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我們的經(jīng)驗(yàn):新冠病毒檢測(cè)常見(jiàn)問(wèn)題處理

華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院檢驗(yàn)科

新型冠狀病毒流行地區(qū)

臨床實(shí)驗(yàn)室常見(jiàn)問(wèn)題解答

(第一版)

1. 分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的生物安全和個(gè)人防護(hù)要求如何?


生物安全二級(jí)及以上實(shí)驗(yàn)室條件生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室級(jí)別的個(gè)人防護(hù),如一次性醫(yī)用防護(hù)服、護(hù)目鏡、雙層手套、醫(yī)用防護(hù)口罩(如3M公司的1860/9132醫(yī)用N95口罩,口罩必須做氣密性檢測(cè))、防護(hù)靴套??谡值确雷o(hù)用品的佩戴一定要正確,否則等同于無(wú)防護(hù)。三級(jí)防護(hù)的個(gè)人需保證休整時(shí)間,連續(xù)工作4個(gè)小時(shí)以上會(huì)因缺氧而導(dǎo)致乏力、頭暈等不良反應(yīng)。需正確識(shí)別高強(qiáng)度工作狀態(tài)下的身體不適與病毒感染引起的早期癥狀的區(qū)別,避免產(chǎn)生不必要的心理壓力。

2. 發(fā)熱門(mén)診的血液、大小便樣本的處理和檢測(cè)如何開(kāi)展?

是否需要單獨(dú)開(kāi)辟獨(dú)立的空間和設(shè)施?


中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS)可在呼吸道樣本、血液和糞便樣本中檢出,同科屬的新型冠狀病毒(2019-nCoV)潛在具有上述特性。目前的資料表明:經(jīng)呼吸道飛沫傳播是2019-nCoV的主要傳播途徑,亦可通過(guò)接觸傳播(如手-口途徑、糞-口途徑)。因此來(lái)自2019-nCoV感染病人的非呼吸道樣本也具有潛在的感染性,應(yīng)盡量避免暴露環(huán)節(jié)(如不開(kāi)蓋的血常規(guī)檢測(cè)模式)以及避免產(chǎn)生氣溶膠(離心后靜置)。不可避免的暴露性操作(如開(kāi)蓋等)應(yīng)在生物安全柜中進(jìn)行。由于感染者和非感染者難以區(qū)分,應(yīng)將所有樣本視為具有感染性(標(biāo)準(zhǔn)預(yù)防),在條件不允許的情況下可不設(shè)立獨(dú)立的檢測(cè)空間,但工作人員必須佩戴外科口罩或醫(yī)用防護(hù)口罩等個(gè)人防護(hù)措施,并保證環(huán)境的生物安全。對(duì)疑似病人樣本給予更高的重視,對(duì)處理后樣本、廢棄物及環(huán)境執(zhí)行更嚴(yán)格、頻繁的消毒滅菌措施(見(jiàn)下述第6條)。

3. 樣本的轉(zhuǎn)運(yùn)流程?


可依據(jù)“國(guó)衛(wèi)辦醫(yī)函【2020】53號(hào)”文件執(zhí)行。

院內(nèi)運(yùn)輸:樣本由醫(yī)護(hù)人員采集后,放入兩層一次性密封袋內(nèi)密封,置于樣本轉(zhuǎn)運(yùn)箱后,與樣本運(yùn)送人員交接,樣本由專(zhuān)人運(yùn)送入實(shí)驗(yàn)室。樣本運(yùn)送過(guò)程中,運(yùn)送人員應(yīng)佩戴帽子、一次性外科口罩、手套、隔離衣。

院外運(yùn)輸:按照《可感染人類(lèi)的高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運(yùn)輸管理規(guī)定》(衛(wèi)生部令第45號(hào))要求執(zhí)行。

4. 病毒滅活處理方法?


文獻(xiàn)及指南報(bào)道,56℃ 30 min可滅活冠狀病毒,我們的初步試驗(yàn)表明,干浴(烤箱或恒溫箱)56℃ 30min或50℃ 60min的滅活方式不影響呼吸道樣本中RNA病毒的檢測(cè)(見(jiàn)圖1)。時(shí)間所限,我們對(duì)于此次新冠病毒的評(píng)估尚未完成,將在再版中更新這一內(nèi)容。

圖1 不同滅活方式對(duì)PCR檢測(cè)結(jié)果的影響

根據(jù)上述結(jié)果,并綜合其它資料,為了減少感染樣本對(duì)人和環(huán)境的潛在危害,我們初步推薦:呼吸道樣本(微生物等培養(yǎng)目的除外)先56℃干浴 60 min,靜置10 min至室溫(避免氣溶膠),然后進(jìn)行處理。

但必須強(qiáng)調(diào)的是,病毒滅活效果與其所在基質(zhì)成分有關(guān),因?qū)嶒?yàn)條件所限,我們無(wú)法評(píng)估該方法滅活病毒的真實(shí)效果。此外,我們選擇干浴后靜置10 min是基于我們現(xiàn)有的樣本量及實(shí)驗(yàn)條件。理論上,干浴后靜置的時(shí)間越長(zhǎng),產(chǎn)生氣溶膠的風(fēng)險(xiǎn)越小。基于此,干浴處理后的樣本仍視為具有感染性,其后續(xù)處理應(yīng)視同未滅活的樣本。

5. 廢棄物如何處理?


對(duì)檢測(cè)完成后的疑似病人樣本采用雙層塑料袋密封;對(duì)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中產(chǎn)生的廢液和槍頭等置于含0.5%~1%有效氯的含氯消毒液的廢液缸。上述物品經(jīng)壓力蒸汽滅菌處理。詳見(jiàn)《新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南》(第三版)。

6. 檢驗(yàn)科如何合理設(shè)置呼吸道樣本檢測(cè)項(xiàng)目組合?


依據(jù)方便(臨床采樣和檢驗(yàn)科檢測(cè))和安全原則對(duì)項(xiàng)目組合進(jìn)行安排。2019-nCoV核酸檢測(cè)項(xiàng)目宜單獨(dú)申請(qǐng),單獨(dú)采樣方便檢測(cè)。其它呼吸道病毒核酸檢測(cè)項(xiàng)目(流感、腺病毒、呼吸道合胞病毒等)則可單獨(dú)和/或組合申請(qǐng)。所有呼吸道樣本均應(yīng)視為潛在的感染源,并做相應(yīng)處理和防護(hù)。更重要的是建立一套完善的有關(guān)2019-nCoV檢測(cè)的管理機(jī)制,涵蓋項(xiàng)目申請(qǐng)、檢測(cè)時(shí)限、報(bào)告時(shí)間、報(bào)告方式、對(duì)內(nèi)對(duì)外聯(lián)系,以及分析前、中、后各種環(huán)節(jié)。

7. 生物安全柜的選擇和使用注意事項(xiàng)?


對(duì)潛在含有2019-nCoV的呼吸道樣本的操作應(yīng)在生物安全柜(biosafety cabinet)中進(jìn)行,工作狀態(tài)下遵守操作規(guī)程可保證工作人員不受侵害。生物安全柜檢定合格方能使用(包括外觀和功能、潔凈度等級(jí)、垂直氣流平均風(fēng)速、工作窗口進(jìn)風(fēng)平均風(fēng)速、照度、噪音、氣流狀態(tài))。

操作注意事項(xiàng):

⑴風(fēng)機(jī)運(yùn)行至少5min后方可開(kāi)始操作;

⑵柜內(nèi)盡量少放物品,以免影響氣流循環(huán);

⑶避免干擾氣流,不良行為包括手臂頻繁出入,操作者身后人員頻繁走動(dòng),阻擋空氣格柵;

⑷在中后部操作,并不影響透過(guò)玻璃擋板觀察;

⑸柜內(nèi)不可進(jìn)行文字工作;

⑹風(fēng)機(jī)運(yùn)行至少5 min后方可關(guān)機(jī);

⑺工作完成后、每天下班前,使用適當(dāng)消毒劑擦拭表面。

8. 在防護(hù)用品不能完全達(dá)到要求的時(shí)候,怎樣最大程度地自我保護(hù)及進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室安全防護(hù)?


無(wú)論防護(hù)條件是否滿(mǎn)足要求,標(biāo)準(zhǔn)預(yù)防、不定期通風(fēng)和手衛(wèi)生是最重要的防護(hù)措施。

此外,必須牢記三個(gè)防控要素。

⑴人員:必須有安全意識(shí),不能麻痹大意,以往及當(dāng)下的經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)表明安全意識(shí)越強(qiáng),感染的幾率越小。

具體措施:

①無(wú)論是否處于工作狀態(tài),無(wú)論是否在病房或是其它環(huán)境,佩戴口罩,不到萬(wàn)不得已的情況,比如吃飯、喝水,都不要摘下,如果需要摘下口罩,強(qiáng)烈建議先進(jìn)行手消毒再摘下口罩;

②醫(yī)務(wù)人員盡量避免集體就餐,最好是分次就餐,減少小范圍群體性暴露;

③直接面對(duì)病人的窗口工作人員和接觸呼吸道樣本的相關(guān)人員必須嚴(yán)格執(zhí)行生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室級(jí)別的個(gè)人防護(hù)。

⑵操作:必須視所有樣本為潛在感染源,實(shí)行標(biāo)準(zhǔn)預(yù)防措施。對(duì)高危的呼吸道樣本(檢測(cè)核酸或抗原)在送達(dá)實(shí)驗(yàn)室之前滅活(見(jiàn)上述方法和圖1),可最大程度減少生物危害。處理呼吸道樣本必須在生物安全柜中進(jìn)行,操作過(guò)程輕柔避免飛濺。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中產(chǎn)生的污物必須高壓滅菌后才能運(yùn)出實(shí)驗(yàn)室。

⑶環(huán)境:桌面、儀器、固定設(shè)施及地面至少每日采用0.5%~1%含氯消毒液擦拭。含氯消毒液(注意,洗必泰[氯己定]不能有效滅活病毒)、75%的酒精等消毒物品應(yīng)隨手可及,便于隨時(shí)消毒。PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)束后應(yīng)紫外照射房間及相關(guān)設(shè)施以消除核酸污染,同時(shí)殺滅病毒。紫外消毒時(shí)必須保證門(mén)窗緊閉。

9. 樣本類(lèi)型?采集流程和容器?


呼吸道樣本(包括咽拭子、鼻咽拭子、鼻咽抽取物、痰液、呼吸道抽取物、支氣管灌洗液、肺泡灌洗液等)均可。為了減少污染流程可相對(duì)固定一種樣本類(lèi)型及操作簡(jiǎn)便的方法,以便更好實(shí)施(除特殊情況下需采集特定的樣本)。對(duì)自動(dòng)核酸提取方法而言,采用帶病毒保存液的咽拭子或鼻咽拭子可避免開(kāi)蓋添加生理鹽水的步驟。采樣人員必須嚴(yán)格執(zhí)行生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室級(jí)別的個(gè)人防護(hù)。樣本采集質(zhì)量嚴(yán)重影響檢測(cè)結(jié)果,需對(duì)采樣人員進(jìn)行專(zhuān)業(yè)培訓(xùn),如咽拭子采集應(yīng)擦拭兩側(cè)腭弓和咽、扁桃體的分泌物。

10. 核酸提取方法、試劑的選擇?


目前RNA提取方法眾多,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)選擇簡(jiǎn)便、高效的核酸提取方法。我們當(dāng)前使用的蛋白酶K消化,磁珠分離的全自動(dòng)核酸提取方法證明有效。由于2019-nCoV感染是突發(fā)事件,各種試劑通過(guò)快審進(jìn)入臨床最大程度解決了臨床急需,但當(dāng)前存在以下兩方面的問(wèn)題給結(jié)果的報(bào)告和解釋造成了較大的困擾。

⑴不同試劑盒陽(yáng)性檢出率存在較大差別;

⑵一部分試劑盒檢測(cè)ORF1ab和E及N基因,另一部分試劑盒只檢測(cè)ORF1ab和N基因,部分試劑的單陽(yáng)性結(jié)果占陽(yáng)性結(jié)果的20%以上。

另一個(gè)值得關(guān)注的問(wèn)題是試劑的選擇還需與實(shí)驗(yàn)室的硬件設(shè)備相匹配,如有的儀器對(duì)PCR擴(kuò)增管有特別要求(100μL或者200μL)等。

11. 報(bào)告模板?


基于上述問(wèn)題,我們建議以陽(yáng)性、可疑陰性三種結(jié)果進(jìn)行報(bào)告,對(duì)單陽(yáng)性的結(jié)果及可疑結(jié)果建議采用不同試劑盒進(jìn)行復(fù)核,并進(jìn)行備注(圖2)。部分地區(qū)可將陽(yáng)性和可疑的樣本送CDC確證。

圖2 同濟(jì)檢驗(yàn)科2019-nCoV核酸檢測(cè)報(bào)告模板

參考文獻(xiàn):

1. 國(guó)家衛(wèi)生健康委辦公廳關(guān)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)開(kāi)展新型冠狀病毒核酸檢測(cè)有關(guān)要求的通知.國(guó)衛(wèi)辦醫(yī)函【2020】53號(hào)

2. 關(guān)于印發(fā)新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第四版)的通知. 國(guó)衛(wèi)辦醫(yī)函【2020】77號(hào)

3. 新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南(第三版)

4. Real-Time RT-PCR Panel for Detection 2019-Novel Coronavirus.

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/rt-pcr-detection-instructions.html

5.https://mp.weixin.qq.com/s/uWiOOpfxQH4c77rAFXfNgQ

奮戰(zhàn)一線(xiàn)的同濟(jì)檢驗(yàn)人






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