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益生菌多數(shù)為厭氧菌，致病菌或條件致病菌多數(shù)為需氧菌。腸道中的氧氣來自吞食的空氣，從胃到結(jié)腸，腸道在整個(gè)長度內(nèi)變得越來越無氧，氧氣濃度逐步降低。腸道內(nèi)氧氣濃度低時(shí)，厭氧菌占絕對(duì)優(yōu)勢，幾乎是需氧菌的1000倍，這樣腸道才能健康；而當(dāng)腸道內(nèi)氧氣濃度偏高時(shí)，致病菌數(shù)量增加，這就導(dǎo)致腸道出現(xiàn)問題。

而芽孢桿菌是一種需氧菌，在有氧和無氧條件下都能存活。大多數(shù)芽孢桿菌屬細(xì)菌是無害的，但有一些對(duì)人和動(dòng)物是有致病性的。其中凝結(jié)芽孢桿菌可作為益生菌食用。

由于芽孢桿菌好氧，在腸道內(nèi)消耗大量氧氣，維持腸道厭氧環(huán)境，從而促進(jìn)厭氧的雙岐桿菌、乳酸菌等益生菌的生長，抵制致病菌的生長，從而維持腸道菌群平衡。

芽孢桿菌產(chǎn)生的抗菌物質(zhì)具有廣泛的抑菌譜，能殺傷包括耐藥菌株在內(nèi)的細(xì)菌、某些真菌、寄生蟲、部分病毒以及腫瘤細(xì)胞等，并且能結(jié)合脂多糖、中和內(nèi)毒素等作用，在醫(yī)療上也有重要的價(jià)值。

另外，芽孢桿菌產(chǎn)生的抗菌物質(zhì)對(duì)畜禽具有促生長、保健和治療疾病的作用，屬無毒副作用、無殘留、無致細(xì)菌耐藥性的一類綠色制劑。