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別催了,核酸檢測真的已經(jīng)很快了
春節(jié)期間,準(zhǔn)備回家過年的人都面臨著目的地48小時內(nèi)核酸陰性報告的防疫要求。各個核酸檢測點門口都排起長隊,寒風(fēng)中瑟瑟發(fā)抖的人們不禁思考:為什么出報告就不能再快一點呢?為什么不能像常規(guī)驗血一樣半個小時取報告呢?
 
各位鄉(xiāng)親父老,別催了!
核酸檢測真的已經(jīng)在全速沖刺,并且還在努力改進(jìn),變得越來越快。
01

核酸檢測到底檢了點啥?

首先,核酸不是什么新名詞。它是生物體內(nèi)的遺傳物質(zhì),一共兩大類:DNA和RNA。核酸保存遺傳信息的方式也挺一根筋的:用幾個不同的分子從頭到尾往下“寫”,而且一共只用四個字母。如果是DNA的話,用A、T、C、G寫,寫成2排;如果是RNA的話,用A、U、C、G寫,寫成1排;仿佛某種四進(jìn)制密碼。

圖源:wiki

PS:如果您家里有選了生物的高考考生,可以讓TA告訴您這A,T,C,G分別代表了什么含氮堿基,這里因不影響理解不作詳細(xì)解釋。

這些生物密碼不是隨便瞎編的,通過分析它們的順序人們能得知許多事情。比如:有些密碼跟身份證一樣每個人身上都不盡相同,刑警以此來確定兇手是法外狂徒張三而不是背鍋的李四。有些密碼在親屬間有相似性,可以用來確定孩子是自己的而不是充話費送的。
 
還有一部分密碼在同一物種體內(nèi)是一致的,用以保證龍生龍,鳳生鳳,人生人,且生下來的人絕大多數(shù)情況下還是兩個眼睛兩條腿,鼻子下面長著嘴。通過檢測這類密碼,人們可以倒推一些事情——例如:只要抓到了某種序列,那該核酸序列的擁有者一定是人類,無論他怎樣聲稱自己是天仙下凡青蛇成精都不好使,他就是人類。
 
新冠病毒也一樣,只要檢測到特定的核酸序列的存在,那它就是新冠病毒,而不是其他微生物或人體細(xì)胞內(nèi)的核酸。核酸檢測就是要想辦法把這段特定的“身份密碼”抓出來。
02

保姆級核酸檢測

技術(shù)原理解釋

盡管核酸是一種“大分子”,它的長度計量單位還是納米級的。人為一條一條去看上面寫了啥肯定不可能,儀器也很難對單個分子產(chǎn)生反應(yīng)。因而核酸檢測為了抓到病毒身份密碼存在的證據(jù),會使用一種叫熒光定量RT-PCR的特殊技術(shù)。先給采集來的樣本做一次滅活以免病毒伺機(jī)作妖,再用以下幾個步驟逼它招供:

提取核酸

核酸檢測的目標(biāo)只有核酸,病毒自己用來裝核酸的方便兜子蛋白質(zhì)殼子不要,大家被采集點小姐姐一起捅下來的鼻涕泡食物殘渣等也不要。
 
為了精準(zhǔn)把核酸抓出來,有好幾種方法可以用。比較常用的方法是“一步”和“磁珠法”。

操作簡便,快速又經(jīng)濟(jì)的方法是一步法:將核酸釋放劑和樣本在PCR管中混合,室溫靜置10分鐘,加入核酸釋放劑讓病毒裂開,再上離心柱一陣狂甩,讓蛋白質(zhì)等不需要的東西與核酸分離,再把上層清液里的核酸撈去檢測。即可獲得適用于熒光PCR檢測的核酸,將需要多次離心或是加熱的繁瑣傳統(tǒng)方法改變成為了簡單便捷的一步操作,耗時極短,大大提高檢測效率。但缺點是漏檢率較高。

圖源:imgflip.com

還有一種很巧妙的方法叫磁珠法:往溶液里面扔點能跟核酸黏在一起親親我我的小圓珠,等它們抱緊核酸后,利用磁力把小圓珠吸住固定,其他不要的東西都沖走。然后再想辦法強(qiáng)拆CP讓小圓珠松手(通常是改變?nèi)芤禾匦?,如PH值等),那樣就可以得到純純的核酸了。

圖源:wiki


核酸擴(kuò)增與檢測

把核酸都抓出來之后,就該看看到底有沒有新冠病毒核酸特有的密碼了。畢竟樣本里很可能還有點其他微生物或者人體自身細(xì)胞帶來的核酸,它們?nèi)羰遣桓蓧氖碌牧己檬忻?,就不能冤枉它們報假警?/span>
 
檢查的方式有點像對暗號,一些特殊的引物與探針被加到試劑里,引物大喊“天王蓋地虎”,這時候誰答應(yīng)一句“寶塔鎮(zhèn)河妖”誰就是新冠病毒。不吱聲的或者亂答“我是二百五”的就是其他無辜核酸。一旦聽見正確的答句,探針就會扔出一個熒光信號,表示找到了壞蛋。
 
“天王蓋地虎”是人類的密語,要跟病毒核酸對暗號就得找到對面能懂的語言。
 
去哪兒找呢,DNA大麻花大家都見過吧?喏,兩條鏈子扭在一起,中間是一些五顏六色,彩啦吧唧的玩意兒。這里想強(qiáng)調(diào)的重點是,DNA示意圖里的彩色小橫線并不是隨便亂畫的。如前方所說,這些代表堿基的小橫線一共就四種,名字縮寫是A,T,C,G。并且他們成雙成對,A的對面一定是T,C的對面一定是G。

圖源:wiki

這就是核酸用來記錄信息的“語言”,只要知道了其中一條鏈“寫”了啥,另一條就能匹配出來。于是工作就變得簡單起來:

引物:CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
病毒:GGGACACCCAAAATGTGAATT
探針:就是它!?。?/span>

可惜的是,單個病毒核酸交代出暗號密碼后,發(fā)出的信號太微弱了。儀器:大點聲!我聽不見!熒光信號在哪兒呢?我沒看見。
 
好吧,一個熒光點不行,成千上萬個不停出現(xiàn),總能捕捉到到了。通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),人們可以逼迫被檢測的DNA不停復(fù)制出一模一樣的副本,1條變2條,2條變4條。再一遍一遍反復(fù)對暗號后,探針就會一次又一次確認(rèn)到病毒并釋放出熒光信號,指數(shù)級增加,從而被儀器檢測到。
 
到這里可能會有人發(fā)現(xiàn)個小問題:新冠病毒是RNA病毒,RNA只有一條鏈,這套檢測機(jī)制不是針對DNA的嗎?別擔(dān)心,逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)會在擴(kuò)增開始前把單鏈的病毒RNA轉(zhuǎn)化成雙鏈的cDNA,之后照常分析。
 
至于為什么不直接復(fù)制RNA,是因為RNA單鏈不穩(wěn)定,復(fù)制時乏校正功能,容易出錯。類似于萬一把“天王蓋地虎”復(fù)制成“天王蓋壁虎”,接下去就不好辦了。
03

所以核酸檢測還能再快點嗎?

通過原理解釋大家可以看到,核酸檢測有一套必須按部就班完成的流程,其中每一步都要耗時。尤其是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增數(shù)量的步驟,一旦開機(jī)便沒辦法暫停。后續(xù)如果有新一批樣本需要檢測,不能中途加進(jìn)去,只能新開一鍋。如同電飯煲工作到一半無法半路再加米。

不過為了滿足繁重的核酸檢測需求,相關(guān)人員還是在用多種手段努力讓核酸檢測變得越來越快。


增加檢測設(shè)備供應(yīng)

一臺設(shè)備來不及做,那么“再來一臺”聽起來是理所當(dāng)然的事情,然而核酸檢測并不是買幾臺儀器搬到現(xiàn)場就能開工的。它需要依托能夠保證操作安全的實驗室,在處理醫(yī)療廢棄物,空氣消毒等方面都有特定的要求。
 
因而能“憑空”兩三天內(nèi)拔地而起的氣膜實驗室就成了抗疫一線的救星。去年上半年投入的“獵鷹號”氣膜實驗室每組每天可以檢測超過3萬個樣本,以便大家及時拿到核酸檢測報告。

“獵鷹號”氣膜實驗室


縮短流程時間

優(yōu)化熒光定量RT-PCR的過程也讓核酸檢測變得越來越快。例如一些核酸釋放劑加入后不需要再采用離心等手段去分離出核酸,而是直接可以進(jìn)入下一步擴(kuò)增。
 
核酸在PCR擴(kuò)增儀里不停數(shù)量翻倍通常要進(jìn)行95-100分鐘,那是為了產(chǎn)生足夠多的副本被設(shè)備檢測到。如果設(shè)備的靈敏度提高,那么就可以少做幾輪擴(kuò)增,自然就會縮短時間。
 
還有一種思路是擴(kuò)增環(huán)節(jié)因反應(yīng)物對溫度需求的不同,需要反復(fù)升溫降溫,那么改善導(dǎo)熱結(jié)構(gòu),使每一次升溫降溫變得更快也能縮短檢查時間。去年的中國創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽中,最快新冠核酸檢測儀器可以在30分鐘內(nèi)出檢測結(jié)果。

中國核酸檢測專利申請趨勢

(為了增加核酸檢測能力,研發(fā)人員不停在追求更高效的技術(shù))

圖源:21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)頻道


主動出擊,給空氣做核酸檢測

即將開幕的2022年北京冬奧會,將會采用一套自主研發(fā)的生物氣溶膠新冠病毒核酸監(jiān)測系統(tǒng),可以檢測空氣中懸浮的病毒。
 
這套設(shè)備外觀與普通的檢測儀器似乎區(qū)別并不大,實際上卻能從樣本采集到檢驗實驗室里的步驟(包括前面介紹過的滅活處理、核酸提取、擴(kuò)增)全都自動化集成完成,45分鐘得出檢測結(jié)果。且儀器靈敏度達(dá)到20拷貝/毫升,比常規(guī)設(shè)備(200-500拷貝/毫升)靈敏了10倍以上。測試賽期間共采集和檢測348例標(biāo)本,檢測成功率100%。
 
但愿冬奧大顯身手后,這套系統(tǒng)今后能在醫(yī)院、車站、機(jī)場等人流密集的場所落地,及時發(fā)現(xiàn)病毒,助力疫情防控。興許人們就不用排著隊去做檢測啦~
 
新冠疫情總會過去,但這不會是人類最后一次與大規(guī)模傳播的病毒戰(zhàn)斗。未來面對新的致病微生物之時,這些不斷革新的技術(shù)將幫助人類更好地維持個人健康與社會秩序。

參考文獻(xiàn)

[1].李剛,馬文麗,生物化學(xué)[D]. 北京大學(xué)醫(yī)學(xué)出版社,2013

[2]. 余漢忠,牛璐璐等,不同核酸提取方法和新型冠狀病毒核酸檢測試劑室間 質(zhì)評結(jié)果分析[J]. 臨床檢驗雜志2021年2月,39(2)

[3]. 國家衛(wèi)生健康委員會辦公廳,新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術(shù)指南(第四版),2020

[4]. Rossi, Liane & Costa, Natalia & Silva, Fernanda & Wojcieszak, R.. (2014). ChemInform Abstract: Magnetic Nanomaterials in Catalysis: Advanced Catalysts for Magnetic Separation and Beyond. Green Chemistry. 16. 2906-2933. 10.1039/c4gc00164h. 

[5]. 30分鐘內(nèi)出結(jié)果,全國最快新冠核酸檢測儀器亮相創(chuàng)業(yè)大賽,上海市科學(xué)技術(shù)委員會,2021-09-09,http://stcsm.sh.gov.cn/xwzx/mtjj/20210909/aed248c31ac24a6792d6e2557fe327bd.html

[6]. 中國科學(xué)院過程工程研究所,一種自助式核酸檢測一體機(jī)及微流控芯片[P]. 中國專利,CN214088513U,2021-08-31

編輯:91

鳴謝:上海普陀區(qū)中心醫(yī)院檢驗科 檢驗技師 張孟哲 醫(yī)學(xué)博士

來源:上海科技館

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