2016年12月29日，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院在其官方網(wǎng)站發(fā)布通知：《醫(yī)教研三位一體，清華大學(xué)在醫(yī)學(xué)院成立臨床醫(yī)學(xué)院》。通知中稱，清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院英文名稱School of Clinical Medicine，英文縮寫SCM。醫(yī)學(xué)中心相關(guān)職能轉(zhuǎn)入臨床醫(yī)學(xué)院。董家鴻擔(dān)任臨床醫(yī)學(xué)院院長，徐滬濟(jì)擔(dān)任臨床醫(yī)學(xué)院常務(wù)副院長。
在清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院成立15周年之際，清華大學(xué)終于有了自己的臨床醫(yī)學(xué)院。在此之前，清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)自2006年起，通過與協(xié)和醫(yī)學(xué)院合作辦學(xué)模式招生。合作十年之后，清華大學(xué)選擇自立門戶。據(jù)董家鴻院長介紹，清華大學(xué)雖然成立了自己的臨床醫(yī)學(xué)院，但學(xué)校要求到2018年承接臨床醫(yī)學(xué)生，在這個過程中，還將繼續(xù)與協(xié)和醫(yī)學(xué)院進(jìn)行合作，進(jìn)行為期一年的過渡。
清華大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院的建立也并不意味著兩所院校的合作即將終止?！夺t(yī)學(xué)界》在清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院官網(wǎng)發(fā)現(xiàn)，在2016年12月29日清華大學(xué)與北京協(xié)和醫(yī)院剛剛啟動了深度合作，并聘任協(xié)和醫(yī)院院長趙玉沛為清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院雙聘教授。根據(jù)雙方合作協(xié)議：清華大學(xué)與協(xié)和醫(yī)院將圍繞重大疾病和罕見病開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)合作研究，建設(shè)醫(yī)學(xué)與工程交叉平臺，并在全球聯(lián)合招聘醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才；清華大學(xué)和協(xié)和醫(yī)院將進(jìn)一步加強(qiáng)醫(yī)學(xué)教育合作，共同培養(yǎng)清華醫(yī)學(xué)院八年制醫(yī)學(xué)生，以及協(xié)和醫(yī)院臨床研究生，探索建立雙導(dǎo)師制，開放共享教學(xué)與研究資源。
在北京除北京中醫(yī)藥大學(xué)之外的四大醫(yī)學(xué)院校中，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)部不論從成立時間上，還是從院校規(guī)模上，都是較為年輕的一個。首都醫(yī)科大學(xué)擁有包括宣武醫(yī)院、朝陽醫(yī)院、安貞醫(yī)院、天壇醫(yī)院、友誼醫(yī)院、同仁醫(yī)院等在內(nèi)的20家附屬醫(yī)院；北大醫(yī)學(xué)部也有北大醫(yī)院、北大人民醫(yī)院等10家附屬醫(yī)院；協(xié)和醫(yī)學(xué)院有協(xié)和醫(yī)院、阜外醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院等6家附屬醫(yī)院；而清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院目前僅有清華長庚醫(yī)院、玉泉醫(yī)院和華信醫(yī)院三家附屬醫(yī)院，其中清華長庚醫(yī)院剛剛建院兩周年，而玉泉醫(yī)院是一所二甲醫(yī)院。
清華大學(xué)在通告中表示：在醫(yī)學(xué)院建院15周年之際成立臨床醫(yī)學(xué)院，是清華醫(yī)學(xué)邁向一流的關(guān)鍵一步。醫(yī)學(xué)院將整合基礎(chǔ)和臨床教育資源，進(jìn)一步提升臨床醫(yī)學(xué)博士培養(yǎng)質(zhì)量，建設(shè)住院醫(yī)師、?？漆t(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地，形成國際化研究型的清華醫(yī)學(xué)教育體系，打造新世紀(jì)醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才成長的搖籃。
臨床醫(yī)學(xué)院成立后，清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院就形成了包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、生醫(yī)工程、公共健康在內(nèi)的完整學(xué)科體系。對于醫(yī)學(xué)院的發(fā)展，董家鴻院長說：“我們現(xiàn)在不需要那么多的附屬醫(yī)院，關(guān)鍵要先做強(qiáng)師資隊(duì)伍，建立完善的教學(xué)體系?！?/span>
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