當(dāng)今世界,科技發(fā)展日新月異,創(chuàng)新速度明顯加快,顛覆性技術(shù)不斷涌現(xiàn),技術(shù)更替和成果轉(zhuǎn)化周期日益縮短,產(chǎn)業(yè)形態(tài)發(fā)生深度調(diào)整。生命科學(xué)、生物技術(shù)與信息技術(shù)等交叉融合正在引發(fā)新一輪科技革命和產(chǎn)業(yè)變革,從而更加深刻地改變著人們的生產(chǎn)生活方式乃至思維方式和認(rèn)知模式。
2015年,生命科學(xué)領(lǐng)域取得多項(xiàng)突破,并向轉(zhuǎn)化研究推進(jìn);技術(shù)持續(xù)更新,逐漸向高精度、高效率、高通量,以及動(dòng)態(tài)、大規(guī)模發(fā)展。學(xué)科的匯聚、技術(shù)的推動(dòng),生命科學(xué)研究不斷向縱深推進(jìn),健康與疾病發(fā)生機(jī)制研究的視角不斷豐富,疾病防治手段更加多樣化,改造、合成、仿生、再生研究的深度和廣度不斷拓展。Nature、Science、Nature Methods、MIT Technology Review、Scientific American等刊物也對(duì)2015年度的生命科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)突破進(jìn)行了評(píng)選,并預(yù)測(cè)了未來(lái)值得關(guān)注的科學(xué)進(jìn)步和創(chuàng)新性技術(shù)。
2015年,合成生物學(xué)的應(yīng)用范圍不斷拓寬,進(jìn)入應(yīng)用導(dǎo)向的轉(zhuǎn)化研究階段;腦科學(xué)基礎(chǔ)研究產(chǎn)出系列成果,類(lèi)腦研究與人工智能開(kāi)始出現(xiàn)突破;干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域持續(xù)穩(wěn)步發(fā)展,應(yīng)用轉(zhuǎn)化進(jìn)程進(jìn)一步推進(jìn);微生物組研究快速發(fā)展,相關(guān)領(lǐng)域科學(xué)家呼吁啟動(dòng)全球微生物組計(jì)劃;另外,疫苗研究獲得多項(xiàng)突破,為更多傳染性疾病的預(yù)防帶來(lái)希望;免疫療法快速發(fā)展,為癌癥、多發(fā)性硬化癥和艾滋病等重大疾病治療帶來(lái)新希望??蒲羞M(jìn)展的同時(shí),生命科學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)也不斷革新。基因組編輯技術(shù)持續(xù)更新,使用范圍進(jìn)一步擴(kuò)大,其較為成熟的技術(shù)也逐漸推向臨床,與此同時(shí),其涉及的倫理問(wèn)題也引起廣泛關(guān)注;成像技術(shù)發(fā)展逐漸趨向高分辨率、動(dòng)態(tài)、多重成像;光遺傳學(xué)技術(shù)也向精準(zhǔn)、高效發(fā)展;單細(xì)胞分析技術(shù)以及測(cè)序技術(shù)也逐漸向高精度、高效率、大規(guī)模、高通量分析發(fā)展。
合成生物學(xué)應(yīng)用范圍不斷拓寬,進(jìn)入應(yīng)用導(dǎo)向的轉(zhuǎn)化研究階段
合成生物學(xué)逐步從基礎(chǔ)前沿的探索階段進(jìn)入應(yīng)用導(dǎo)向的轉(zhuǎn)化研究階段。美國(guó)斯坦福大學(xué)的研究人員通過(guò)對(duì)酵母進(jìn)行“編程”實(shí)現(xiàn)了從葡萄糖到阿片類(lèi)藥物嗎啡的完整生物合成路徑,這是繼青蒿素生物合成后的又一里程碑事件,該成果入選2015年Science十大科學(xué)突破。
以臨床應(yīng)用為導(dǎo)向的研究廣獲聚焦,美國(guó)伊利諾伊大學(xué)與西北大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)一種在細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生蛋白質(zhì)和酶的人工核糖體]可用于生產(chǎn)新型藥物和下一代生物材料;美國(guó)加州理工學(xué)院研制出世界首個(gè)由蛋白質(zhì)和DNA構(gòu)成的合成結(jié)構(gòu)生物材料,為藥物的精準(zhǔn)傳遞與釋放控制打開(kāi)了大門(mén);瑞士蘇黎世理工學(xué)院發(fā)現(xiàn)合成細(xì)胞因子轉(zhuǎn)換器細(xì)胞可針對(duì)銀屑病、類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等慢性炎癥,選擇性地檢測(cè)相關(guān)疾病的生物標(biāo)志物,釋放細(xì)胞因子抑制炎癥,從而達(dá)到精準(zhǔn)治療的目的。
同時(shí),出于對(duì)合成生物危害性的考慮與轉(zhuǎn)基因生物的防控,科研人員開(kāi)發(fā)新方法預(yù)防基因工程細(xì)菌制造“禍端”,或按照美國(guó)哈佛大學(xué)與耶魯大學(xué)的做法,使其需要合成特殊氨基酸才能生產(chǎn)其必需的蛋白質(zhì);或采取美國(guó)麻省理工學(xué)院的方案,將“死亡開(kāi)關(guān)”添加到轉(zhuǎn)基因生物的基因通路當(dāng)中。
腦科學(xué)基礎(chǔ)取得系列突破,類(lèi)腦研究與人工智能成果初現(xiàn)
在政策的強(qiáng)力支持和推動(dòng)下,腦科學(xué)研究開(kāi)始產(chǎn)出系列成果。美國(guó)弗吉尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院首次發(fā)現(xiàn)了大腦中存在淋巴管,可直接與外周免疫系統(tǒng)連接產(chǎn)生免疫反應(yīng),顛覆了過(guò)去認(rèn)為大腦是免疫豁免器官的概念,該成果入選2015年Science十大科學(xué)突破。美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院繪制了迄今最為詳盡的大腦連接圖譜,完成近2000個(gè)成體小鼠視覺(jué)皮層神經(jīng)元的形態(tài)和電生理特征,描述了超過(guò)11000對(duì)細(xì)胞間連接。美國(guó)NIH與北卡羅來(lái)納大學(xué)醫(yī)學(xué)院開(kāi)發(fā)的新型化學(xué)遺傳學(xué)(chemogenetic)技術(shù)通過(guò)啟動(dòng)和關(guān)閉神經(jīng)元,揭示控制小鼠行為的大腦回路;美國(guó)哈佛大學(xué)、波士頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院和麻省理工學(xué)院建立了神經(jīng)元高精度成像和分析系統(tǒng),首次構(gòu)建了哺乳動(dòng)物大腦新皮層數(shù)字立體超微結(jié)構(gòu)圖;美國(guó)哈佛大學(xué)開(kāi)發(fā)了軟性大腦電子探針,并植入活鼠體內(nèi)證明了其安全性。
美國(guó)加州大學(xué)圣塔芭芭拉分校首次僅用憶阻器創(chuàng)建出神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)芯片;美國(guó)IBM進(jìn)一步利用TrueNorth芯片構(gòu)建了人工小型嚙齒動(dòng)物大腦;瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院成功構(gòu)建大鼠軀體感覺(jué)皮層部分神經(jīng)回路的數(shù)字模型。這一系列進(jìn)展推動(dòng)了類(lèi)腦計(jì)算的發(fā)展,邁出數(shù)字化大腦道路上的重要步伐。
超出程序設(shè)定的智能行為是通向人工智能之路的標(biāo)志性一步。谷歌、Facebook等公司正在推進(jìn)機(jī)器深度學(xué)習(xí)技術(shù),并開(kāi)始商業(yè)化。5月面世的谷歌照片APP,可以更抽象的水平識(shí)別圖片中的元素,進(jìn)而從數(shù)百萬(wàn)張照片中識(shí)別不同臉孔;DeepMind公司已利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)研發(fā)了一個(gè)能夠自學(xué)視頻游戲的計(jì)算機(jī)軟件,可在游戲進(jìn)行到一半時(shí),擊敗多數(shù)專(zhuān)業(yè)玩家。
干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究穩(wěn)步發(fā)展,應(yīng)用轉(zhuǎn)化進(jìn)程進(jìn)一步推進(jìn)
干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域持續(xù)穩(wěn)步發(fā)展,應(yīng)用轉(zhuǎn)化進(jìn)程進(jìn)一步推進(jìn)。基礎(chǔ)研究方面,英國(guó)劍橋大學(xué)與以色列魏茨曼科學(xué)研究院的科研人員將胚胎干細(xì)胞成功“逆轉(zhuǎn)”為原始生殖細(xì)胞,首次將細(xì)胞重編程至如此早期的階段,該成果入選Cell評(píng)選的十佳論文;北京大學(xué)研究人員進(jìn)一步闡明化學(xué)小分子重編程技術(shù)的分子機(jī)理,為化學(xué)誘導(dǎo)方法更加廣泛地應(yīng)用于體細(xì)胞重編程和再生醫(yī)學(xué)奠定了基礎(chǔ),該成果入選Cell評(píng)選的中國(guó)年度論文。2015年,澳大利亞墨爾本大學(xué)與昆士蘭大學(xué)聯(lián)合荷蘭萊頓大學(xué)、美國(guó)加州大學(xué)伯克利分校聯(lián)合格拉德斯通心血管疾病研究所、美國(guó)密歇根大學(xué)與加州大學(xué)聯(lián)合辛辛那提兒童醫(yī)院醫(yī)療中心等機(jī)構(gòu)分別成功構(gòu)建了腎臟、心室和肺,由干細(xì)胞構(gòu)建的微器官類(lèi)型已達(dá)十幾種。產(chǎn)業(yè)化方面,歐洲在2015年批準(zhǔn)了首個(gè)干細(xì)胞治療產(chǎn)品Holoclar,用于治療因眼部灼傷導(dǎo)致的中度至重度角膜緣干細(xì)胞缺乏癥,邁出了干細(xì)胞產(chǎn)業(yè)發(fā)展的第一步。
微生物組研究快速發(fā)展,呼吁啟動(dòng)微生物組計(jì)劃
微生物在健康、環(huán)境、農(nóng)業(yè)和工業(yè)等領(lǐng)域的應(yīng)用潛力巨大,于2010年啟動(dòng)的地球微生物組計(jì)劃(Earth Microbiome Project),旨在分析全球微生物群落,預(yù)期將在2016年獲得其首批研究成果。
始于2007年底,美、英、法、中、日等多個(gè)國(guó)家參與的人類(lèi)微生物組計(jì)劃不斷推進(jìn),促進(jìn)了腸道微生物與人類(lèi)健康的研究。目前,全球正在醞釀微生物組計(jì)劃。2015年美國(guó)國(guó)家科學(xué)技術(shù)委員會(huì)(NSTC)發(fā)布了微生物組研究評(píng)估報(bào)告;10月,美國(guó)科學(xué)家在Science上發(fā)文倡議美國(guó)開(kāi)展聯(lián)合微生物組計(jì)劃(Unified Microbiome Initiative,UMI);與此同時(shí),德國(guó)、中國(guó)和美國(guó)科學(xué)家在Nature上發(fā)文呼吁建立國(guó)際微生物組研究計(jì)劃。
疫苗研究獲得多項(xiàng)突破,為更多傳染性疾病的預(yù)防帶來(lái)希望
2015年,疫苗研究獲得一系列成功,為傳染性疾病的預(yù)防帶來(lái)希望。世界衛(wèi)生組織領(lǐng)導(dǎo)的臨床研究中,埃博拉疫苗rVSV-ZEBOV終于獲得成功,其有效性可達(dá)75-100%;通過(guò)近30年的醞釀,全球首支瘧疾疫苗邁出重要一步,在非洲兒童臨床試驗(yàn)中可降低30%的發(fā)病率,預(yù)計(jì)最早于2017年實(shí)現(xiàn)商業(yè)化;12月,墨西哥批準(zhǔn)了全球首支登革熱疫苗Dengvixia,此疫苗有效性雖僅60%,但可有效預(yù)防已感染登革熱病患再度感染其他病毒株,該疫苗生產(chǎn)商法國(guó)賽諾菲公司將進(jìn)一步向其他國(guó)家申請(qǐng)上市批準(zhǔn)。除一系列新疫苗研制獲得成功外,脊髓灰質(zhì)炎疫苗使尼日利亞首次整年未出現(xiàn)新發(fā)脊髓灰質(zhì)炎病毒感染,為全球消滅脊髓灰質(zhì)炎奠定了基礎(chǔ)。
免疫療法快速發(fā)展,為重大疾病治療帶來(lái)機(jī)遇
隨著人類(lèi)免疫系統(tǒng)和疾病發(fā)生機(jī)制認(rèn)識(shí)的深入,免疫療法成為防控許多重大疾病的重要手段。自2013年癌癥免疫療法入選Science十大突破以來(lái),領(lǐng)域研發(fā)熱度持續(xù)不減,被視為癌癥、多發(fā)性硬化癥和艾滋病等疾病治療的新機(jī)遇。2016年美國(guó)國(guó)情咨文中提出了癌癥登月計(jì)劃,其中的重點(diǎn)之一就是癌癥免疫療法的開(kāi)發(fā)。多種癌癥被驗(yàn)證可利用免疫療法進(jìn)行治療,而治療癌癥的抗體藥物特別是靶向程序性死亡受體-1(PD-1)及其配體-1(PD-L1)的抗體藥物,成為國(guó)際醫(yī)藥巨頭競(jìng)相布局的焦點(diǎn)。
基因組編輯技術(shù)不斷革新,進(jìn)一步推向臨床
以CRISPR為代表的基因組編輯技術(shù)仍然是2015年最受關(guān)注的技術(shù)領(lǐng)域,CRISPR技術(shù)“史無(wú)前例”二次登上Science評(píng)選的年度十大突破,且位居榜首。2015年,美國(guó)麻省理工學(xué)院圍繞CRISPR/Cas系統(tǒng)的脫靶問(wèn)題進(jìn)行改進(jìn)和完善,并通過(guò)與其他先進(jìn)技術(shù)的結(jié)合擴(kuò)大其應(yīng)用,此外,美國(guó)斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院設(shè)計(jì)的缺陷基因功能性拷貝插入患者基因組中的新方法可能會(huì)超越CRISPR/Cas系統(tǒng),成為基因組編輯新技術(shù)。另外,美國(guó)加州大學(xué)伯克利分校利用CRISPR/Cas系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)RNA的精確切割進(jìn)一步擴(kuò)展了其應(yīng)用范圍。另外,美國(guó)麻省理工學(xué)院基于CRISPR技術(shù)發(fā)明了DNAi,能夠迫使轉(zhuǎn)基因大腸桿菌剪除其修改過(guò)的基因片段,防止基因片段逃逸而污染環(huán)境。基因組編輯技術(shù)有望成為生命科學(xué)研究的通用技術(shù)。
2015年基因組編輯技術(shù)開(kāi)始應(yīng)用于人類(lèi)疾病治療的臨床試驗(yàn)。研究人員一次性編輯了豬胚胎基因組中的62個(gè)位點(diǎn),給異種器官移植帶來(lái)希望;基因組編輯技術(shù)初創(chuàng)公司Editas Medicine獲得谷歌等1.2億美元的資助,計(jì)劃到2017年將CRISPR技術(shù)用于臨床試驗(yàn),以矯正視力受損患者體內(nèi)的某個(gè)基因突變;英國(guó)研究人員利用TALEN技術(shù)編輯人類(lèi)免疫細(xì)胞的基因組,用于治療患白血病的兒童;2015年底,Sangamo BioSciences生物科技公司宣布,2016年將開(kāi)展利用ZFN技術(shù)修正導(dǎo)致血友病基因缺陷的人體試驗(yàn)。
基因組編輯技術(shù)的發(fā)展隨之帶來(lái)的安全隱患和道德倫理挑戰(zhàn)也成為公眾關(guān)注的焦點(diǎn)。2015年,修飾物種(如蚊子等)基因,以減少其數(shù)量或減少其攜帶病毒所導(dǎo)致疾病,以及中山大學(xué)首次利用CRISPR/Cas技術(shù)改造了人類(lèi)胚胎基因組,引發(fā)全球熱議。12月,美、英、中共同舉辦人類(lèi)基因編輯國(guó)際峰會(huì),全球?qū)<覍?duì)基因編輯技術(shù)所帶來(lái)的基礎(chǔ)研究變革、潛在應(yīng)用,以及由此引發(fā)的社會(huì)問(wèn)題、政府監(jiān)管及法律問(wèn)題進(jìn)行了探討,認(rèn)為現(xiàn)階段應(yīng)禁止對(duì)人類(lèi)胚胎和生殖細(xì)胞進(jìn)行基因組編輯。
成像技術(shù)發(fā)展趨向高分辨率、動(dòng)態(tài)、多重成像
成像技術(shù)同樣備受關(guān)注,單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)在2015年突破了3埃(?)的分辨率障礙,已經(jīng)逐漸成為一種主流結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù),該技術(shù)被評(píng)為2015年Nature Methods評(píng)選的年度技術(shù),這也是成像技術(shù)連續(xù)第二年入選。另外,美國(guó)普渡大學(xué)大大提高了體內(nèi)振動(dòng)光譜成像技術(shù)收集圖片的速度,會(huì)在光子進(jìn)入組織前對(duì)其進(jìn)行顏色編碼;霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所開(kāi)發(fā)的新型顯微鏡,可更加清晰、全面的觀察活體動(dòng)物的動(dòng)態(tài)生物過(guò)程;美國(guó)勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的SR-STORM顯微鏡,可通過(guò)真彩超高分辨率顯微成像獲得每個(gè)標(biāo)簽分子的光譜和位置信息,實(shí)現(xiàn)了多靶標(biāo)成像。Nature Methods認(rèn)為,全新的特異性蛋白標(biāo)記及活細(xì)胞多重成像技術(shù)是2016年值得關(guān)注的技術(shù)。
光遺傳學(xué)技術(shù)向精準(zhǔn)、高效發(fā)展
光遺傳學(xué)技術(shù)已在單細(xì)胞分辨率水平上實(shí)現(xiàn)了對(duì)神經(jīng)元的高效操控,從而為實(shí)現(xiàn)神經(jīng)微解剖走出了第一步。英國(guó)倫敦大學(xué)結(jié)合基因組編輯技術(shù)與光遺傳學(xué)技術(shù)操控神經(jīng)細(xì)胞,可將更小的子光束選擇性靶向單個(gè)腦細(xì)胞;美國(guó)德州大學(xué)醫(yī)學(xué)院在海藻中發(fā)現(xiàn)首個(gè)光控負(fù)離子通道,能更快地抑制神經(jīng)元活動(dòng),是目前最高效的光遺傳蛋白。
單細(xì)胞分析技術(shù)逐漸實(shí)現(xiàn)高精度、大規(guī)模分析
單細(xì)胞分析技術(shù)在2015年獲得重大飛躍,美國(guó)哈佛大學(xué)、麻省理工學(xué)院及麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)布羅德研究所等機(jī)構(gòu)將單細(xì)胞測(cè)序并行檢測(cè)的細(xì)胞數(shù)量從100增加到幾千。此外,美國(guó)德克薩斯大學(xué)研發(fā)的單細(xì)胞外顯子組測(cè)序法(SNES),英國(guó)桑格研究所與牛津大學(xué)、劍橋大學(xué)等機(jī)構(gòu)合作研究的基因組轉(zhuǎn)錄組并行測(cè)序技術(shù)(G&T Seq),美國(guó)細(xì)胞研究(Cellular Research)公司開(kāi)發(fā)的基因表達(dá)流式細(xì)胞測(cè)序技術(shù)(CytoSeq),中國(guó)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)與美國(guó)明尼蘇達(dá)大學(xué)聯(lián)合推出的單孢子測(cè)序技術(shù),使單細(xì)胞組學(xué)能夠展開(kāi)大規(guī)模、高精度的分析。
測(cè)序技術(shù)的精度、效率進(jìn)一步提高
測(cè)序技術(shù)方面,美國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)與技術(shù)研究院提出的石墨單分子層孔道DNA測(cè)序法實(shí)現(xiàn)了高速度、高精度與高效率;與此同時(shí),瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院通過(guò)減緩測(cè)序中DNA流速將測(cè)序精度提高了1000倍,自此單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)(SMRT)不僅能夠高效助力多個(gè)植物和動(dòng)物基因組的研究,而且具備更加精準(zhǔn)的特性。
本文摘編自科學(xué)技術(shù)部社會(huì)發(fā)展科技司,中國(guó)生物技術(shù)發(fā)展中心編著《2016中國(guó)生命科學(xué)與生物技術(shù)發(fā)展報(bào)告》第一章,內(nèi)容有刪減。
2016中國(guó)生命科學(xué)與生物技術(shù)發(fā)展報(bào)告
科學(xué)技術(shù)部社會(huì)發(fā)展科技司,中國(guó)生物技術(shù)發(fā)展中心 編 著
北京:科學(xué)出版社,2016.11
ISBN 978-7-03-050774-7
《2016 中國(guó)生命科學(xué)與生物技術(shù)發(fā)展報(bào)告》總結(jié)了 2015 年我國(guó)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、生物技術(shù)應(yīng)用和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要進(jìn)展情況,重點(diǎn)介紹了我國(guó)在組學(xué)、腦科學(xué)與神經(jīng)科學(xué)、合成生物學(xué)、非編碼 RNA、表觀遺傳學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、免疫學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究進(jìn)展以及生物技術(shù)應(yīng)用于醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、工業(yè)、環(huán)境等方面的情況,分析了我國(guó)生物產(chǎn)業(yè)及細(xì)分領(lǐng)域的發(fā)展態(tài)勢(shì),并對(duì) 2015 年生命科學(xué)論文和生物技術(shù)專(zhuān)利情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析?!?016 中國(guó)生命科學(xué)與生物技術(shù)發(fā)展報(bào)告》分為總論、生命科學(xué)、生物技術(shù)、生物產(chǎn)業(yè)、投融資、文獻(xiàn)專(zhuān)利 6 個(gè)章節(jié),以翔實(shí)的數(shù)據(jù)、豐富的圖表和充實(shí)的內(nèi)容,全面展示了當(dāng)前我國(guó)生命科學(xué)、生物技術(shù)和生物產(chǎn)業(yè)的基本情況。
(本期編輯:安靜)
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