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Nature:發(fā)現(xiàn)與COVID-19危重病相關(guān)聯(lián)的49個(gè)遺傳變體

來源:生物谷原創(chuàng) 2023-05-29 09:45

COVID-19由冠狀病毒SARS-CoV-2感染導(dǎo)致。在一項(xiàng)新的研究中,來自蘇格蘭愛丁堡大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員研究了COVID-19患者的危重病例。他們發(fā)現(xiàn)作為一種極端的、臨床上一致的疾病表型,C

COVID-19由冠狀病毒SARS-CoV-2感染導(dǎo)致。在一項(xiàng)新的研究中,來自蘇格蘭愛丁堡大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員研究了COVID-19患者的危重病例。他們發(fā)現(xiàn)作為一種極端的、臨床上一致的疾病表型,COVID-19危重病出現(xiàn)在具有共同遺傳屬性的患者身上。這些共同的遺傳學(xué)特性提示了一種在其他患者中未見的COVID-19危重病的共同機(jī)制,以及解決這種疾病的潛在療法。相關(guān)研究結(jié)果于2023年5月17日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19”。

這些作者在2020-2022年招募了確診為COVID-19并需要持續(xù)心肺監(jiān)測(cè)或器官支持的患者(COVID-19危重病的一般定義)。他們結(jié)合國(guó)際GenOMICC研究(11440例)和其他招募重癥和危重病住院患者的研究,包括COVID-19人類遺傳學(xué)倡議、國(guó)際嚴(yán)重急性呼吸道與新發(fā)感染聯(lián)盟、西班牙開啟宿主遺傳學(xué)研究聯(lián)盟和23andMe,分析了24202例COVID-19危重病患者的微陣列基因型和全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)。

這些作者發(fā)現(xiàn)了49個(gè)全基因組的重要關(guān)聯(lián),即49個(gè)相關(guān)的遺傳變體,其中的16個(gè)以前沒有報(bào)道過,在基因?qū)用娴姆治鲋邪l(fā)現(xiàn)了196個(gè)明顯相關(guān)的基因。盡管這些相關(guān)的基因變體并不直接導(dǎo)致患者的疾病,但它們可以突出使一些SARS-CoV-2感染更加嚴(yán)重的分子機(jī)制。

圖片來自Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06034-3。

許多與COVID-19危重病相關(guān)的基因在單核細(xì)胞-巨噬細(xì)胞系統(tǒng)中高度表達(dá),而這一系統(tǒng)在現(xiàn)有的表達(dá)數(shù)量性狀基因座(expression quantitative trait loci, eQTL)數(shù)據(jù)集中覆蓋率很低。巨噬細(xì)胞合成許多參與宿主防御和炎癥的物質(zhì),并在免疫系統(tǒng)反應(yīng)中起著關(guān)鍵作用。

此外,這項(xiàng)新的研究還發(fā)現(xiàn)循環(huán)蛋白水平的變化與15種獨(dú)特的蛋白有關(guān),這些蛋白與COVID-19危重病有關(guān),其中的一些是經(jīng)過充分研究的生物標(biāo)志物,使得它們成為藥物靶向的良好候選對(duì)象。

這項(xiàng)新的研究在多種系統(tǒng)中發(fā)現(xiàn)了接種潛在的藥用可靶向的靶標(biāo),包括炎癥信號(hào)傳導(dǎo)系統(tǒng)、單核細(xì)胞-巨噬細(xì)胞激活系統(tǒng)和內(nèi)皮通透性系統(tǒng)。所發(fā)現(xiàn)的一些靶標(biāo)已經(jīng)在多個(gè)藥物試驗(yàn)中出現(xiàn)了治療信號(hào)的積極結(jié)果,為利用比較遺傳學(xué)進(jìn)行藥物靶標(biāo)識(shí)別提供了良好的概念驗(yàn)證。(生物谷 Bioon.com)

參考資料:

Erola Pairo-Castineira et al. GWAS and meta-analysis identifies 49 genetic variants underlying critical COVID-19. Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06034-3.


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