到目前為止，2019新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）基因組被認為比SARS-CoV或MERS-CoV更穩(wěn)定。一項來自杜克-新加坡國立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的最新的研究顯示，SARS-CoV-2已發(fā)生一段長度達382個核苷酸的大片段缺失突變（?382），該缺失突變是SARS-CoV-2病毒感染人類后的第一次重大變異事件，也提示檢測該基因片段的新冠試劑盒將失效。研究人員認為該缺失突變會使SARS-CoV-2更適應(yīng)感染人類宿主，并且該?382變異的病毒已經(jīng)傳播了至少四周。
先前的研究表明，開放閱讀框架8(ORF8)基因片段是SARS相關(guān)冠狀病毒的進化熱點，ORF8區(qū)域已被證明在導(dǎo)致2003年”非典“的SARS-CoV的物種間傳播、病毒復(fù)制效率以及適應(yīng)人類宿主等方面發(fā)揮了重要作用。
來自的一項最新的研究顯示，研究人員在8名新加坡住院的SARS-CoV-2感染患者中，發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2基因組均存在一段長度達382個核苷酸的大片段缺失突變（?382），?382片段幾乎完全覆蓋了SARS-CoV-2的ORF8基因片段及其轉(zhuǎn)錄表達調(diào)節(jié)序列(TRS)，導(dǎo)致ORF8基因不能表達，?382是SARS-CoV-2病毒進入人類后的第一次重大變異事件。
圖示：SARS-CoV-2存在一段長度達382個核苷酸的缺失突變（?382）
病毒核衣殼內(nèi)最重要的蛋白之一就是核衣殼蛋白（N，Nucleocapsid Protein），主要負責(zé)RNA的復(fù)制功能。核衣殼蛋白（N蛋白）常作為新型冠狀病毒診斷檢測工具，是新冠病毒快速診斷試劑核心原料。?382片段缺失會增強下游SARS-CoV-2病毒N蛋白基因的轉(zhuǎn)錄表達。因此，研究人員推測在該片段的缺失可能會導(dǎo)致SARS-CoV-2更適應(yīng)人類宿主。進一步研究還發(fā)現(xiàn)，?382病毒已經(jīng)傳播了至少四周。
圖示：?382增強下游N蛋白基因的轉(zhuǎn)錄表達
最后，鑒于ORF8是SARS相關(guān)冠狀病毒的進化熱點，且已被證明在SARS-CoV的物種間傳播、病毒復(fù)制效率以及適應(yīng)人類宿主等方面發(fā)揮了重要作用。因此，隨著SARS-CoV-2在人類中的持續(xù)傳播，我們很可能會發(fā)現(xiàn)更多的病毒變異。而且后續(xù)的研究應(yīng)當(dāng)注重?382 SARS-CoV-2病毒導(dǎo)致的表型變化以及該基因組標(biāo)記物在分子流行病學(xué)調(diào)查研究中的應(yīng)用。
參考文獻：Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2
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