過動態(tài)成像和電子顯微鏡產(chǎn)生大量的多維生物成像數(shù)據(jù)。對這些圖像數(shù)據(jù)集進(jìn)行定量、客觀、自動和高效的解釋和分析是當(dāng)前計算生物學(xué)的一個重大挑戰(zhàn)。

生物圖像信息學(xué)會議是處理、分析和從生物醫(yī)學(xué)圖像中提取信息和知識的年度會議。該會議成立于2005年,每年約有200名計算科學(xué)家出席會議。隨著機(jī)器學(xué)習(xí)在細(xì)胞分辨科學(xué)中的應(yīng)用,這些工具和技術(shù)的意義越來越大。

2019年生物圖像信息學(xué)會議主題包括:細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能中的機(jī)器應(yīng)用和深度學(xué)習(xí),重建和分析神經(jīng)元結(jié)構(gòu)和網(wǎng)絡(luò),形態(tài)學(xué)圖像分析,動態(tài)圖像和傳輸現(xiàn)象的量化,數(shù)據(jù)采集和分析的自動化,細(xì)胞和生物行為的動態(tài)成像。

5. 2019年神經(jīng)未來會議

下個月在俄勒岡州波特蘭的2019年神經(jīng)未來會議,將會有科研、工程、工業(yè)和臨床領(lǐng)域的佼佼者加入,用來自艾倫大腦地圖集的數(shù)據(jù)和工具給你的研究充電。

這個研討會將向與會者介紹來自艾倫腦科學(xué)研究所的各種科學(xué)資源。多個大規(guī)模、多維、公開可用的數(shù)據(jù)集提供了對鼠和人腦轉(zhuǎn)錄、功能和結(jié)構(gòu)的探索。

這些數(shù)據(jù)集還提供了對成人和發(fā)育腦和特定疾病狀態(tài)中基因表達(dá)的深入研究。會中將重點(diǎn)討論與哺乳動物神經(jīng)科學(xué)基礎(chǔ)研究相關(guān)的艾倫腦地圖集資源,與會者可在自己的研究中使用這些數(shù)據(jù)集。

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